Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G082000.2,Sobic.008G082000.1
Synonym Sb08g007760
Functional annotation RWP-RK domain-containing protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6PCA4
Pfam PF02042
Panther DB PTHR32002
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G35590 : RWP-RK domain-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g12970.1 : RWP-RK domain-containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a025010
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G063800 - -
2 Sobic.010G038300 OsFBDUF33 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
3 Sobic.007G127800 expressed protein -
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5 Sobic.005G202901 - -
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8 Sobic.001G172100 - -
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10 Sobic.007G016700 OsFBX142 - F-box domain containing protein, expressed -
11 Sobic.002G123300 expressed protein -
12 Sobic.001G402900 methyltransferase domain containing protein, expressed -
13 Sobic.009G242600 ATPCME, putative, expressed K15889: prenylcysteine alpha-carboxyl methylesterase
14 Sobic.006G204500 pectinacetylesterase domain containing protein, expressed -
15 Sobic.006G070032 - K01193: INV, beta-fructofuranosidase
16 Sobic.010G098932 - -
17 Sobic.001G357400 emp24/gp25L/p24 family protein, putative, expressed -
18 Sobic.008G020800 GASR10 - Gibberellin-regulated GASA/GAST/Snakin family protein precursor, expressed -
19 Sobic.004G062200 expressed protein -
20 Sobic.007G196700 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic008G082000 Sobic008G082000 Sobic007G063800 Sobic007G063800 Sobic008G082000--Sobic007G063800 Sobic010G038300 Sobic010G038300 Sobic008G082000--Sobic010G038300 Sobic007G127800 Sobic007G127800 Sobic008G082000--Sobic007G127800 Sobic003G023732 Sobic003G023732 Sobic008G082000--Sobic003G023732 Sobic005G202901 Sobic005G202901 Sobic008G082000--Sobic005G202901 Sobic004G014200 Sobic004G014200 Sobic008G082000--Sobic004G014200 Sobic006G070564 Sobic006G070564 Sobic008G082000--Sobic006G070564 Sobic001G172100 Sobic001G172100 Sobic008G082000--Sobic001G172100 Sobic002G078200 Sobic002G078200 Sobic008G082000--Sobic002G078200 Sobic007G063800--Sobic010G038300 Sobic007G063800--Sobic005G202901 Sobic010G266600 Sobic010G266600 Sobic007G063800--Sobic010G266600 Sobic006G204500 Sobic006G204500 Sobic007G063800--Sobic006G204500 Sobic007G063800--Sobic004G014200 Sobic006G070032 Sobic006G070032 Sobic007G063800--Sobic006G070032 Sobic002G364700 Sobic002G364700 Sobic007G063800--Sobic002G364700 Sobic008G007600 Sobic008G007600 Sobic007G063800--Sobic008G007600 Sobic008G029800 Sobic008G029800 Sobic007G063800--Sobic008G029800 Sobic010G038300--Sobic007G063800 Sobic010G038300--Sobic005G202901 Sobic010G038300--Sobic004G014200 Sobic002G060101 Sobic002G060101 Sobic010G038300--Sobic002G060101 Sobic010G038300--Sobic006G070032 Sobic010G038300--Sobic008G029800 Sobic010G038300--Sobic010G266600 Sobic010G038300--Sobic006G204500 Sobic008G020800 Sobic008G020800 Sobic010G038300--Sobic008G020800 Sobic007G127800--Sobic004G014200 Sobic004G327000 Sobic004G327000 Sobic007G127800--Sobic004G327000 Sobic006G018701 Sobic006G018701 Sobic007G127800--Sobic006G018701 Sobic003G160600 Sobic003G160600 Sobic007G127800--Sobic003G160600 Sobic008G153700 Sobic008G153700 Sobic007G127800--Sobic008G153700 Sobic009G158300 Sobic009G158300 Sobic007G127800--Sobic009G158300 Sobic007G016700 Sobic007G016700 Sobic007G127800--Sobic007G016700 Sobic009G060000 Sobic009G060000 Sobic007G127800--Sobic009G060000 Sobic001G409000 Sobic001G409000 Sobic007G127800--Sobic001G409000 Sobic005G170400 Sobic005G170400 Sobic003G023732--Sobic005G170400 Sobic003G023732--Sobic001G172100 Sobic010G111000 Sobic010G111000 Sobic003G023732--Sobic010G111000 Sobic010G155701 Sobic010G155701 Sobic003G023732--Sobic010G155701 Sobic005G207700 Sobic005G207700 Sobic003G023732--Sobic005G207700 Sobic002G073600 Sobic002G073600 Sobic003G023732--Sobic002G073600 Sobic002G283200 Sobic002G283200 Sobic003G023732--Sobic002G283200 Sobic004G042501 Sobic004G042501 Sobic003G023732--Sobic004G042501 Sobic003G019450 Sobic003G019450 Sobic003G023732--Sobic003G019450 Sobic005G202901--Sobic006G070032 Sobic005G202901--Sobic004G014200 Sobic005G202901--Sobic010G038300 Sobic005G202901--Sobic008G020800 Sobic004G052600 Sobic004G052600 Sobic005G202901--Sobic004G052600 Sobic005G202901--Sobic008G029800 Sobic001G240700 Sobic001G240700 Sobic005G202901--Sobic001G240700 Sobic005G202901--Sobic007G016700 Sobic007G198900 Sobic007G198900 Sobic005G202901--Sobic007G198900 Sobic004G014200--Sobic007G016700 Sobic004G014200--Sobic008G020800 Sobic001G402900 Sobic001G402900 Sobic004G014200--Sobic001G402900 Sobic004G014200--Sobic006G070032 Sobic010G098932 Sobic010G098932 Sobic004G014200--Sobic010G098932 Sobic002G015900 Sobic002G015900 Sobic004G014200--Sobic002G015900 Sobic001G063300 Sobic001G063300 Sobic004G014200--Sobic001G063300 Sobic002G194300 Sobic002G194300 Sobic004G014200--Sobic002G194300 Sobic003G351100 Sobic003G351100 Sobic004G014200--Sobic003G351100 Sobic001G039100 Sobic001G039100 Sobic006G070564--Sobic001G039100 Sobic004G279200 Sobic004G279200 Sobic006G070564--Sobic004G279200 Sobic006G189300 Sobic006G189300 Sobic006G070564--Sobic006G189300 Sobic002G404600 Sobic002G404600 Sobic006G070564--Sobic002G404600 Sobic001G503600 Sobic001G503600 Sobic006G070564--Sobic001G503600 Sobic001G414650 Sobic001G414650 Sobic006G070564--Sobic001G414650 Sobic006G070564--Sobic010G038300 Sobic001G357400 Sobic001G357400 Sobic006G070564--Sobic001G357400 Sobic007G196700 Sobic007G196700 Sobic006G070564--Sobic007G196700 Sobic005G026700 Sobic005G026700 Sobic001G172100--Sobic005G026700 Sobic005G002100 Sobic005G002100 Sobic001G172100--Sobic005G002100 Sobic003G164400 Sobic003G164400 Sobic001G172100--Sobic003G164400 Sobic007G142801 Sobic007G142801 Sobic001G172100--Sobic007G142801 Sobic002G000200 Sobic002G000200 Sobic001G172100--Sobic002G000200 Sobic001G094700 Sobic001G094700 Sobic001G172100--Sobic001G094700 Sobic002G078200--Sobic005G170400 Sobic001G337100 Sobic001G337100 Sobic002G078200--Sobic001G337100 Sobic002G078200--Sobic002G015900 Sobic002G078200--Sobic003G019450 Sobic002G078200--Sobic001G402900 Sobic005G114201 Sobic005G114201 Sobic002G078200--Sobic005G114201 Sobic010G188500 Sobic010G188500 Sobic002G078200--Sobic010G188500 Sobic002G340600 Sobic002G340600 Sobic002G078200--Sobic002G340600 Sobic002G078200--Sobic008G020800
Octagon: transcription factors


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