Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G183100.1
Synonym
Functional annotation OsFBO6 - F-box and other domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6Q445
Pfam -
Panther DB PTHR23272 PTHR23272:SF52
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g36790.1 : OsFBO6 - F-box and other domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G210600 RIPER3 - Ripening-related family protein precursor, putative, expressed -
2 Sobic.008G002201 - -
3 Sobic.009G020300 one zinc finger protein, putative, expressed -
4 Sobic.001G538350 - -
5 Sobic.001G155100 cyclic nucleotide-gated ion channel, putative, expressed K05391: cyclic nucleotide gated channel, plant
6 Sobic.005G220680 - -
7 Sobic.009G138401 - -
8 Sobic.010G030500 - -
9 Sobic.001G370200 - -
10 Sobic.007G209900 potassium transporter, putative, expressed K03549: KUP system potassium uptake protein
11 Sobic.004G168150 - -
12 Sobic.007G195000 cystathionin beta synthase protein, putative, expressed -
13 Sobic.001G457500 - -
14 Sobic.005G220250 - -
15 Sobic.002G015700 OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
16 Sobic.006G232700 BTBN12 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with non-phototropic hypocotyl 3 NPH3 and coiled-coil domains, expressed -
17 Sobic.008G165401 - -
18 Sobic.006G162500 - -
19 Sobic.003G343300 - -
20 Sobic.004G277900 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G183100 Sobic003G183100 Sobic001G210600 Sobic001G210600 Sobic003G183100--Sobic001G210600 Sobic008G002201 Sobic008G002201 Sobic003G183100--Sobic008G002201 Sobic009G020300 Sobic009G020300 Sobic003G183100--Sobic009G020300 Sobic001G538350 Sobic001G538350 Sobic003G183100--Sobic001G538350 Sobic001G155100 Sobic001G155100 Sobic003G183100--Sobic001G155100 Sobic005G220680 Sobic005G220680 Sobic003G183100--Sobic005G220680 Sobic009G138401 Sobic009G138401 Sobic003G183100--Sobic009G138401 Sobic010G030500 Sobic010G030500 Sobic003G183100--Sobic010G030500 Sobic001G370200 Sobic001G370200 Sobic003G183100--Sobic001G370200 Sobic001G210600--Sobic008G002201 Sobic001G210600--Sobic003G183100 Sobic001G210600--Sobic009G020300 Sobic001G210600--Sobic001G538350 Sobic001G210600--Sobic001G155100 Sobic001G210600--Sobic005G220680 Sobic007G209900 Sobic007G209900 Sobic001G210600--Sobic007G209900 Sobic001G210600--Sobic010G030500 Sobic004G168150 Sobic004G168150 Sobic001G210600--Sobic004G168150 Sobic008G002201--Sobic001G210600 Sobic008G002201--Sobic001G155100 Sobic008G002201--Sobic003G183100 Sobic008G002201--Sobic005G220680 Sobic008G002201--Sobic010G030500 Sobic008G002201--Sobic004G168150 Sobic008G002201--Sobic001G370200 Sobic007G195000 Sobic007G195000 Sobic008G002201--Sobic007G195000 Sobic008G002201--Sobic001G538350 Sobic009G020300--Sobic001G210600 Sobic009G020300--Sobic003G183100 Sobic009G020300--Sobic008G002201 Sobic009G020300--Sobic001G538350 Sobic009G020300--Sobic007G209900 Sobic009G020300--Sobic009G138401 Sobic010G086100 Sobic010G086100 Sobic009G020300--Sobic010G086100 Sobic008G183600 Sobic008G183600 Sobic009G020300--Sobic008G183600 Sobic009G020300--Sobic001G155100 Sobic001G538350--Sobic008G002201 Sobic001G538350--Sobic001G210600 Sobic001G538350--Sobic003G183100 Sobic001G135700 Sobic001G135700 Sobic001G538350--Sobic001G135700 Sobic001G538350--Sobic005G220680 Sobic001G538350--Sobic001G155100 Sobic001G457500 Sobic001G457500 Sobic001G538350--Sobic001G457500 Sobic007G063800 Sobic007G063800 Sobic001G538350--Sobic007G063800 Sobic001G506400 Sobic001G506400 Sobic001G538350--Sobic001G506400 Sobic001G155100--Sobic005G220680 Sobic001G155100--Sobic007G195000 Sobic003G343300 Sobic003G343300 Sobic001G155100--Sobic003G343300 Sobic001G155100--Sobic004G168150 Sobic006G062100 Sobic006G062100 Sobic001G155100--Sobic006G062100 Sobic001G188100 Sobic001G188100 Sobic001G155100--Sobic001G188100 Sobic003G243300 Sobic003G243300 Sobic001G155100--Sobic003G243300 Sobic003G208900 Sobic003G208900 Sobic001G155100--Sobic003G208900 Sobic004G160000 Sobic004G160000 Sobic001G155100--Sobic004G160000 Sobic005G220680--Sobic001G155100 Sobic007G145500 Sobic007G145500 Sobic005G220680--Sobic007G145500 Sobic005G220680--Sobic001G188100 Sobic006G282100 Sobic006G282100 Sobic005G220680--Sobic006G282100 Sobic004G062300 Sobic004G062300 Sobic005G220680--Sobic004G062300 Sobic010G177200 Sobic010G177200 Sobic005G220680--Sobic010G177200 Sobic005G220680--Sobic007G195000 Sobic010G216100 Sobic010G216100 Sobic005G220680--Sobic010G216100 Sobic001G287400 Sobic001G287400 Sobic005G220680--Sobic001G287400 Sobic009G138401--Sobic001G210600 Sobic009G138401--Sobic008G002201 Sobic003G356800 Sobic003G356800 Sobic009G138401--Sobic003G356800 Sobic009G138401--Sobic001G457500 Sobic010G064200 Sobic010G064200 Sobic009G138401--Sobic010G064200 Sobic010G263700 Sobic010G263700 Sobic009G138401--Sobic010G263700 Sobic009G138401--Sobic003G183100 Sobic009G138401--Sobic007G209900 Sobic009G246600 Sobic009G246600 Sobic009G138401--Sobic009G246600 Sobic006G232700 Sobic006G232700 Sobic010G030500--Sobic006G232700 Sobic010G030500--Sobic003G208900 Sobic005G039000 Sobic005G039000 Sobic010G030500--Sobic005G039000 Sobic001G196400 Sobic001G196400 Sobic010G030500--Sobic001G196400 Sobic003G305500 Sobic003G305500 Sobic010G030500--Sobic003G305500 Sobic003G317000 Sobic003G317000 Sobic010G030500--Sobic003G317000 Sobic010G030500--Sobic001G155100 Sobic010G030500--Sobic004G168150 Sobic007G185801 Sobic007G185801 Sobic010G030500--Sobic007G185801 Sobic001G370200--Sobic010G030500 Sobic005G147900 Sobic005G147900 Sobic001G370200--Sobic005G147900 Sobic001G129150 Sobic001G129150 Sobic001G370200--Sobic001G129150 Sobic006G016800 Sobic006G016800 Sobic001G370200--Sobic006G016800 Sobic008G052800 Sobic008G052800 Sobic001G370200--Sobic008G052800 Sobic005G049900 Sobic005G049900 Sobic001G370200--Sobic005G049900 Sobic001G370200--Sobic006G232700 Sobic002G261400 Sobic002G261400 Sobic001G370200--Sobic002G261400 Sobic001G370200--Sobic007G185801
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.