Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G183600.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PEI7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G391000 lipase, putative, expressed -
2 Sobic.007G209900 potassium transporter, putative, expressed K03549: KUP system potassium uptake protein
3 Sobic.010G217700 clathrin assembly protein, putative, expressed -
4 Sobic.004G168150 - -
5 Sobic.004G348000 white-brown complex homolog protein, putative, expressed -
6 Sobic.003G066300 expressed protein -
7 Sobic.004G059200 inactive receptor kinase At2g26730 precursor, putative, expressed -
8 Sobic.009G125100 pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, putative, expressed K12813: pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16
9 Sobic.004G128700 AGC_PVPK_like_kin82y.5 - ACG kinases include homologs to PKA, PKG and PKC, expressed -
10 Sobic.001G155100 cyclic nucleotide-gated ion channel, putative, expressed K05391: cyclic nucleotide gated channel, plant
11 Sobic.002G254100 expressed protein -
12 Sobic.006G232700 BTBN12 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with non-phototropic hypocotyl 3 NPH3 and coiled-coil domains, expressed -
13 Sobic.010G030500 - -
14 Sobic.001G251000 - -
15 Sobic.005G200100 - -
16 Sobic.003G270900 expressed protein -
17 Sobic.001G196400 transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, putative, expressed -
18 Sobic.005G220680 - -
19 Sobic.007G112832 - -
20 Sobic.005G039000 bifunctional monodehydroascorbate reductase and carbonic anhydrasenectarin-3 precursor, putative, expressed K01674: carbonic anhydrase


Gene co-expression network
sample Sobic008G183600 Sobic008G183600 Sobic003G391000 Sobic003G391000 Sobic008G183600--Sobic003G391000 Sobic007G209900 Sobic007G209900 Sobic008G183600--Sobic007G209900 Sobic010G217700 Sobic010G217700 Sobic008G183600--Sobic010G217700 Sobic004G168150 Sobic004G168150 Sobic008G183600--Sobic004G168150 Sobic004G348000 Sobic004G348000 Sobic008G183600--Sobic004G348000 Sobic003G066300 Sobic003G066300 Sobic008G183600--Sobic003G066300 Sobic004G059200 Sobic004G059200 Sobic008G183600--Sobic004G059200 Sobic009G125100 Sobic009G125100 Sobic008G183600--Sobic009G125100 Sobic004G128700 Sobic004G128700 Sobic008G183600--Sobic004G128700 Sobic005G201501 Sobic005G201501 Sobic003G391000--Sobic005G201501 Sobic003G391000--Sobic007G209900 Sobic005G077001 Sobic005G077001 Sobic003G391000--Sobic005G077001 Sobic003G075300 Sobic003G075300 Sobic003G391000--Sobic003G075300 Sobic007G112832 Sobic007G112832 Sobic003G391000--Sobic007G112832 Sobic004G258000 Sobic004G258000 Sobic003G391000--Sobic004G258000 Sobic009G110333 Sobic009G110333 Sobic003G391000--Sobic009G110333 Sobic003G391000--Sobic004G168150 Sobic002G266500 Sobic002G266500 Sobic003G391000--Sobic002G266500 Sobic007G209900--Sobic007G112832 Sobic007G209900--Sobic003G066300 Sobic001G196400 Sobic001G196400 Sobic007G209900--Sobic001G196400 Sobic006G232700 Sobic006G232700 Sobic007G209900--Sobic006G232700 Sobic001G435300 Sobic001G435300 Sobic007G209900--Sobic001G435300 Sobic001G386900 Sobic001G386900 Sobic007G209900--Sobic001G386900 Sobic007G209900--Sobic003G391000 Sobic004G277900 Sobic004G277900 Sobic007G209900--Sobic004G277900 Sobic005G220680 Sobic005G220680 Sobic007G209900--Sobic005G220680 Sobic007G161100 Sobic007G161100 Sobic010G217700--Sobic007G161100 Sobic010G217700--Sobic001G196400 Sobic010G217700--Sobic004G059200 Sobic003G208900 Sobic003G208900 Sobic010G217700--Sobic003G208900 Sobic004G327000 Sobic004G327000 Sobic010G217700--Sobic004G327000 Sobic010G217700--Sobic004G348000 Sobic010G217700--Sobic006G232700 Sobic003G317000 Sobic003G317000 Sobic010G217700--Sobic003G317000 Sobic005G039000 Sobic005G039000 Sobic010G217700--Sobic005G039000 Sobic010G157900 Sobic010G157900 Sobic004G168150--Sobic010G157900 Sobic004G168150--Sobic003G208900 Sobic001G155100 Sobic001G155100 Sobic004G168150--Sobic001G155100 Sobic007G195000 Sobic007G195000 Sobic004G168150--Sobic007G195000 Sobic003G343300 Sobic003G343300 Sobic004G168150--Sobic003G343300 Sobic002G223650 Sobic002G223650 Sobic004G168150--Sobic002G223650 Sobic003G274100 Sobic003G274100 Sobic004G168150--Sobic003G274100 Sobic004G168150--Sobic005G039000 Sobic003G305500 Sobic003G305500 Sobic004G168150--Sobic003G305500 Sobic004G348000--Sobic004G059200 Sobic001G251000 Sobic001G251000 Sobic004G348000--Sobic001G251000 Sobic004G348000--Sobic009G125100 Sobic004G060400 Sobic004G060400 Sobic004G348000--Sobic004G060400 Sobic004G348000--Sobic007G161100 Sobic009G176200 Sobic009G176200 Sobic004G348000--Sobic009G176200 Sobic005G200100 Sobic005G200100 Sobic004G348000--Sobic005G200100 Sobic004G348000--Sobic005G039000 Sobic004G348000--Sobic001G196400 Sobic003G064100 Sobic003G064100 Sobic003G066300--Sobic003G064100 Sobic003G066300--Sobic007G209900 Sobic003G066300--Sobic001G435300 Sobic003G066300--Sobic003G208900 Sobic003G066300--Sobic007G112832 Sobic004G042800 Sobic004G042800 Sobic003G066300--Sobic004G042800 Sobic009G249400 Sobic009G249400 Sobic003G066300--Sobic009G249400 Sobic004G031900 Sobic004G031900 Sobic003G066300--Sobic004G031900 Sobic003G066300--Sobic001G196400 Sobic004G059200--Sobic007G161100 Sobic010G026200 Sobic010G026200 Sobic004G059200--Sobic010G026200 Sobic004G059200--Sobic004G327000 Sobic004G160000 Sobic004G160000 Sobic004G059200--Sobic004G160000 Sobic006G018701 Sobic006G018701 Sobic004G059200--Sobic006G018701 Sobic002G406801 Sobic002G406801 Sobic004G059200--Sobic002G406801 Sobic006G066050 Sobic006G066050 Sobic004G059200--Sobic006G066050 Sobic009G103650 Sobic009G103650 Sobic004G059200--Sobic009G103650 Sobic009G021000 Sobic009G021000 Sobic004G059200--Sobic009G021000 Sobic009G042800 Sobic009G042800 Sobic009G125100--Sobic009G042800 Sobic009G125100--Sobic004G059200 Sobic009G125100--Sobic009G021000 Sobic009G125100--Sobic004G348000 Sobic009G125100--Sobic006G066050 Sobic002G087600 Sobic002G087600 Sobic009G125100--Sobic002G087600 Sobic009G125100--Sobic007G161100 Sobic001G272100 Sobic001G272100 Sobic009G125100--Sobic001G272100 Sobic002G015200 Sobic002G015200 Sobic009G125100--Sobic002G015200 Sobic005G049200 Sobic005G049200 Sobic004G128700--Sobic005G049200 Sobic006G272400 Sobic006G272400 Sobic004G128700--Sobic006G272400 Sobic009G189700 Sobic009G189700 Sobic004G128700--Sobic009G189700 Sobic001G045400 Sobic001G045400 Sobic004G128700--Sobic001G045400 Sobic004G128700--Sobic004G168150 Sobic005G042900 Sobic005G042900 Sobic004G128700--Sobic005G042900 Sobic004G123100 Sobic004G123100 Sobic004G128700--Sobic004G123100 Sobic005G144000 Sobic005G144000 Sobic004G128700--Sobic005G144000 Sobic002G405300 Sobic002G405300 Sobic004G128700--Sobic002G405300
Octagon: transcription factors


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