Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G038300.1
Synonym Sb10g003400
Functional annotation OsFBDUF33 - F-box and DUF domain containing protein, expressed
UniProt A0A194YH63
Pfam PF03478
Panther DB PTHR33110 PTHR33110:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G04810 : Protein of unknown function (DUF295)
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g05620.1 : OsFBDUF33 - F-box and DUF domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G063800 - -
2 Sobic.005G202901 - -
3 Sobic.004G014200 serpin domain containing protein, putative, expressed K13963: serpin B
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11 Sobic.006G266400 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
12 Sobic.001G402900 methyltransferase domain containing protein, expressed -
13 Sobic.005G037600 - -
14 Sobic.007G016700 OsFBX142 - F-box domain containing protein, expressed -
15 Sobic.004G168900 elongation factor Tu family protein, putative, expressed K14536: ribosome assembly protein 1
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17 Sobic.002G097200 OsFBLD4 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
18 Sobic.001G240700 - -
19 Sobic.002G364700 ZOS7-11 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
20 Sobic.002G189500 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic010G038300 Sobic010G038300 Sobic007G063800 Sobic007G063800 Sobic010G038300--Sobic007G063800 Sobic005G202901 Sobic005G202901 Sobic010G038300--Sobic005G202901 Sobic004G014200 Sobic004G014200 Sobic010G038300--Sobic004G014200 Sobic002G060101 Sobic002G060101 Sobic010G038300--Sobic002G060101 Sobic006G070032 Sobic006G070032 Sobic010G038300--Sobic006G070032 Sobic008G029800 Sobic008G029800 Sobic010G038300--Sobic008G029800 Sobic010G266600 Sobic010G266600 Sobic010G038300--Sobic010G266600 Sobic006G204500 Sobic006G204500 Sobic010G038300--Sobic006G204500 Sobic008G020800 Sobic008G020800 Sobic010G038300--Sobic008G020800 Sobic007G063800--Sobic010G038300 Sobic007G063800--Sobic005G202901 Sobic007G063800--Sobic010G266600 Sobic007G063800--Sobic006G204500 Sobic007G063800--Sobic004G014200 Sobic007G063800--Sobic006G070032 Sobic002G364700 Sobic002G364700 Sobic007G063800--Sobic002G364700 Sobic008G007600 Sobic008G007600 Sobic007G063800--Sobic008G007600 Sobic007G063800--Sobic008G029800 Sobic005G202901--Sobic006G070032 Sobic005G202901--Sobic004G014200 Sobic005G202901--Sobic010G038300 Sobic005G202901--Sobic008G020800 Sobic004G052600 Sobic004G052600 Sobic005G202901--Sobic004G052600 Sobic005G202901--Sobic008G029800 Sobic001G240700 Sobic001G240700 Sobic005G202901--Sobic001G240700 Sobic007G016700 Sobic007G016700 Sobic005G202901--Sobic007G016700 Sobic007G198900 Sobic007G198900 Sobic005G202901--Sobic007G198900 Sobic004G014200--Sobic007G016700 Sobic004G014200--Sobic008G020800 Sobic001G402900 Sobic001G402900 Sobic004G014200--Sobic001G402900 Sobic004G014200--Sobic006G070032 Sobic010G098932 Sobic010G098932 Sobic004G014200--Sobic010G098932 Sobic002G015900 Sobic002G015900 Sobic004G014200--Sobic002G015900 Sobic001G063300 Sobic001G063300 Sobic004G014200--Sobic001G063300 Sobic002G194300 Sobic002G194300 Sobic004G014200--Sobic002G194300 Sobic003G351100 Sobic003G351100 Sobic004G014200--Sobic003G351100 Sobic005G037600 Sobic005G037600 Sobic002G060101--Sobic005G037600 Sobic006G266400 Sobic006G266400 Sobic002G060101--Sobic006G266400 Sobic002G333001 Sobic002G333001 Sobic002G060101--Sobic002G333001 Sobic003G070400 Sobic003G070400 Sobic002G060101--Sobic003G070400 Sobic009G068400 Sobic009G068400 Sobic002G060101--Sobic009G068400 Sobic007G081100 Sobic007G081100 Sobic002G060101--Sobic007G081100 Sobic002G060101--Sobic002G015900 Sobic002G101600 Sobic002G101600 Sobic002G060101--Sobic002G101600 Sobic005G140900 Sobic005G140900 Sobic002G060101--Sobic005G140900 Sobic002G156400 Sobic002G156400 Sobic006G070032--Sobic002G156400 Sobic008G138400 Sobic008G138400 Sobic006G070032--Sobic008G138400 Sobic006G070032--Sobic008G020800 Sobic002G097300 Sobic002G097300 Sobic006G070032--Sobic002G097300 Sobic005G189100 Sobic005G189100 Sobic006G070032--Sobic005G189100 Sobic006G070032--Sobic001G240700 Sobic006G070032--Sobic005G140900 Sobic001G089300 Sobic001G089300 Sobic006G070032--Sobic001G089300 Sobic002G006200 Sobic002G006200 Sobic006G070032--Sobic002G006200 Sobic009G060100 Sobic009G060100 Sobic008G029800--Sobic009G060100 Sobic008G029800--Sobic006G070032 Sobic002G070100 Sobic002G070100 Sobic008G029800--Sobic002G070100 Sobic006G017900 Sobic006G017900 Sobic008G029800--Sobic006G017900 Sobic007G082100 Sobic007G082100 Sobic008G029800--Sobic007G082100 Sobic004G046700 Sobic004G046700 Sobic008G029800--Sobic004G046700 Sobic001G211700 Sobic001G211700 Sobic008G029800--Sobic001G211700 Sobic010G123800 Sobic010G123800 Sobic008G029800--Sobic010G123800 Sobic006G017700 Sobic006G017700 Sobic008G029800--Sobic006G017700 Sobic002G307400 Sobic002G307400 Sobic010G266600--Sobic002G307400 Sobic005G221675 Sobic005G221675 Sobic010G266600--Sobic005G221675 Sobic004G100300 Sobic004G100300 Sobic010G266600--Sobic004G100300 Sobic010G266600--Sobic006G070032 Sobic010G266600--Sobic008G029800 Sobic002G384900 Sobic002G384900 Sobic010G266600--Sobic002G384900 Sobic006G200300 Sobic006G200300 Sobic010G266600--Sobic006G200300 Sobic007G081800 Sobic007G081800 Sobic010G266600--Sobic007G081800 Sobic010G266600--Sobic007G198900 Sobic009G061601 Sobic009G061601 Sobic006G204500--Sobic009G061601 Sobic004G273600 Sobic004G273600 Sobic006G204500--Sobic004G273600 Sobic006G204500--Sobic008G020800 Sobic006G204500--Sobic001G402900 Sobic010G003200 Sobic010G003200 Sobic006G204500--Sobic010G003200 Sobic002G372000 Sobic002G372000 Sobic006G204500--Sobic002G372000 Sobic007G197000 Sobic007G197000 Sobic006G204500--Sobic007G197000 Sobic006G204500--Sobic002G364700 Sobic006G204500--Sobic004G014200 Sobic005G176700 Sobic005G176700 Sobic008G020800--Sobic005G176700 Sobic001G167300 Sobic001G167300 Sobic008G020800--Sobic001G167300 Sobic005G006100 Sobic005G006100 Sobic008G020800--Sobic005G006100 Sobic007G122600 Sobic007G122600 Sobic008G020800--Sobic007G122600 Sobic008G020800--Sobic006G070032 Sobic007G215200 Sobic007G215200 Sobic008G020800--Sobic007G215200 Sobic002G194201 Sobic002G194201 Sobic008G020800--Sobic002G194201 Sobic010G207800 Sobic010G207800 Sobic008G020800--Sobic010G207800 Sobic008G020800--Sobic002G015900
Octagon: transcription factors


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