Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G239700.2
Synonym Sb09g029150
Functional annotation VQ domain containing protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5R3Z2
Pfam PF05678
Panther DB PTHR34777 PTHR34777:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g46440.1 : VQ domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G072801 - -
2 Sobic.005G028000 OsSAUR16 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed -
3 Sobic.010G263950 - -
4 Sobic.001G135000 OsFBX85 - F-box domain containing protein, expressed -
5 Sobic.002G375950 - -
6 Sobic.009G200750 - -
7 Sobic.001G463700 - -
8 Sobic.003G193400 TKL_IRAK_DUF26-la.4 - DUF26 kinases have homology to DUF26 containing loci, expressed -
9 Sobic.006G031866 - -
10 Sobic.001G310400 expressed protein -
11 Sobic.001G163900 calcium-transporting ATPase, endoplasmic reticulum-type, putative, expressed -
12 Sobic.005G217400 AP2 domain containing protein, expressed -
13 Sobic.006G025132 - -
14 Sobic.001G519500 - -
15 Sobic.007G141420 - -
16 Sobic.007G116733 - -
17 Sobic.006G024101 - -
18 Sobic.004G204300 cyclin, putative, expressed K06627: cyclin-A
19 Sobic.007G118700 - -
20 Sobic.010G165925 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G239700 Sobic009G239700 Sobic003G072801 Sobic003G072801 Sobic009G239700--Sobic003G072801 Sobic005G028000 Sobic005G028000 Sobic009G239700--Sobic005G028000 Sobic010G263950 Sobic010G263950 Sobic009G239700--Sobic010G263950 Sobic001G135000 Sobic001G135000 Sobic009G239700--Sobic001G135000 Sobic002G375950 Sobic002G375950 Sobic009G239700--Sobic002G375950 Sobic009G200750 Sobic009G200750 Sobic009G239700--Sobic009G200750 Sobic001G463700 Sobic001G463700 Sobic009G239700--Sobic001G463700 Sobic003G193400 Sobic003G193400 Sobic009G239700--Sobic003G193400 Sobic006G031866 Sobic006G031866 Sobic009G239700--Sobic006G031866 Sobic003G034800 Sobic003G034800 Sobic003G072801--Sobic003G034800 Sobic003G072801--Sobic009G239700 Sobic004G276166 Sobic004G276166 Sobic003G072801--Sobic004G276166 Sobic003G072801--Sobic010G263950 Sobic010G135700 Sobic010G135700 Sobic003G072801--Sobic010G135700 Sobic001G355850 Sobic001G355850 Sobic003G072801--Sobic001G355850 Sobic001G538275 Sobic001G538275 Sobic003G072801--Sobic001G538275 Sobic003G072801--Sobic005G028000 Sobic003G111900 Sobic003G111900 Sobic003G072801--Sobic003G111900 Sobic005G028000--Sobic002G375950 Sobic010G207325 Sobic010G207325 Sobic005G028000--Sobic010G207325 Sobic006G025132 Sobic006G025132 Sobic005G028000--Sobic006G025132 Sobic007G116733 Sobic007G116733 Sobic005G028000--Sobic007G116733 Sobic001G163900 Sobic001G163900 Sobic005G028000--Sobic001G163900 Sobic010G151325 Sobic010G151325 Sobic005G028000--Sobic010G151325 Sobic006G218050 Sobic006G218050 Sobic005G028000--Sobic006G218050 Sobic001G361400 Sobic001G361400 Sobic005G028000--Sobic001G361400 Sobic001G120700 Sobic001G120700 Sobic005G028000--Sobic001G120700 Sobic009G140150 Sobic009G140150 Sobic010G263950--Sobic009G140150 Sobic010G263950--Sobic009G239700 Sobic010G263950--Sobic003G072801 Sobic010G263950--Sobic005G028000 Sobic002G100700 Sobic002G100700 Sobic010G263950--Sobic002G100700 Sobic006G081900 Sobic006G081900 Sobic010G263950--Sobic006G081900 Sobic003G047500 Sobic003G047500 Sobic010G263950--Sobic003G047500 Sobic004G006966 Sobic004G006966 Sobic010G263950--Sobic004G006966 Sobic001G135000--Sobic006G031866 Sobic001G135000--Sobic001G463700 Sobic007G171300 Sobic007G171300 Sobic001G135000--Sobic007G171300 Sobic001G135000--Sobic003G193400 Sobic007G141420 Sobic007G141420 Sobic001G135000--Sobic007G141420 Sobic001G529301 Sobic001G529301 Sobic001G135000--Sobic001G529301 Sobic001G310400 Sobic001G310400 Sobic001G135000--Sobic001G310400 Sobic005G217400 Sobic005G217400 Sobic001G135000--Sobic005G217400 Sobic008G052700 Sobic008G052700 Sobic001G135000--Sobic008G052700 Sobic002G375950--Sobic005G028000 Sobic002G375950--Sobic006G025132 Sobic002G375950--Sobic007G116733 Sobic002G375950--Sobic006G218050 Sobic002G375950--Sobic001G120700 Sobic002G375950--Sobic001G163900 Sobic002G375950--Sobic010G207325 Sobic002G375950--Sobic001G361400 Sobic008G031800 Sobic008G031800 Sobic002G375950--Sobic008G031800 Sobic002G142550 Sobic002G142550 Sobic009G200750--Sobic002G142550 Sobic010G165925 Sobic010G165925 Sobic009G200750--Sobic010G165925 Sobic005G107250 Sobic005G107250 Sobic009G200750--Sobic005G107250 Sobic007G003250 Sobic007G003250 Sobic009G200750--Sobic007G003250 Sobic001G369701 Sobic001G369701 Sobic009G200750--Sobic001G369701 Sobic010G180300 Sobic010G180300 Sobic009G200750--Sobic010G180300 Sobic001G115200 Sobic001G115200 Sobic009G200750--Sobic001G115200 Sobic005G019650 Sobic005G019650 Sobic009G200750--Sobic005G019650 Sobic003G025500 Sobic003G025500 Sobic009G200750--Sobic003G025500 Sobic001G463700--Sobic003G193400 Sobic001G463700--Sobic001G310400 Sobic001G463700--Sobic005G217400 Sobic001G463700--Sobic001G135000 Sobic001G463700--Sobic007G141420 Sobic001G120850 Sobic001G120850 Sobic001G463700--Sobic001G120850 Sobic001G463700--Sobic006G031866 Sobic001G519500 Sobic001G519500 Sobic001G463700--Sobic001G519500 Sobic007G118700 Sobic007G118700 Sobic001G463700--Sobic007G118700 Sobic003G193400--Sobic001G310400 Sobic003G193400--Sobic001G463700 Sobic003G193400--Sobic005G217400 Sobic003G193400--Sobic007G118700 Sobic003G193400--Sobic001G519500 Sobic003G193400--Sobic005G107250 Sobic003G193400--Sobic005G019650 Sobic003G193400--Sobic001G115200 Sobic006G185150 Sobic006G185150 Sobic003G193400--Sobic006G185150 Sobic006G031866--Sobic001G135000 Sobic006G031866--Sobic001G463700 Sobic005G035850 Sobic005G035850 Sobic006G031866--Sobic005G035850 Sobic003G003900 Sobic003G003900 Sobic006G031866--Sobic003G003900 Sobic008G098032 Sobic008G098032 Sobic006G031866--Sobic008G098032 Sobic006G031866--Sobic007G171300 Sobic004G139800 Sobic004G139800 Sobic006G031866--Sobic004G139800 Sobic001G310133 Sobic001G310133 Sobic006G031866--Sobic001G310133 Sobic006G031866--Sobic007G141420
Octagon: transcription factors


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