Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G185400.1
Synonym Sb07g025530
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YHA2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G159200 - -
2 Sobic.002G120850 - -
3 Sobic.006G274833 - -
4 Sobic.006G024800 - -
5 Sobic.002G037300 ZOS7-02 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
6 Sobic.007G078400 transketolase, chloroplast precursor, putative, expressed -
7 Sobic.003G035266 - -
8 Sobic.003G268650 - -
9 Sobic.005G067000 OsWAK91 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
10 Sobic.003G437900 decarboxylase, putative, expressed K01590: hdc, histidine decarboxylase
11 Sobic.008G048000 OsSAUR15 - Auxin-responsive SAUR gene family member -
12 Sobic.002G304200 expressed protein -
13 Sobic.004G080350 - -
14 Sobic.002G218350 - -
15 Sobic.009G219601 - -
16 Sobic.007G111901 - -
17 Sobic.001G235332 - -
18 Sobic.010G158300 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
19 Sobic.005G190400 MBTB2 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
20 Sobic.005G102750 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G185400 Sobic007G185400 Sobic008G159200 Sobic008G159200 Sobic007G185400--Sobic008G159200 Sobic002G120850 Sobic002G120850 Sobic007G185400--Sobic002G120850 Sobic006G274833 Sobic006G274833 Sobic007G185400--Sobic006G274833 Sobic006G024800 Sobic006G024800 Sobic007G185400--Sobic006G024800 Sobic002G037300 Sobic002G037300 Sobic007G185400--Sobic002G037300 Sobic007G078400 Sobic007G078400 Sobic007G185400--Sobic007G078400 Sobic003G035266 Sobic003G035266 Sobic007G185400--Sobic003G035266 Sobic003G268650 Sobic003G268650 Sobic007G185400--Sobic003G268650 Sobic005G067000 Sobic005G067000 Sobic007G185400--Sobic005G067000 Sobic006G075650 Sobic006G075650 Sobic008G159200--Sobic006G075650 Sobic008G159200--Sobic003G035266 Sobic005G190400 Sobic005G190400 Sobic008G159200--Sobic005G190400 Sobic005G102750 Sobic005G102750 Sobic008G159200--Sobic005G102750 Sobic003G094850 Sobic003G094850 Sobic008G159200--Sobic003G094850 Sobic002G218350 Sobic002G218350 Sobic008G159200--Sobic002G218350 Sobic009G219601 Sobic009G219601 Sobic008G159200--Sobic009G219601 Sobic005G062300 Sobic005G062300 Sobic008G159200--Sobic005G062300 Sobic008G159200--Sobic003G268650 Sobic003G089400 Sobic003G089400 Sobic002G120850--Sobic003G089400 Sobic008G048000 Sobic008G048000 Sobic002G120850--Sobic008G048000 Sobic007G054300 Sobic007G054300 Sobic002G120850--Sobic007G054300 Sobic001G371500 Sobic001G371500 Sobic002G120850--Sobic001G371500 Sobic003G258000 Sobic003G258000 Sobic002G120850--Sobic003G258000 Sobic002G120850--Sobic005G067000 Sobic002G175000 Sobic002G175000 Sobic002G120850--Sobic002G175000 Sobic002G044200 Sobic002G044200 Sobic002G120850--Sobic002G044200 Sobic002G120850--Sobic007G078400 Sobic006G274833--Sobic007G078400 Sobic010G158300 Sobic010G158300 Sobic006G274833--Sobic010G158300 Sobic006G274833--Sobic002G218350 Sobic003G437900 Sobic003G437900 Sobic006G274833--Sobic003G437900 Sobic006G080050 Sobic006G080050 Sobic006G274833--Sobic006G080050 Sobic009G185601 Sobic009G185601 Sobic006G274833--Sobic009G185601 Sobic001G030800 Sobic001G030800 Sobic006G274833--Sobic001G030800 Sobic006G274833--Sobic009G219601 Sobic003G066200 Sobic003G066200 Sobic006G274833--Sobic003G066200 Sobic006G024800--Sobic005G190400 Sobic006G024800--Sobic002G037300 Sobic006G024800--Sobic005G102750 Sobic006G024800--Sobic003G094850 Sobic006G024800--Sobic008G159200 Sobic006G024800--Sobic003G268650 Sobic006G024800--Sobic003G066200 Sobic005G191000 Sobic005G191000 Sobic006G024800--Sobic005G191000 Sobic005G153033 Sobic005G153033 Sobic006G024800--Sobic005G153033 Sobic002G037300--Sobic006G024800 Sobic002G037300--Sobic006G080050 Sobic002G037300--Sobic007G078400 Sobic007G084900 Sobic007G084900 Sobic002G037300--Sobic007G084900 Sobic002G037300--Sobic003G268650 Sobic001G515900 Sobic001G515900 Sobic002G037300--Sobic001G515900 Sobic002G037300--Sobic008G159200 Sobic002G037300--Sobic009G219601 Sobic004G071300 Sobic004G071300 Sobic002G037300--Sobic004G071300 Sobic007G078400--Sobic002G218350 Sobic007G078400--Sobic010G158300 Sobic007G078400--Sobic009G219601 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic007G078400--Sobic001G018700 Sobic003G035266--Sobic008G159200 Sobic009G019301 Sobic009G019301 Sobic003G035266--Sobic009G019301 Sobic003G035266--Sobic002G218350 Sobic003G035266--Sobic006G075650 Sobic001G539100 Sobic001G539100 Sobic003G035266--Sobic001G539100 Sobic003G035266--Sobic007G078400 Sobic003G405400 Sobic003G405400 Sobic003G035266--Sobic003G405400 Sobic002G304200 Sobic002G304200 Sobic003G035266--Sobic002G304200 Sobic003G035266--Sobic010G158300 Sobic001G183900 Sobic001G183900 Sobic003G268650--Sobic001G183900 Sobic002G032033 Sobic002G032033 Sobic003G268650--Sobic002G032033 Sobic003G268650--Sobic003G094850 Sobic003G268650--Sobic005G102750 Sobic003G268650--Sobic005G190400 Sobic005G216866 Sobic005G216866 Sobic003G268650--Sobic005G216866 Sobic003G268650--Sobic009G219601 Sobic004G246950 Sobic004G246950 Sobic003G268650--Sobic004G246950 Sobic003G072100 Sobic003G072100 Sobic003G268650--Sobic003G072100 Sobic005G067000--Sobic001G371500 Sobic007G221300 Sobic007G221300 Sobic005G067000--Sobic007G221300 Sobic010G142132 Sobic010G142132 Sobic005G067000--Sobic010G142132 Sobic006G176300 Sobic006G176300 Sobic005G067000--Sobic006G176300 Sobic005G067000--Sobic007G078400 Sobic005G067000--Sobic010G158300 Sobic005G067000--Sobic002G218350 Sobic005G067000--Sobic007G054300 Sobic005G067000--Sobic001G018700
Octagon: transcription factors


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