Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G176300.1
Synonym Sb08g022030, YAB1, AFO, FIL
Functional annotation YABBY domain containing protein, putative, expressed
UniProt C5YSF3
Pfam PF04690
Panther DB PTHR31675 PTHR31675:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0007275; multicellular organism development


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G26580 : plant-specific transcription factor YABBY family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g42610.1 : YABBY domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a025127 , Zm00025a004744
Brachypodium KQJ85732 , KQJ85731
Barley HORVU5Hr1G007260.8 , HORVU5Hr1G007260.9 , HORVU5Hr1G007260.7 , HORVU5Hr1G007260.4 , HORVU5Hr1G007260.2 , HORVU5Hr1G007260.3 , HORVU5Hr1G007260.1 , HORVU5Hr1G007260.14 , HORVU5Hr1G007260.15 , HORVU5Hr1G007260.16 , HORVU5Hr1G007260.10 , HORVU5Hr1G007260.11 , HORVU5Hr1G007260.13 , HORVU5Hr1G007270.1 , HORVU5Hr1G007270.2
Wheat TraesCS5A02G025900 , TraesCS5A02G025900 , TraesCS5B02G025100 , TraesCS5D02G033700 , TraesCS5D02G033700
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cDNA sequences
Sobic.008G176300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.005G102451 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G176300 Sobic008G176300 Sobic006G064700 Sobic006G064700 Sobic008G176300--Sobic006G064700 Sobic009G039900 Sobic009G039900 Sobic008G176300--Sobic009G039900 Sobic009G039100 Sobic009G039100 Sobic008G176300--Sobic009G039100 Sobic005G148600 Sobic005G148600 Sobic008G176300--Sobic005G148600 Sobic007G128400 Sobic007G128400 Sobic008G176300--Sobic007G128400 Sobic006G117300 Sobic006G117300 Sobic008G176300--Sobic006G117300 Sobic005G090500 Sobic005G090500 Sobic008G176300--Sobic005G090500 Sobic005G153400 Sobic005G153400 Sobic008G176300--Sobic005G153400 Sobic005G074800 Sobic005G074800 Sobic008G176300--Sobic005G074800 Sobic006G064700--Sobic009G039100 Sobic006G064700--Sobic009G039900 Sobic002G345400 Sobic002G345400 Sobic006G064700--Sobic002G345400 Sobic001G328900 Sobic001G328900 Sobic006G064700--Sobic001G328900 Sobic005G102451 Sobic005G102451 Sobic006G064700--Sobic005G102451 Sobic003G303500 Sobic003G303500 Sobic006G064700--Sobic003G303500 Sobic006G064700--Sobic005G153400 Sobic006G064700--Sobic005G148600 Sobic010G195600 Sobic010G195600 Sobic006G064700--Sobic010G195600 Sobic009G039900--Sobic005G153400 Sobic009G039900--Sobic006G064700 Sobic009G039900--Sobic009G039100 Sobic009G039900--Sobic005G148600 Sobic009G039900--Sobic001G328900 Sobic009G039900--Sobic002G345400 Sobic009G039900--Sobic010G195600 Sobic005G051700 Sobic005G051700 Sobic009G039900--Sobic005G051700 Sobic004G196200 Sobic004G196200 Sobic009G039900--Sobic004G196200 Sobic009G039100--Sobic006G064700 Sobic009G039100--Sobic002G345400 Sobic009G039100--Sobic001G328900 Sobic009G039100--Sobic005G102451 Sobic009G039100--Sobic009G039900 Sobic009G039100--Sobic003G303500 Sobic009G039100--Sobic005G153400 Sobic009G039100--Sobic010G195600 Sobic007G205200 Sobic007G205200 Sobic009G039100--Sobic007G205200 Sobic005G148600--Sobic004G196200 Sobic005G148600--Sobic005G074800 Sobic005G148600--Sobic005G090500 Sobic005G148600--Sobic009G039900 Sobic005G148600--Sobic006G064700 Sobic005G148600--Sobic005G153400 Sobic005G148600--Sobic009G039100 Sobic007G082900 Sobic007G082900 Sobic005G148600--Sobic007G082900 Sobic005G074900 Sobic005G074900 Sobic005G148600--Sobic005G074900 Sobic007G128400--Sobic006G117300 Sobic007G040000 Sobic007G040000 Sobic007G128400--Sobic007G040000 Sobic005G174500 Sobic005G174500 Sobic007G128400--Sobic005G174500 Sobic009G090250 Sobic009G090250 Sobic007G128400--Sobic009G090250 Sobic001G246400 Sobic001G246400 Sobic007G128400--Sobic001G246400 Sobic003G321500 Sobic003G321500 Sobic007G128400--Sobic003G321500 Sobic002G089500 Sobic002G089500 Sobic007G128400--Sobic002G089500 Sobic002G267700 Sobic002G267700 Sobic007G128400--Sobic002G267700 Sobic001G392900 Sobic001G392900 Sobic007G128400--Sobic001G392900 Sobic006G117300--Sobic007G040000 Sobic006G117300--Sobic003G321500 Sobic006G117300--Sobic009G090250 Sobic006G117300--Sobic005G174500 Sobic006G117300--Sobic001G246400 Sobic006G031000 Sobic006G031000 Sobic006G117300--Sobic006G031000 Sobic001G270600 Sobic001G270600 Sobic006G117300--Sobic001G270600 Sobic006G117300--Sobic002G267700 Sobic006G117300--Sobic002G089500 Sobic005G090500--Sobic005G074800 Sobic005G090500--Sobic005G148600 Sobic002G053100 Sobic002G053100 Sobic005G090500--Sobic002G053100 Sobic005G090500--Sobic004G196200 Sobic006G271400 Sobic006G271400 Sobic005G090500--Sobic006G271400 Sobic004G171500 Sobic004G171500 Sobic005G090500--Sobic004G171500 Sobic005G090500--Sobic006G064700 Sobic008G001700 Sobic008G001700 Sobic005G090500--Sobic008G001700 Sobic005G090500--Sobic005G074900 Sobic005G153400--Sobic005G051700 Sobic005G153400--Sobic001G328900 Sobic005G116000 Sobic005G116000 Sobic005G153400--Sobic005G116000 Sobic005G153400--Sobic009G039900 Sobic005G153400--Sobic010G195600 Sobic005G153400--Sobic002G345400 Sobic005G153400--Sobic007G205200 Sobic005G153400--Sobic009G039100 Sobic005G153600 Sobic005G153600 Sobic005G153400--Sobic005G153600 Sobic005G074800--Sobic005G148600 Sobic005G074800--Sobic004G196200 Sobic005G074800--Sobic005G090500 Sobic010G034900 Sobic010G034900 Sobic005G074800--Sobic010G034900 Sobic005G074800--Sobic002G345400 Sobic005G074800--Sobic005G102451 Sobic010G219300 Sobic010G219300 Sobic005G074800--Sobic010G219300 Sobic005G056100 Sobic005G056100 Sobic005G074800--Sobic005G056100 Sobic008G064000 Sobic008G064000 Sobic005G074800--Sobic008G064000
Octagon: transcription factors


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