Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G538350.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5SBX4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G002201 - -
2 Sobic.001G210600 RIPER3 - Ripening-related family protein precursor, putative, expressed -
3 Sobic.003G183100 OsFBO6 - F-box and other domain containing protein, expressed -
4 Sobic.001G135700 - -
5 Sobic.005G220680 - -
6 Sobic.001G155100 cyclic nucleotide-gated ion channel, putative, expressed K05391: cyclic nucleotide gated channel, plant
7 Sobic.001G457500 - -
8 Sobic.007G063800 - -
9 Sobic.001G506400 expressed protein -
10 Sobic.009G020300 one zinc finger protein, putative, expressed -
11 Sobic.010G038300 OsFBDUF33 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
12 Sobic.010G030500 - -
13 Sobic.004G168150 - -
14 Sobic.007G127800 expressed protein -
15 Sobic.008G082000 RWP-RK domain-containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.004G168900 elongation factor Tu family protein, putative, expressed K14536: ribosome assembly protein 1
17 Sobic.004G250800 pre-mRNA-processing factor 31, putative, expressed K12844: U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein PRP31
18 Sobic.004G014500 THION20 - Plant thionin family protein precursor, putative, expressed -
19 Sobic.010G058300 expressed protein -
20 Sobic.007G209900 potassium transporter, putative, expressed K03549: KUP system potassium uptake protein


Gene co-expression network
sample Sobic001G538350 Sobic001G538350 Sobic008G002201 Sobic008G002201 Sobic001G538350--Sobic008G002201 Sobic001G210600 Sobic001G210600 Sobic001G538350--Sobic001G210600 Sobic003G183100 Sobic003G183100 Sobic001G538350--Sobic003G183100 Sobic001G135700 Sobic001G135700 Sobic001G538350--Sobic001G135700 Sobic005G220680 Sobic005G220680 Sobic001G538350--Sobic005G220680 Sobic001G155100 Sobic001G155100 Sobic001G538350--Sobic001G155100 Sobic001G457500 Sobic001G457500 Sobic001G538350--Sobic001G457500 Sobic007G063800 Sobic007G063800 Sobic001G538350--Sobic007G063800 Sobic001G506400 Sobic001G506400 Sobic001G538350--Sobic001G506400 Sobic008G002201--Sobic001G210600 Sobic008G002201--Sobic001G155100 Sobic008G002201--Sobic003G183100 Sobic008G002201--Sobic005G220680 Sobic010G030500 Sobic010G030500 Sobic008G002201--Sobic010G030500 Sobic004G168150 Sobic004G168150 Sobic008G002201--Sobic004G168150 Sobic001G370200 Sobic001G370200 Sobic008G002201--Sobic001G370200 Sobic007G195000 Sobic007G195000 Sobic008G002201--Sobic007G195000 Sobic008G002201--Sobic001G538350 Sobic001G210600--Sobic008G002201 Sobic001G210600--Sobic003G183100 Sobic009G020300 Sobic009G020300 Sobic001G210600--Sobic009G020300 Sobic001G210600--Sobic001G538350 Sobic001G210600--Sobic001G155100 Sobic001G210600--Sobic005G220680 Sobic007G209900 Sobic007G209900 Sobic001G210600--Sobic007G209900 Sobic001G210600--Sobic010G030500 Sobic001G210600--Sobic004G168150 Sobic003G183100--Sobic001G210600 Sobic003G183100--Sobic008G002201 Sobic003G183100--Sobic009G020300 Sobic003G183100--Sobic001G538350 Sobic003G183100--Sobic001G155100 Sobic003G183100--Sobic005G220680 Sobic009G138401 Sobic009G138401 Sobic003G183100--Sobic009G138401 Sobic003G183100--Sobic010G030500 Sobic003G183100--Sobic001G370200 Sobic004G062200 Sobic004G062200 Sobic001G135700--Sobic004G062200 Sobic001G135700--Sobic007G063800 Sobic004G250800 Sobic004G250800 Sobic001G135700--Sobic004G250800 Sobic002G299500 Sobic002G299500 Sobic001G135700--Sobic002G299500 Sobic001G135800 Sobic001G135800 Sobic001G135700--Sobic001G135800 Sobic006G171600 Sobic006G171600 Sobic001G135700--Sobic006G171600 Sobic008G007600 Sobic008G007600 Sobic001G135700--Sobic008G007600 Sobic010G058300 Sobic010G058300 Sobic001G135700--Sobic010G058300 Sobic010G038300 Sobic010G038300 Sobic001G135700--Sobic010G038300 Sobic005G220680--Sobic001G155100 Sobic007G145500 Sobic007G145500 Sobic005G220680--Sobic007G145500 Sobic001G188100 Sobic001G188100 Sobic005G220680--Sobic001G188100 Sobic006G282100 Sobic006G282100 Sobic005G220680--Sobic006G282100 Sobic004G062300 Sobic004G062300 Sobic005G220680--Sobic004G062300 Sobic010G177200 Sobic010G177200 Sobic005G220680--Sobic010G177200 Sobic005G220680--Sobic007G195000 Sobic010G216100 Sobic010G216100 Sobic005G220680--Sobic010G216100 Sobic001G287400 Sobic001G287400 Sobic005G220680--Sobic001G287400 Sobic001G155100--Sobic005G220680 Sobic001G155100--Sobic007G195000 Sobic003G343300 Sobic003G343300 Sobic001G155100--Sobic003G343300 Sobic001G155100--Sobic004G168150 Sobic006G062100 Sobic006G062100 Sobic001G155100--Sobic006G062100 Sobic001G155100--Sobic001G188100 Sobic003G243300 Sobic003G243300 Sobic001G155100--Sobic003G243300 Sobic003G208900 Sobic003G208900 Sobic001G155100--Sobic003G208900 Sobic004G160000 Sobic004G160000 Sobic001G155100--Sobic004G160000 Sobic001G457500--Sobic001G506400 Sobic008G166100 Sobic008G166100 Sobic001G457500--Sobic008G166100 Sobic001G457500--Sobic008G007600 Sobic004G045632 Sobic004G045632 Sobic001G457500--Sobic004G045632 Sobic003G407700 Sobic003G407700 Sobic001G457500--Sobic003G407700 Sobic004G168900 Sobic004G168900 Sobic001G457500--Sobic004G168900 Sobic003G175350 Sobic003G175350 Sobic001G457500--Sobic003G175350 Sobic003G024100 Sobic003G024100 Sobic001G457500--Sobic003G024100 Sobic003G005700 Sobic003G005700 Sobic001G457500--Sobic003G005700 Sobic007G063800--Sobic010G038300 Sobic005G202901 Sobic005G202901 Sobic007G063800--Sobic005G202901 Sobic010G266600 Sobic010G266600 Sobic007G063800--Sobic010G266600 Sobic006G204500 Sobic006G204500 Sobic007G063800--Sobic006G204500 Sobic004G014200 Sobic004G014200 Sobic007G063800--Sobic004G014200 Sobic006G070032 Sobic006G070032 Sobic007G063800--Sobic006G070032 Sobic002G364700 Sobic002G364700 Sobic007G063800--Sobic002G364700 Sobic007G063800--Sobic008G007600 Sobic008G029800 Sobic008G029800 Sobic007G063800--Sobic008G029800 Sobic007G144100 Sobic007G144100 Sobic001G506400--Sobic007G144100 Sobic003G258100 Sobic003G258100 Sobic001G506400--Sobic003G258100 Sobic001G034200 Sobic001G034200 Sobic001G506400--Sobic001G034200 Sobic004G038400 Sobic004G038400 Sobic001G506400--Sobic004G038400 Sobic001G076600 Sobic001G076600 Sobic001G506400--Sobic001G076600 Sobic007G048900 Sobic007G048900 Sobic001G506400--Sobic007G048900 Sobic003G352900 Sobic003G352900 Sobic001G506400--Sobic003G352900 Sobic001G506400--Sobic004G168900 Sobic001G506400--Sobic010G038300
Octagon: transcription factors


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