Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G204300.1
Synonym CYCA3, 4, Sb04g025050
Functional annotation cyclin, putative, expressed
UniProt C5XX47
Pfam PF02984 PF00134
Panther DB PTHR10177 PTHR10177:SF208
NCBI CDD -
KEGG Orthology K06627; cyclin-A
Gene Ontology GO:0005634; nucleus


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G47230 : CYCLIN A3;4
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g39420.1 : cyclin, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G138700 - -
2 Sobic.010G023066 - -
3 Sobic.005G071500 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -
4 Sobic.003G417500 ZOS1-23 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
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18 Sobic.003G353900 - -
19 Sobic.005G110487 - -
20 Sobic.003G389601 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G204300 Sobic004G204300 Sobic001G138700 Sobic001G138700 Sobic004G204300--Sobic001G138700 Sobic010G023066 Sobic010G023066 Sobic004G204300--Sobic010G023066 Sobic005G071500 Sobic005G071500 Sobic004G204300--Sobic005G071500 Sobic003G417500 Sobic003G417500 Sobic004G204300--Sobic003G417500 Sobic006G217950 Sobic006G217950 Sobic004G204300--Sobic006G217950 Sobic009G200750 Sobic009G200750 Sobic004G204300--Sobic009G200750 Sobic010G022350 Sobic010G022350 Sobic004G204300--Sobic010G022350 Sobic002G050450 Sobic002G050450 Sobic004G204300--Sobic002G050450 Sobic001G216900 Sobic001G216900 Sobic004G204300--Sobic001G216900 Sobic001G138700--Sobic006G217950 Sobic001G138700--Sobic004G204300 Sobic001G138700--Sobic009G200750 Sobic006G252532 Sobic006G252532 Sobic001G138700--Sobic006G252532 Sobic008G110151 Sobic008G110151 Sobic001G138700--Sobic008G110151 Sobic003G199650 Sobic003G199650 Sobic001G138700--Sobic003G199650 Sobic004G020500 Sobic004G020500 Sobic001G138700--Sobic004G020500 Sobic001G138700--Sobic010G023066 Sobic003G188700 Sobic003G188700 Sobic001G138700--Sobic003G188700 Sobic010G023066--Sobic005G071500 Sobic010G023066--Sobic003G417500 Sobic010G023066--Sobic004G204300 Sobic010G023066--Sobic004G020500 Sobic010G023066--Sobic001G138700 Sobic010G124800 Sobic010G124800 Sobic010G023066--Sobic010G124800 Sobic010G023066--Sobic001G216900 Sobic010G023066--Sobic006G217950 Sobic010G023066--Sobic010G022350 Sobic005G071500--Sobic003G417500 Sobic005G071500--Sobic010G023066 Sobic005G071500--Sobic004G204300 Sobic005G110487 Sobic005G110487 Sobic005G071500--Sobic005G110487 Sobic005G071500--Sobic006G217950 Sobic007G101000 Sobic007G101000 Sobic005G071500--Sobic007G101000 Sobic006G034650 Sobic006G034650 Sobic005G071500--Sobic006G034650 Sobic006G032200 Sobic006G032200 Sobic005G071500--Sobic006G032200 Sobic010G245900 Sobic010G245900 Sobic005G071500--Sobic010G245900 Sobic003G417500--Sobic005G071500 Sobic003G417500--Sobic010G023066 Sobic003G417500--Sobic004G204300 Sobic003G417500--Sobic001G216900 Sobic008G186300 Sobic008G186300 Sobic003G417500--Sobic008G186300 Sobic003G417500--Sobic005G110487 Sobic002G038733 Sobic002G038733 Sobic003G417500--Sobic002G038733 Sobic003G417500--Sobic010G245900 Sobic003G417500--Sobic006G217950 Sobic006G217950--Sobic001G138700 Sobic006G217950--Sobic005G071500 Sobic006G217950--Sobic004G204300 Sobic006G217950--Sobic009G200750 Sobic002G248201 Sobic002G248201 Sobic006G217950--Sobic002G248201 Sobic002G363466 Sobic002G363466 Sobic006G217950--Sobic002G363466 Sobic006G217950--Sobic003G417500 Sobic001G020900 Sobic001G020900 Sobic006G217950--Sobic001G020900 Sobic006G217950--Sobic004G020500 Sobic002G142550 Sobic002G142550 Sobic009G200750--Sobic002G142550 Sobic010G165925 Sobic010G165925 Sobic009G200750--Sobic010G165925 Sobic005G107250 Sobic005G107250 Sobic009G200750--Sobic005G107250 Sobic007G003250 Sobic007G003250 Sobic009G200750--Sobic007G003250 Sobic001G369701 Sobic001G369701 Sobic009G200750--Sobic001G369701 Sobic010G180300 Sobic010G180300 Sobic009G200750--Sobic010G180300 Sobic001G115200 Sobic001G115200 Sobic009G200750--Sobic001G115200 Sobic005G019650 Sobic005G019650 Sobic009G200750--Sobic005G019650 Sobic003G025500 Sobic003G025500 Sobic009G200750--Sobic003G025500 Sobic003G042000 Sobic003G042000 Sobic010G022350--Sobic003G042000 Sobic001G244800 Sobic001G244800 Sobic010G022350--Sobic001G244800 Sobic005G094266 Sobic005G094266 Sobic010G022350--Sobic005G094266 Sobic006G257250 Sobic006G257250 Sobic010G022350--Sobic006G257250 Sobic004G056350 Sobic004G056350 Sobic010G022350--Sobic004G056350 Sobic004G311550 Sobic004G311550 Sobic010G022350--Sobic004G311550 Sobic003G389601 Sobic003G389601 Sobic010G022350--Sobic003G389601 Sobic001G455400 Sobic001G455400 Sobic010G022350--Sobic001G455400 Sobic009G024166 Sobic009G024166 Sobic010G022350--Sobic009G024166 Sobic005G045400 Sobic005G045400 Sobic002G050450--Sobic005G045400 Sobic008G043000 Sobic008G043000 Sobic002G050450--Sobic008G043000 Sobic009G225250 Sobic009G225250 Sobic002G050450--Sobic009G225250 Sobic004G278300 Sobic004G278300 Sobic002G050450--Sobic004G278300 Sobic002G250700 Sobic002G250700 Sobic002G050450--Sobic002G250700 Sobic004G067050 Sobic004G067050 Sobic002G050450--Sobic004G067050 Sobic002G050450--Sobic003G389601 Sobic004G204700 Sobic004G204700 Sobic002G050450--Sobic004G204700 Sobic009G080500 Sobic009G080500 Sobic002G050450--Sobic009G080500 Sobic009G260800 Sobic009G260800 Sobic001G216900--Sobic009G260800 Sobic005G039350 Sobic005G039350 Sobic001G216900--Sobic005G039350 Sobic001G216900--Sobic010G022350 Sobic008G145400 Sobic008G145400 Sobic001G216900--Sobic008G145400 Sobic001G216900--Sobic005G094266 Sobic010G170800 Sobic010G170800 Sobic001G216900--Sobic010G170800 Sobic001G216900--Sobic003G389601 Sobic004G179100 Sobic004G179100 Sobic001G216900--Sobic004G179100 Sobic001G216900--Sobic003G417500
Octagon: transcription factors


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