Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G134650.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RA97
Pfam -
Panther DB PTHR22814 PTHR22814:SF72
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G25855 : Copper transport protein family
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g24310.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G035400 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
2 Sobic.009G200750 - -
3 Sobic.001G369401 - -
4 Sobic.006G196800 OsFBX177 - F-box domain containing protein, expressed -
5 Sobic.006G089601 - -
6 Sobic.010G165925 - -
7 Sobic.007G003250 - -
8 Sobic.010G263151 - -
9 Sobic.002G142550 - -
10 Sobic.001G369701 - -
11 Sobic.005G107250 - -
12 Sobic.003G344950 - -
13 Sobic.003G188700 expressed protein -
14 Sobic.003G419100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@MSP domain containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.001G209000 secretory protein, putative, expressed -
16 Sobic.006G007700 CAS1 domain-containing protein 1 precursor, putative, expressed -
17 Sobic.007G203600 transferase family protein, putative, expressed -
18 Sobic.001G101650 - -
19 Sobic.003G333300 no apical meristem protein, putative, expressed -
20 Sobic.003G025500 ZOS8-02 - C2H2 zinc finger protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G134650 Sobic007G134650 Sobic005G035400 Sobic005G035400 Sobic007G134650--Sobic005G035400 Sobic009G200750 Sobic009G200750 Sobic007G134650--Sobic009G200750 Sobic001G369401 Sobic001G369401 Sobic007G134650--Sobic001G369401 Sobic006G196800 Sobic006G196800 Sobic007G134650--Sobic006G196800 Sobic006G089601 Sobic006G089601 Sobic007G134650--Sobic006G089601 Sobic010G165925 Sobic010G165925 Sobic007G134650--Sobic010G165925 Sobic007G003250 Sobic007G003250 Sobic007G134650--Sobic007G003250 Sobic010G263151 Sobic010G263151 Sobic007G134650--Sobic010G263151 Sobic002G142550 Sobic002G142550 Sobic007G134650--Sobic002G142550 Sobic005G035400--Sobic010G165925 Sobic005G035400--Sobic010G263151 Sobic005G035400--Sobic006G196800 Sobic005G035400--Sobic007G003250 Sobic001G369701 Sobic001G369701 Sobic005G035400--Sobic001G369701 Sobic003G188700 Sobic003G188700 Sobic005G035400--Sobic003G188700 Sobic005G035400--Sobic002G142550 Sobic005G107250 Sobic005G107250 Sobic005G035400--Sobic005G107250 Sobic006G007700 Sobic006G007700 Sobic005G035400--Sobic006G007700 Sobic009G200750--Sobic002G142550 Sobic009G200750--Sobic010G165925 Sobic009G200750--Sobic005G107250 Sobic009G200750--Sobic007G003250 Sobic009G200750--Sobic001G369701 Sobic010G180300 Sobic010G180300 Sobic009G200750--Sobic010G180300 Sobic001G115200 Sobic001G115200 Sobic009G200750--Sobic001G115200 Sobic005G019650 Sobic005G019650 Sobic009G200750--Sobic005G019650 Sobic003G025500 Sobic003G025500 Sobic009G200750--Sobic003G025500 Sobic003G042000 Sobic003G042000 Sobic001G369401--Sobic003G042000 Sobic007G082700 Sobic007G082700 Sobic001G369401--Sobic007G082700 Sobic001G369401--Sobic005G035400 Sobic003G344950 Sobic003G344950 Sobic001G369401--Sobic003G344950 Sobic009G172300 Sobic009G172300 Sobic001G369401--Sobic009G172300 Sobic004G311550 Sobic004G311550 Sobic001G369401--Sobic004G311550 Sobic004G056350 Sobic004G056350 Sobic001G369401--Sobic004G056350 Sobic006G257250 Sobic006G257250 Sobic001G369401--Sobic006G257250 Sobic009G034250 Sobic009G034250 Sobic001G369401--Sobic009G034250 Sobic006G196800--Sobic010G263151 Sobic006G196800--Sobic010G165925 Sobic006G196800--Sobic007G003250 Sobic006G196800--Sobic001G369701 Sobic006G196800--Sobic003G188700 Sobic003G267400 Sobic003G267400 Sobic006G196800--Sobic003G267400 Sobic006G196800--Sobic006G007700 Sobic003G419100 Sobic003G419100 Sobic006G196800--Sobic003G419100 Sobic006G196800--Sobic002G142550 Sobic006G089601--Sobic010G263151 Sobic006G089601--Sobic006G196800 Sobic007G191150 Sobic007G191150 Sobic006G089601--Sobic007G191150 Sobic006G089601--Sobic003G419100 Sobic001G209000 Sobic001G209000 Sobic006G089601--Sobic001G209000 Sobic006G089601--Sobic003G267400 Sobic006G089601--Sobic010G165925 Sobic006G089601--Sobic003G188700 Sobic001G101650 Sobic001G101650 Sobic006G089601--Sobic001G101650 Sobic010G165925--Sobic007G003250 Sobic010G165925--Sobic001G369701 Sobic010G165925--Sobic005G107250 Sobic010G165925--Sobic002G142550 Sobic010G165925--Sobic006G196800 Sobic010G165925--Sobic003G025500 Sobic010G165925--Sobic001G115200 Sobic010G165925--Sobic010G180300 Sobic010G165925--Sobic010G263151 Sobic007G003250--Sobic010G165925 Sobic007G003250--Sobic001G369701 Sobic007G003250--Sobic005G107250 Sobic007G003250--Sobic002G142550 Sobic007G003250--Sobic003G025500 Sobic007G003250--Sobic006G196800 Sobic007G003250--Sobic001G115200 Sobic007G003250--Sobic010G180300 Sobic007G003250--Sobic010G263151 Sobic010G263151--Sobic006G196800 Sobic010G263151--Sobic003G267400 Sobic010G263151--Sobic003G188700 Sobic010G263151--Sobic003G419100 Sobic010G263151--Sobic001G209000 Sobic010G263151--Sobic010G165925 Sobic010G263151--Sobic006G007700 Sobic001G355850 Sobic001G355850 Sobic010G263151--Sobic001G355850 Sobic007G203600 Sobic007G203600 Sobic010G263151--Sobic007G203600 Sobic002G142550--Sobic005G107250 Sobic002G142550--Sobic010G165925 Sobic002G142550--Sobic001G369701 Sobic002G142550--Sobic007G003250 Sobic002G142550--Sobic010G180300 Sobic002G142550--Sobic001G115200 Sobic002G142550--Sobic005G019650 Sobic002G142550--Sobic003G025500 Sobic010G236950 Sobic010G236950 Sobic002G142550--Sobic010G236950
Octagon: transcription factors


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