Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G127800.1
Synonym Sb07g020410
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YKX7
Pfam PF02042
Panther DB PTHR32002
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G35590 : RWP-RK domain-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g20530.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G014200 serpin domain containing protein, putative, expressed K13963: serpin B
2 Sobic.004G327000 STE_PAK_Ste20_STLK.2 - STE kinases include homologs to sterile 7, sterile 11 and sterile 20 from yeast, expressed K08835: OXSR1, serine/threonine-protein kinase OSR1/STK39
3 Sobic.006G018701 - -
4 Sobic.003G160600 uncharacterized protein At4g06744 precursor, putative, expressed -
5 Sobic.008G153700 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
6 Sobic.009G158300 - -
7 Sobic.007G016700 OsFBX142 - F-box domain containing protein, expressed -
8 Sobic.009G060000 WD40-like domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.001G409000 - -
10 Sobic.001G402900 methyltransferase domain containing protein, expressed -
11 Sobic.007G001800 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
12 Sobic.010G098932 - -
13 Sobic.003G445600 KIP1, putative, expressed -
14 Sobic.009G016900 expressed protein -
15 Sobic.010G026200 Sec1 family transport protein, putative, expressed K15292: STXBP1, syntaxin-binding protein 1
16 Sobic.004G095100 zinc knuckle family protein, expressed K03257: translation initiation factor 4A
17 Sobic.004G308800 expressed protein -
18 Sobic.004G160000 potassium transporter, putative, expressed K03549: KUP system potassium uptake protein
19 Sobic.002G087600 OsFBX231 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.007G161100 ENTH domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G127800 Sobic007G127800 Sobic004G014200 Sobic004G014200 Sobic007G127800--Sobic004G014200 Sobic004G327000 Sobic004G327000 Sobic007G127800--Sobic004G327000 Sobic006G018701 Sobic006G018701 Sobic007G127800--Sobic006G018701 Sobic003G160600 Sobic003G160600 Sobic007G127800--Sobic003G160600 Sobic008G153700 Sobic008G153700 Sobic007G127800--Sobic008G153700 Sobic009G158300 Sobic009G158300 Sobic007G127800--Sobic009G158300 Sobic007G016700 Sobic007G016700 Sobic007G127800--Sobic007G016700 Sobic009G060000 Sobic009G060000 Sobic007G127800--Sobic009G060000 Sobic001G409000 Sobic001G409000 Sobic007G127800--Sobic001G409000 Sobic004G014200--Sobic007G016700 Sobic008G020800 Sobic008G020800 Sobic004G014200--Sobic008G020800 Sobic001G402900 Sobic001G402900 Sobic004G014200--Sobic001G402900 Sobic006G070032 Sobic006G070032 Sobic004G014200--Sobic006G070032 Sobic010G098932 Sobic010G098932 Sobic004G014200--Sobic010G098932 Sobic002G015900 Sobic002G015900 Sobic004G014200--Sobic002G015900 Sobic001G063300 Sobic001G063300 Sobic004G014200--Sobic001G063300 Sobic002G194300 Sobic002G194300 Sobic004G014200--Sobic002G194300 Sobic003G351100 Sobic003G351100 Sobic004G014200--Sobic003G351100 Sobic004G327000--Sobic006G018701 Sobic007G161100 Sobic007G161100 Sobic004G327000--Sobic007G161100 Sobic004G160000 Sobic004G160000 Sobic004G327000--Sobic004G160000 Sobic007G195000 Sobic007G195000 Sobic004G327000--Sobic007G195000 Sobic004G327000--Sobic003G160600 Sobic003G343300 Sobic003G343300 Sobic004G327000--Sobic003G343300 Sobic010G026200 Sobic010G026200 Sobic004G327000--Sobic010G026200 Sobic004G327000--Sobic009G158300 Sobic001G188100 Sobic001G188100 Sobic004G327000--Sobic001G188100 Sobic006G018701--Sobic009G158300 Sobic006G018701--Sobic003G160600 Sobic001G392650 Sobic001G392650 Sobic006G018701--Sobic001G392650 Sobic002G049700 Sobic002G049700 Sobic006G018701--Sobic002G049700 Sobic003G343000 Sobic003G343000 Sobic006G018701--Sobic003G343000 Sobic002G406801 Sobic002G406801 Sobic006G018701--Sobic002G406801 Sobic006G018701--Sobic004G327000 Sobic006G018701--Sobic009G060000 Sobic006G018701--Sobic003G343300 Sobic003G445600 Sobic003G445600 Sobic003G160600--Sobic003G445600 Sobic003G160600--Sobic009G158300 Sobic008G134600 Sobic008G134600 Sobic003G160600--Sobic008G134600 Sobic009G016900 Sobic009G016900 Sobic003G160600--Sobic009G016900 Sobic003G160600--Sobic001G409000 Sobic003G160600--Sobic009G060000 Sobic003G160600--Sobic006G018701 Sobic008G124301 Sobic008G124301 Sobic003G160600--Sobic008G124301 Sobic003G160600--Sobic002G049700 Sobic007G001800 Sobic007G001800 Sobic008G153700--Sobic007G001800 Sobic008G153700--Sobic001G409000 Sobic008G153700--Sobic009G016900 Sobic006G001650 Sobic006G001650 Sobic008G153700--Sobic006G001650 Sobic006G214900 Sobic006G214900 Sobic008G153700--Sobic006G214900 Sobic003G102900 Sobic003G102900 Sobic008G153700--Sobic003G102900 Sobic004G217200 Sobic004G217200 Sobic008G153700--Sobic004G217200 Sobic006G001700 Sobic006G001700 Sobic008G153700--Sobic006G001700 Sobic009G097000 Sobic009G097000 Sobic008G153700--Sobic009G097000 Sobic009G158300--Sobic009G060000 Sobic009G158300--Sobic002G049700 Sobic009G158300--Sobic006G018701 Sobic009G158300--Sobic003G160600 Sobic009G158300--Sobic001G392650 Sobic009G158400 Sobic009G158400 Sobic009G158300--Sobic009G158400 Sobic009G158300--Sobic003G445600 Sobic009G158300--Sobic008G134600 Sobic009G158300--Sobic001G409000 Sobic007G016700--Sobic004G014200 Sobic007G016700--Sobic010G098932 Sobic007G016700--Sobic003G351100 Sobic007G160501 Sobic007G160501 Sobic007G016700--Sobic007G160501 Sobic007G016700--Sobic002G194300 Sobic005G043300 Sobic005G043300 Sobic007G016700--Sobic005G043300 Sobic010G215000 Sobic010G215000 Sobic007G016700--Sobic010G215000 Sobic007G133800 Sobic007G133800 Sobic007G016700--Sobic007G133800 Sobic001G246001 Sobic001G246001 Sobic007G016700--Sobic001G246001 Sobic009G060000--Sobic009G158300 Sobic009G060000--Sobic002G049700 Sobic009G060000--Sobic001G409000 Sobic009G060000--Sobic007G001800 Sobic009G060000--Sobic003G445600 Sobic009G060000--Sobic003G160600 Sobic006G164800 Sobic006G164800 Sobic009G060000--Sobic006G164800 Sobic007G145500 Sobic007G145500 Sobic009G060000--Sobic007G145500 Sobic009G060000--Sobic009G016900 Sobic001G409000--Sobic007G001800 Sobic001G409000--Sobic009G016900 Sobic001G409000--Sobic004G217200 Sobic001G409000--Sobic006G164800 Sobic004G062300 Sobic004G062300 Sobic001G409000--Sobic004G062300 Sobic001G409000--Sobic008G153700 Sobic003G394801 Sobic003G394801 Sobic001G409000--Sobic003G394801 Sobic002G414150 Sobic002G414150 Sobic001G409000--Sobic002G414150 Sobic001G269600 Sobic001G269600 Sobic001G409000--Sobic001G269600
Octagon: transcription factors


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