Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G144800.1
Synonym Sb06g022350
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YC04
Pfam -
Panther DB PTHR34657 PTHR34657:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G44060 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g43310.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a010679
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G209800 nodulin, putative, expressed -
2 Sobic.008G002100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein -
3 Sobic.003G173032 - -
4 Sobic.001G527400 - -
5 Sobic.008G023000 expressed protein -
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10 Sobic.002G048250 - -
11 Sobic.004G226300 expressed protein -
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13 Sobic.006G123700 UDP-glucoronosyl/UDP-glucosyl transferase, putative, expressed -
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16 Sobic.004G224300 5-azacytidine resistance protein related, putative, expressed -
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18 Sobic.002G003100 gibberellin 2-beta-dioxygenase 7, putative, expressed K04125: gibberellin 2beta-dioxygenase
19 Sobic.005G156700 laccase precursor protein, putative, expressed -
20 Sobic.010G002850 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G144800 Sobic006G144800 Sobic005G209800 Sobic005G209800 Sobic006G144800--Sobic005G209800 Sobic008G002100 Sobic008G002100 Sobic006G144800--Sobic008G002100 Sobic003G173032 Sobic003G173032 Sobic006G144800--Sobic003G173032 Sobic001G527400 Sobic001G527400 Sobic006G144800--Sobic001G527400 Sobic008G023000 Sobic008G023000 Sobic006G144800--Sobic008G023000 Sobic003G104900 Sobic003G104900 Sobic006G144800--Sobic003G104900 Sobic006G171000 Sobic006G171000 Sobic006G144800--Sobic006G171000 Sobic009G187500 Sobic009G187500 Sobic006G144800--Sobic009G187500 Sobic005G231800 Sobic005G231800 Sobic006G144800--Sobic005G231800 Sobic005G209800--Sobic008G002100 Sobic005G209800--Sobic008G023000 Sobic005G209800--Sobic001G527400 Sobic007G183000 Sobic007G183000 Sobic005G209800--Sobic007G183000 Sobic004G226300 Sobic004G226300 Sobic005G209800--Sobic004G226300 Sobic005G209800--Sobic005G231800 Sobic005G209800--Sobic006G171000 Sobic005G209800--Sobic003G173032 Sobic002G048250 Sobic002G048250 Sobic005G209800--Sobic002G048250 Sobic008G002100--Sobic008G023000 Sobic008G002100--Sobic001G527400 Sobic008G002100--Sobic005G209800 Sobic008G002100--Sobic007G183000 Sobic008G002100--Sobic004G226300 Sobic008G002100--Sobic005G231800 Sobic008G002100--Sobic003G173032 Sobic008G002100--Sobic002G048250 Sobic008G002100--Sobic006G171000 Sobic003G173032--Sobic008G023000 Sobic003G173032--Sobic008G002100 Sobic003G173032--Sobic001G527400 Sobic003G173032--Sobic007G183000 Sobic003G173032--Sobic004G226300 Sobic003G173032--Sobic005G209800 Sobic003G173032--Sobic005G231800 Sobic003G173032--Sobic002G048250 Sobic003G173032--Sobic006G171000 Sobic001G527400--Sobic008G023000 Sobic001G527400--Sobic008G002100 Sobic001G527400--Sobic007G183000 Sobic001G527400--Sobic004G226300 Sobic001G527400--Sobic002G048250 Sobic001G527400--Sobic005G209800 Sobic001G527400--Sobic005G231800 Sobic001G527400--Sobic003G173032 Sobic001G527400--Sobic006G171000 Sobic008G023000--Sobic008G002100 Sobic008G023000--Sobic001G527400 Sobic008G023000--Sobic007G183000 Sobic008G023000--Sobic005G209800 Sobic008G023000--Sobic004G226300 Sobic008G023000--Sobic003G173032 Sobic008G023000--Sobic005G231800 Sobic008G023000--Sobic002G048250 Sobic008G023000--Sobic006G171000 Sobic003G104900--Sobic005G209800 Sobic001G483700 Sobic001G483700 Sobic003G104900--Sobic001G483700 Sobic003G104900--Sobic008G002100 Sobic003G104900--Sobic008G023000 Sobic003G104900--Sobic001G527400 Sobic003G104900--Sobic007G183000 Sobic003G104900--Sobic005G231800 Sobic003G104900--Sobic004G226300 Sobic003G104900--Sobic006G171000 Sobic006G171000--Sobic008G023000 Sobic006G171000--Sobic004G226300 Sobic006G171000--Sobic008G002100 Sobic006G171000--Sobic007G183000 Sobic006G171000--Sobic001G527400 Sobic006G171000--Sobic005G209800 Sobic006G171000--Sobic005G231800 Sobic006G171000--Sobic003G173032 Sobic006G171000--Sobic002G048250 Sobic009G187500--Sobic002G048250 Sobic009G187500--Sobic008G002100 Sobic004G089700 Sobic004G089700 Sobic009G187500--Sobic004G089700 Sobic009G187500--Sobic007G183000 Sobic009G187500--Sobic001G527400 Sobic009G187500--Sobic008G023000 Sobic009G187500--Sobic005G209800 Sobic009G187500--Sobic004G226300 Sobic004G224300 Sobic004G224300 Sobic009G187500--Sobic004G224300 Sobic005G231800--Sobic008G023000 Sobic005G231800--Sobic001G527400 Sobic005G231800--Sobic008G002100 Sobic005G231800--Sobic007G183000 Sobic005G231800--Sobic004G226300 Sobic005G231800--Sobic005G209800 Sobic005G231800--Sobic002G048250 Sobic005G231800--Sobic003G173032 Sobic005G231800--Sobic006G171000
Octagon: transcription factors


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