Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G020300.1
Synonym
Functional annotation one zinc finger protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6P6C1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g54930.1 : one zinc finger protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G210600 RIPER3 - Ripening-related family protein precursor, putative, expressed -
2 Sobic.003G183100 OsFBO6 - F-box and other domain containing protein, expressed -
3 Sobic.008G002201 - -
4 Sobic.001G538350 - -
5 Sobic.007G209900 potassium transporter, putative, expressed K03549: KUP system potassium uptake protein
6 Sobic.009G138401 - -
7 Sobic.010G086100 SKIP/SNW domain containing protein, expressed K06063: SNW1, SKIIP, SNW domain-containing protein 1
8 Sobic.008G183600 - -
9 Sobic.001G155100 cyclic nucleotide-gated ion channel, putative, expressed K05391: cyclic nucleotide gated channel, plant
10 Sobic.001G330775 - -
11 Sobic.007G168700 - -
12 Sobic.005G210400 OsFBDUF22 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
13 Sobic.003G391000 lipase, putative, expressed -
14 Sobic.005G220680 - -
15 Sobic.001G457500 - -
16 Sobic.010G030500 - -
17 Sobic.003G066300 expressed protein -
18 Sobic.004G168150 - -
19 Sobic.010G217700 clathrin assembly protein, putative, expressed -
20 Sobic.004G348000 white-brown complex homolog protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G020300 Sobic009G020300 Sobic001G210600 Sobic001G210600 Sobic009G020300--Sobic001G210600 Sobic003G183100 Sobic003G183100 Sobic009G020300--Sobic003G183100 Sobic008G002201 Sobic008G002201 Sobic009G020300--Sobic008G002201 Sobic001G538350 Sobic001G538350 Sobic009G020300--Sobic001G538350 Sobic007G209900 Sobic007G209900 Sobic009G020300--Sobic007G209900 Sobic009G138401 Sobic009G138401 Sobic009G020300--Sobic009G138401 Sobic010G086100 Sobic010G086100 Sobic009G020300--Sobic010G086100 Sobic008G183600 Sobic008G183600 Sobic009G020300--Sobic008G183600 Sobic001G155100 Sobic001G155100 Sobic009G020300--Sobic001G155100 Sobic001G210600--Sobic008G002201 Sobic001G210600--Sobic003G183100 Sobic001G210600--Sobic009G020300 Sobic001G210600--Sobic001G538350 Sobic001G210600--Sobic001G155100 Sobic005G220680 Sobic005G220680 Sobic001G210600--Sobic005G220680 Sobic001G210600--Sobic007G209900 Sobic010G030500 Sobic010G030500 Sobic001G210600--Sobic010G030500 Sobic004G168150 Sobic004G168150 Sobic001G210600--Sobic004G168150 Sobic003G183100--Sobic001G210600 Sobic003G183100--Sobic008G002201 Sobic003G183100--Sobic009G020300 Sobic003G183100--Sobic001G538350 Sobic003G183100--Sobic001G155100 Sobic003G183100--Sobic005G220680 Sobic003G183100--Sobic009G138401 Sobic003G183100--Sobic010G030500 Sobic001G370200 Sobic001G370200 Sobic003G183100--Sobic001G370200 Sobic008G002201--Sobic001G210600 Sobic008G002201--Sobic001G155100 Sobic008G002201--Sobic003G183100 Sobic008G002201--Sobic005G220680 Sobic008G002201--Sobic010G030500 Sobic008G002201--Sobic004G168150 Sobic008G002201--Sobic001G370200 Sobic007G195000 Sobic007G195000 Sobic008G002201--Sobic007G195000 Sobic008G002201--Sobic001G538350 Sobic001G538350--Sobic008G002201 Sobic001G538350--Sobic001G210600 Sobic001G538350--Sobic003G183100 Sobic001G135700 Sobic001G135700 Sobic001G538350--Sobic001G135700 Sobic001G538350--Sobic005G220680 Sobic001G538350--Sobic001G155100 Sobic001G457500 Sobic001G457500 Sobic001G538350--Sobic001G457500 Sobic007G063800 Sobic007G063800 Sobic001G538350--Sobic007G063800 Sobic001G506400 Sobic001G506400 Sobic001G538350--Sobic001G506400 Sobic007G112832 Sobic007G112832 Sobic007G209900--Sobic007G112832 Sobic003G066300 Sobic003G066300 Sobic007G209900--Sobic003G066300 Sobic001G196400 Sobic001G196400 Sobic007G209900--Sobic001G196400 Sobic006G232700 Sobic006G232700 Sobic007G209900--Sobic006G232700 Sobic001G435300 Sobic001G435300 Sobic007G209900--Sobic001G435300 Sobic001G386900 Sobic001G386900 Sobic007G209900--Sobic001G386900 Sobic003G391000 Sobic003G391000 Sobic007G209900--Sobic003G391000 Sobic004G277900 Sobic004G277900 Sobic007G209900--Sobic004G277900 Sobic007G209900--Sobic005G220680 Sobic009G138401--Sobic001G210600 Sobic009G138401--Sobic008G002201 Sobic003G356800 Sobic003G356800 Sobic009G138401--Sobic003G356800 Sobic009G138401--Sobic001G457500 Sobic010G064200 Sobic010G064200 Sobic009G138401--Sobic010G064200 Sobic010G263700 Sobic010G263700 Sobic009G138401--Sobic010G263700 Sobic009G138401--Sobic003G183100 Sobic009G138401--Sobic007G209900 Sobic009G246600 Sobic009G246600 Sobic009G138401--Sobic009G246600 Sobic002G027901 Sobic002G027901 Sobic010G086100--Sobic002G027901 Sobic001G407300 Sobic001G407300 Sobic010G086100--Sobic001G407300 Sobic006G230000 Sobic006G230000 Sobic010G086100--Sobic006G230000 Sobic003G211000 Sobic003G211000 Sobic010G086100--Sobic003G211000 Sobic010G261900 Sobic010G261900 Sobic010G086100--Sobic010G261900 Sobic001G186700 Sobic001G186700 Sobic010G086100--Sobic001G186700 Sobic004G048900 Sobic004G048900 Sobic010G086100--Sobic004G048900 Sobic009G030001 Sobic009G030001 Sobic010G086100--Sobic009G030001 Sobic004G281500 Sobic004G281500 Sobic010G086100--Sobic004G281500 Sobic008G183600--Sobic003G391000 Sobic008G183600--Sobic007G209900 Sobic010G217700 Sobic010G217700 Sobic008G183600--Sobic010G217700 Sobic008G183600--Sobic004G168150 Sobic004G348000 Sobic004G348000 Sobic008G183600--Sobic004G348000 Sobic008G183600--Sobic003G066300 Sobic004G059200 Sobic004G059200 Sobic008G183600--Sobic004G059200 Sobic009G125100 Sobic009G125100 Sobic008G183600--Sobic009G125100 Sobic004G128700 Sobic004G128700 Sobic008G183600--Sobic004G128700 Sobic001G155100--Sobic005G220680 Sobic001G155100--Sobic007G195000 Sobic003G343300 Sobic003G343300 Sobic001G155100--Sobic003G343300 Sobic001G155100--Sobic004G168150 Sobic006G062100 Sobic006G062100 Sobic001G155100--Sobic006G062100 Sobic001G188100 Sobic001G188100 Sobic001G155100--Sobic001G188100 Sobic003G243300 Sobic003G243300 Sobic001G155100--Sobic003G243300 Sobic003G208900 Sobic003G208900 Sobic001G155100--Sobic003G208900 Sobic004G160000 Sobic004G160000 Sobic001G155100--Sobic004G160000
Octagon: transcription factors


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