Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G128400.1
Synonym Sb07g020480
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YKY5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g32420.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G117300 Os4bglu12 - beta-glucosidase, exo-beta-glucanase, expressed K01188: beta-glucosidase
2 Sobic.007G040000 - -
3 Sobic.005G174500 - -
4 Sobic.009G090250 - -
5 Sobic.001G246400 MBTB43 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
6 Sobic.003G321500 Homeobox domain containing protein, expressed -
7 Sobic.002G089500 DEF8 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
8 Sobic.002G267700 bZIP family transcription factor, putative, expressed -
9 Sobic.001G392900 - -
10 Sobic.002G007700 nodulin family protein, putative, expressed -
11 Sobic.008G176300 YABBY domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.001G270600 - -
13 Sobic.003G207600 OsFBD5 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
14 Sobic.005G173900 - -
15 Sobic.005G021100 - -
16 Sobic.006G031000 MYB family transcription factor, putative, expressed -
17 Sobic.002G053100 RNA recognition motif containing protein, expressed -
18 Sobic.003G207100 expressed protein -
19 Sobic.005G171800 OsFBDUF20 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
20 Sobic.009G077250 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G128400 Sobic007G128400 Sobic006G117300 Sobic006G117300 Sobic007G128400--Sobic006G117300 Sobic007G040000 Sobic007G040000 Sobic007G128400--Sobic007G040000 Sobic005G174500 Sobic005G174500 Sobic007G128400--Sobic005G174500 Sobic009G090250 Sobic009G090250 Sobic007G128400--Sobic009G090250 Sobic001G246400 Sobic001G246400 Sobic007G128400--Sobic001G246400 Sobic003G321500 Sobic003G321500 Sobic007G128400--Sobic003G321500 Sobic002G089500 Sobic002G089500 Sobic007G128400--Sobic002G089500 Sobic002G267700 Sobic002G267700 Sobic007G128400--Sobic002G267700 Sobic001G392900 Sobic001G392900 Sobic007G128400--Sobic001G392900 Sobic006G117300--Sobic007G040000 Sobic006G117300--Sobic003G321500 Sobic006G117300--Sobic009G090250 Sobic006G117300--Sobic005G174500 Sobic006G117300--Sobic001G246400 Sobic006G031000 Sobic006G031000 Sobic006G117300--Sobic006G031000 Sobic001G270600 Sobic001G270600 Sobic006G117300--Sobic001G270600 Sobic006G117300--Sobic002G267700 Sobic006G117300--Sobic002G089500 Sobic007G040000--Sobic009G090250 Sobic007G040000--Sobic006G117300 Sobic007G040000--Sobic005G174500 Sobic005G173900 Sobic005G173900 Sobic007G040000--Sobic005G173900 Sobic007G040000--Sobic003G321500 Sobic007G040000--Sobic001G246400 Sobic007G040000--Sobic001G270600 Sobic006G070830 Sobic006G070830 Sobic007G040000--Sobic006G070830 Sobic007G040000--Sobic002G267700 Sobic005G174500--Sobic009G090250 Sobic005G174500--Sobic001G246400 Sobic005G174500--Sobic007G040000 Sobic005G174500--Sobic005G173900 Sobic002G007700 Sobic002G007700 Sobic005G174500--Sobic002G007700 Sobic005G174500--Sobic006G117300 Sobic003G091500 Sobic003G091500 Sobic005G174500--Sobic003G091500 Sobic005G174500--Sobic002G089500 Sobic003G207100 Sobic003G207100 Sobic005G174500--Sobic003G207100 Sobic009G090250--Sobic001G246400 Sobic009G090250--Sobic005G174500 Sobic009G090250--Sobic007G040000 Sobic009G090250--Sobic003G321500 Sobic009G090250--Sobic001G270600 Sobic009G090250--Sobic006G117300 Sobic009G090250--Sobic005G173900 Sobic003G207600 Sobic003G207600 Sobic009G090250--Sobic003G207600 Sobic009G090250--Sobic002G007700 Sobic001G246400--Sobic009G090250 Sobic001G246400--Sobic005G174500 Sobic001G246400--Sobic007G040000 Sobic001G246400--Sobic003G321500 Sobic001G246400--Sobic006G117300 Sobic001G246400--Sobic001G270600 Sobic001G246400--Sobic003G207600 Sobic001G246400--Sobic005G173900 Sobic001G246400--Sobic002G007700 Sobic003G321500--Sobic009G090250 Sobic003G321500--Sobic006G117300 Sobic003G321500--Sobic007G040000 Sobic003G321500--Sobic001G246400 Sobic003G321500--Sobic001G270600 Sobic003G321500--Sobic005G174500 Sobic003G321500--Sobic003G207600 Sobic006G064700 Sobic006G064700 Sobic003G321500--Sobic006G064700 Sobic003G321500--Sobic005G173900 Sobic005G021100 Sobic005G021100 Sobic002G089500--Sobic005G021100 Sobic002G089500--Sobic001G392900 Sobic002G089500--Sobic002G007700 Sobic004G171600 Sobic004G171600 Sobic002G089500--Sobic004G171600 Sobic001G233600 Sobic001G233600 Sobic002G089500--Sobic001G233600 Sobic002G293100 Sobic002G293100 Sobic002G089500--Sobic002G293100 Sobic005G077900 Sobic005G077900 Sobic002G089500--Sobic005G077900 Sobic001G200900 Sobic001G200900 Sobic002G089500--Sobic001G200900 Sobic005G174000 Sobic005G174000 Sobic002G089500--Sobic005G174000 Sobic005G033600 Sobic005G033600 Sobic002G267700--Sobic005G033600 Sobic002G267700--Sobic006G070830 Sobic008G031400 Sobic008G031400 Sobic002G267700--Sobic008G031400 Sobic002G267700--Sobic006G031000 Sobic002G267700--Sobic005G174500 Sobic002G267700--Sobic002G089500 Sobic005G032500 Sobic005G032500 Sobic002G267700--Sobic005G032500 Sobic002G267700--Sobic003G091500 Sobic002G267700--Sobic006G117300 Sobic001G392900--Sobic005G021100 Sobic001G392900--Sobic002G089500 Sobic008G168400 Sobic008G168400 Sobic001G392900--Sobic008G168400 Sobic002G381600 Sobic002G381600 Sobic001G392900--Sobic002G381600 Sobic001G129900 Sobic001G129900 Sobic001G392900--Sobic001G129900 Sobic006G104800 Sobic006G104800 Sobic001G392900--Sobic006G104800 Sobic009G052400 Sobic009G052400 Sobic001G392900--Sobic009G052400 Sobic001G392900--Sobic004G171600 Sobic003G063900 Sobic003G063900 Sobic001G392900--Sobic003G063900
Octagon: transcription factors


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