Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G072801.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q1U1
Pfam PF03469
Panther DB PTHR21596 PTHR21596:SF24
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G00380 : XH/XS domain-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g05440.1 : XH domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G034800 MYB family transcription factor, putative, expressed -
2 Sobic.009G239700 VQ domain containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.004G276166 - -
4 Sobic.010G263950 - -
5 Sobic.010G135700 ZOS6-04 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
6 Sobic.001G355850 - -
7 Sobic.001G538275 - -
8 Sobic.005G028000 OsSAUR16 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed -
9 Sobic.003G111900 laccase precursor protein, putative, expressed K05909: laccase
10 Sobic.003G217566 - -
11 Sobic.008G060400 - -
12 Sobic.007G203600 transferase family protein, putative, expressed -
13 Sobic.003G254400 expressed protein -
14 Sobic.007G121800 histone-lysine N-methyltransferase, putative, expressed K11420: [histone H3]-lysine9 N-trimethyltransferase EHMT
15 Sobic.005G137800 expressed protein -
16 Sobic.003G008400 acetyltransferase, GNAT family protein, expressed -
17 Sobic.002G428301 - -
18 Sobic.005G080075 - -
19 Sobic.007G003300 - -
20 Sobic.010G263151 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G072801 Sobic003G072801 Sobic003G034800 Sobic003G034800 Sobic003G072801--Sobic003G034800 Sobic009G239700 Sobic009G239700 Sobic003G072801--Sobic009G239700 Sobic004G276166 Sobic004G276166 Sobic003G072801--Sobic004G276166 Sobic010G263950 Sobic010G263950 Sobic003G072801--Sobic010G263950 Sobic010G135700 Sobic010G135700 Sobic003G072801--Sobic010G135700 Sobic001G355850 Sobic001G355850 Sobic003G072801--Sobic001G355850 Sobic001G538275 Sobic001G538275 Sobic003G072801--Sobic001G538275 Sobic005G028000 Sobic005G028000 Sobic003G072801--Sobic005G028000 Sobic003G111900 Sobic003G111900 Sobic003G072801--Sobic003G111900 Sobic010G123000 Sobic010G123000 Sobic003G034800--Sobic010G123000 Sobic003G318600 Sobic003G318600 Sobic003G034800--Sobic003G318600 Sobic010G064050 Sobic010G064050 Sobic003G034800--Sobic010G064050 Sobic001G100650 Sobic001G100650 Sobic003G034800--Sobic001G100650 Sobic005G080075 Sobic005G080075 Sobic003G034800--Sobic005G080075 Sobic002G082350 Sobic002G082350 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Octagon: transcription factors


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