Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G168700.1
Synonym Sb07g024145
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PIG6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G265000 expressed protein -
2 Sobic.005G210400 OsFBDUF22 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
3 Sobic.009G020300 one zinc finger protein, putative, expressed -
4 Sobic.001G330775 - -
5 Sobic.008G108100 - -
6 Sobic.004G248000 expressed protein -
7 Sobic.009G115800 REX1 DNA Repair family protein, expressed K10845: TTDA, GTF2H5, TFIIH basal transcription factor complex TTD-A subunit
8 Sobic.001G437050 - -
9 Sobic.004G313000 leucine rich repeat containing protein, expressed -
10 Sobic.003G261766 - -
11 Sobic.006G159500 serpin domain containing protein, putative, expressed K13963: serpin B
12 Sobic.005G162200 cytochrome P450, putative, expressed K05917: sterol 14alpha-demethylase
13 Sobic.001G377400 expressed protein -
14 Sobic.003G267150 - -
15 Sobic.002G160500 - K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
16 Sobic.002G160500 - K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
17 Sobic.002G160500 - K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
18 Sobic.002G160500 - K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
19 Sobic.002G160500 - K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
20 Sobic.004G262550 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G168700 Sobic007G168700 Sobic001G265000 Sobic001G265000 Sobic007G168700--Sobic001G265000 Sobic005G210400 Sobic005G210400 Sobic007G168700--Sobic005G210400 Sobic009G020300 Sobic009G020300 Sobic007G168700--Sobic009G020300 Sobic001G330775 Sobic001G330775 Sobic007G168700--Sobic001G330775 Sobic008G108100 Sobic008G108100 Sobic007G168700--Sobic008G108100 Sobic004G248000 Sobic004G248000 Sobic007G168700--Sobic004G248000 Sobic009G115800 Sobic009G115800 Sobic007G168700--Sobic009G115800 Sobic001G437050 Sobic001G437050 Sobic007G168700--Sobic001G437050 Sobic004G313000 Sobic004G313000 Sobic007G168700--Sobic004G313000 Sobic002G160500 Sobic002G160500 Sobic001G265000--Sobic002G160500 Sobic004G262550 Sobic004G262550 Sobic001G265000--Sobic004G262550 Sobic003G267150 Sobic003G267150 Sobic001G265000--Sobic003G267150 Sobic005G162200 Sobic005G162200 Sobic001G265000--Sobic005G162200 Sobic001G265000--Sobic008G108100 Sobic004G166600 Sobic004G166600 Sobic005G210400--Sobic004G166600 Sobic005G210400--Sobic001G330775 Sobic007G059150 Sobic007G059150 Sobic005G210400--Sobic007G059150 Sobic009G258800 Sobic009G258800 Sobic005G210400--Sobic009G258800 Sobic001G516400 Sobic001G516400 Sobic005G210400--Sobic001G516400 Sobic009G195100 Sobic009G195100 Sobic005G210400--Sobic009G195100 Sobic005G210400--Sobic007G168700 Sobic003G244850 Sobic003G244850 Sobic005G210400--Sobic003G244850 Sobic005G076700 Sobic005G076700 Sobic005G210400--Sobic005G076700 Sobic001G210600 Sobic001G210600 Sobic009G020300--Sobic001G210600 Sobic003G183100 Sobic003G183100 Sobic009G020300--Sobic003G183100 Sobic008G002201 Sobic008G002201 Sobic009G020300--Sobic008G002201 Sobic001G538350 Sobic001G538350 Sobic009G020300--Sobic001G538350 Sobic007G209900 Sobic007G209900 Sobic009G020300--Sobic007G209900 Sobic009G138401 Sobic009G138401 Sobic009G020300--Sobic009G138401 Sobic010G086100 Sobic010G086100 Sobic009G020300--Sobic010G086100 Sobic008G183600 Sobic008G183600 Sobic009G020300--Sobic008G183600 Sobic001G155100 Sobic001G155100 Sobic009G020300--Sobic001G155100 Sobic001G330775--Sobic005G210400 Sobic001G330775--Sobic001G437050 Sobic001G330775--Sobic004G166600 Sobic007G195900 Sobic007G195900 Sobic001G330775--Sobic007G195900 Sobic003G370800 Sobic003G370800 Sobic001G330775--Sobic003G370800 Sobic001G330775--Sobic009G020300 Sobic010G037701 Sobic010G037701 Sobic001G330775--Sobic010G037701 Sobic010G003800 Sobic010G003800 Sobic001G330775--Sobic010G003800 Sobic001G330775--Sobic007G168700 Sobic008G108100--Sobic003G267150 Sobic008G108100--Sobic009G115800 Sobic008G108100--Sobic002G160500 Sobic008G108100--Sobic004G313000 Sobic008G108100--Sobic004G262550 Sobic004G248000--Sobic002G160500 Sobic004G248000--Sobic004G313000 Sobic004G248000--Sobic003G267150 Sobic004G248000--Sobic004G262550 Sobic002G319900 Sobic002G319900 Sobic004G248000--Sobic002G319900 Sobic003G261766 Sobic003G261766 Sobic009G115800--Sobic003G261766 Sobic006G159500 Sobic006G159500 Sobic009G115800--Sobic006G159500 Sobic005G216833 Sobic005G216833 Sobic009G115800--Sobic005G216833 Sobic009G115800--Sobic008G108100 Sobic005G041150 Sobic005G041150 Sobic009G115800--Sobic005G041150 Sobic009G115800--Sobic004G313000 Sobic009G115800--Sobic003G267150 Sobic009G115800--Sobic002G319900 Sobic009G115800--Sobic002G160500 Sobic001G437050--Sobic010G003800 Sobic001G112550 Sobic001G112550 Sobic001G437050--Sobic001G112550 Sobic001G437050--Sobic001G330775 Sobic003G148950 Sobic003G148950 Sobic001G437050--Sobic003G148950 Sobic007G132300 Sobic007G132300 Sobic001G437050--Sobic007G132300 Sobic002G018800 Sobic002G018800 Sobic001G437050--Sobic002G018800 Sobic003G331750 Sobic003G331750 Sobic001G437050--Sobic003G331750 Sobic007G050750 Sobic007G050750 Sobic001G437050--Sobic007G050750 Sobic001G334800 Sobic001G334800 Sobic001G437050--Sobic001G334800 Sobic004G313000--Sobic003G267150 Sobic004G313000--Sobic002G160500 Sobic004G313000--Sobic004G262550 Sobic009G091940 Sobic009G091940 Sobic004G313000--Sobic009G091940 Sobic003G389150 Sobic003G389150 Sobic004G313000--Sobic003G389150
Octagon: transcription factors


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