Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G236500.1
Synonym Sb09g028900
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence. (PubMedID : 27586543)
expressed protein
UniProt C5YVY3
Pfam -
Panther DB PTHR33429 PTHR33429:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g49330.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a044616
Brachypodium KQK04803
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G337700 WRKY20, expressed -
2 Sobic.004G224300 5-azacytidine resistance protein related, putative, expressed -
3 Sobic.004G089700 - -
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8 Sobic.002G048250 - -
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14 Sobic.001G527400 - -
15 Sobic.004G347866 - -
16 Sobic.003G265300 lectin-like receptor kinase, putative, expressed -
17 Sobic.005G231800 tropinone reductase, putative, expressed K08081: tropinone reductase I
18 Sobic.003G290700 anthocyanidin 5,3-O-glucosyltransferase, putative, expressed -
19 Sobic.003G173032 - -
20 Sobic.002G003100 gibberellin 2-beta-dioxygenase 7, putative, expressed K04125: gibberellin 2beta-dioxygenase


Gene co-expression network
sample Sobic009G236500 Sobic009G236500 Sobic003G337700 Sobic003G337700 Sobic009G236500--Sobic003G337700 Sobic004G224300 Sobic004G224300 Sobic009G236500--Sobic004G224300 Sobic004G089700 Sobic004G089700 Sobic009G236500--Sobic004G089700 Sobic002G339250 Sobic002G339250 Sobic009G236500--Sobic002G339250 Sobic005G209800 Sobic005G209800 Sobic009G236500--Sobic005G209800 Sobic001G457100 Sobic001G457100 Sobic009G236500--Sobic001G457100 Sobic010G002850 Sobic010G002850 Sobic009G236500--Sobic010G002850 Sobic002G048250 Sobic002G048250 Sobic009G236500--Sobic002G048250 Sobic004G226300 Sobic004G226300 Sobic009G236500--Sobic004G226300 Sobic003G337700--Sobic004G224300 Sobic008G023000 Sobic008G023000 Sobic003G337700--Sobic008G023000 Sobic008G002100 Sobic008G002100 Sobic003G337700--Sobic008G002100 Sobic001G527400 Sobic001G527400 Sobic003G337700--Sobic001G527400 Sobic007G183000 Sobic007G183000 Sobic003G337700--Sobic007G183000 Sobic003G337700--Sobic004G226300 Sobic003G337700--Sobic005G209800 Sobic005G231800 Sobic005G231800 Sobic003G337700--Sobic005G231800 Sobic003G173032 Sobic003G173032 Sobic003G337700--Sobic003G173032 Sobic004G224300--Sobic008G023000 Sobic004G224300--Sobic001G527400 Sobic004G224300--Sobic007G183000 Sobic004G224300--Sobic002G048250 Sobic004G224300--Sobic008G002100 Sobic004G224300--Sobic003G337700 Sobic004G224300--Sobic004G226300 Sobic004G224300--Sobic005G231800 Sobic004G224300--Sobic005G209800 Sobic004G089700--Sobic002G048250 Sobic004G089700--Sobic007G183000 Sobic004G089700--Sobic005G231800 Sobic004G089700--Sobic008G023000 Sobic004G089700--Sobic001G527400 Sobic004G089700--Sobic004G226300 Sobic004G089700--Sobic008G002100 Sobic004G089700--Sobic005G209800 Sobic004G347866 Sobic004G347866 Sobic004G089700--Sobic004G347866 Sobic002G339250--Sobic004G347866 Sobic002G339250--Sobic004G089700 Sobic002G339250--Sobic002G048250 Sobic002G339250--Sobic001G457100 Sobic002G339250--Sobic004G226300 Sobic002G339250--Sobic007G183000 Sobic007G157550 Sobic007G157550 Sobic002G339250--Sobic007G157550 Sobic002G339250--Sobic001G527400 Sobic004G206900 Sobic004G206900 Sobic002G339250--Sobic004G206900 Sobic005G209800--Sobic008G002100 Sobic005G209800--Sobic008G023000 Sobic005G209800--Sobic001G527400 Sobic005G209800--Sobic007G183000 Sobic005G209800--Sobic004G226300 Sobic005G209800--Sobic005G231800 Sobic006G171000 Sobic006G171000 Sobic005G209800--Sobic006G171000 Sobic005G209800--Sobic003G173032 Sobic005G209800--Sobic002G048250 Sobic009G223700 Sobic009G223700 Sobic001G457100--Sobic009G223700 Sobic001G457100--Sobic004G347866 Sobic001G457100--Sobic004G089700 Sobic001G457100--Sobic004G226300 Sobic001G457100--Sobic002G048250 Sobic001G457100--Sobic007G183000 Sobic001G457100--Sobic007G157550 Sobic001G457100--Sobic005G231800 Sobic003G290700 Sobic003G290700 Sobic001G457100--Sobic003G290700 Sobic010G002850--Sobic005G209800 Sobic010G002850--Sobic008G023000 Sobic010G002850--Sobic008G002100 Sobic010G002850--Sobic004G226300 Sobic010G002850--Sobic001G527400 Sobic010G002850--Sobic007G183000 Sobic010G002850--Sobic006G171000 Sobic005G156700 Sobic005G156700 Sobic010G002850--Sobic005G156700 Sobic010G002850--Sobic005G231800 Sobic002G048250--Sobic007G183000 Sobic002G048250--Sobic001G527400 Sobic002G048250--Sobic004G226300 Sobic002G048250--Sobic008G023000 Sobic002G048250--Sobic008G002100 Sobic002G048250--Sobic005G231800 Sobic002G048250--Sobic005G209800 Sobic002G048250--Sobic003G173032 Sobic002G048250--Sobic004G224300 Sobic004G226300--Sobic007G183000 Sobic004G226300--Sobic001G527400 Sobic004G226300--Sobic008G023000 Sobic004G226300--Sobic008G002100 Sobic004G226300--Sobic002G048250 Sobic004G226300--Sobic005G231800 Sobic004G226300--Sobic005G209800 Sobic004G226300--Sobic006G171000 Sobic004G226300--Sobic003G173032
Octagon: transcription factors


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