Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G138700.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QIW2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G217950 - -
2 Sobic.004G204300 cyclin, putative, expressed K06627: cyclin-A
3 Sobic.009G200750 - -
4 Sobic.006G252532 - -
5 Sobic.008G110151 - -
6 Sobic.003G199650 - -
7 Sobic.004G020500 expressed protein -
8 Sobic.010G023066 - -
9 Sobic.003G188700 expressed protein -
10 Sobic.004G279900 tRNA-splicing endonuclease positive effector-related, putative, expressed K10706: SETX, senataxin
11 Sobic.005G071500 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -
12 Sobic.003G427400 signal recognition particle 54 kDa protein, putative, expressed K03106: SRP54, signal recognition particle subunit SRP54
13 Sobic.003G373700 - -
14 Sobic.005G032700 phospholipase, putative, expressed K16818: phospholipase A1
15 Sobic.003G077800 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@suppressor of G2 allele of SKP1, putative, expressed K12795: SUGT1, suppressor of G2 allele of SKP1
16 Sobic.010G043350 - -
17 Sobic.003G323400 - -
18 Sobic.010G165925 - -
19 Sobic.007G003250 - -
20 Sobic.007G047200 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G138700 Sobic001G138700 Sobic006G217950 Sobic006G217950 Sobic001G138700--Sobic006G217950 Sobic004G204300 Sobic004G204300 Sobic001G138700--Sobic004G204300 Sobic009G200750 Sobic009G200750 Sobic001G138700--Sobic009G200750 Sobic006G252532 Sobic006G252532 Sobic001G138700--Sobic006G252532 Sobic008G110151 Sobic008G110151 Sobic001G138700--Sobic008G110151 Sobic003G199650 Sobic003G199650 Sobic001G138700--Sobic003G199650 Sobic004G020500 Sobic004G020500 Sobic001G138700--Sobic004G020500 Sobic010G023066 Sobic010G023066 Sobic001G138700--Sobic010G023066 Sobic003G188700 Sobic003G188700 Sobic001G138700--Sobic003G188700 Sobic006G217950--Sobic001G138700 Sobic005G071500 Sobic005G071500 Sobic006G217950--Sobic005G071500 Sobic006G217950--Sobic004G204300 Sobic006G217950--Sobic009G200750 Sobic002G248201 Sobic002G248201 Sobic006G217950--Sobic002G248201 Sobic002G363466 Sobic002G363466 Sobic006G217950--Sobic002G363466 Sobic003G417500 Sobic003G417500 Sobic006G217950--Sobic003G417500 Sobic001G020900 Sobic001G020900 Sobic006G217950--Sobic001G020900 Sobic006G217950--Sobic004G020500 Sobic004G204300--Sobic001G138700 Sobic004G204300--Sobic010G023066 Sobic004G204300--Sobic005G071500 Sobic004G204300--Sobic003G417500 Sobic004G204300--Sobic006G217950 Sobic004G204300--Sobic009G200750 Sobic010G022350 Sobic010G022350 Sobic004G204300--Sobic010G022350 Sobic002G050450 Sobic002G050450 Sobic004G204300--Sobic002G050450 Sobic001G216900 Sobic001G216900 Sobic004G204300--Sobic001G216900 Sobic002G142550 Sobic002G142550 Sobic009G200750--Sobic002G142550 Sobic010G165925 Sobic010G165925 Sobic009G200750--Sobic010G165925 Sobic005G107250 Sobic005G107250 Sobic009G200750--Sobic005G107250 Sobic007G003250 Sobic007G003250 Sobic009G200750--Sobic007G003250 Sobic001G369701 Sobic001G369701 Sobic009G200750--Sobic001G369701 Sobic010G180300 Sobic010G180300 Sobic009G200750--Sobic010G180300 Sobic001G115200 Sobic001G115200 Sobic009G200750--Sobic001G115200 Sobic005G019650 Sobic005G019650 Sobic009G200750--Sobic005G019650 Sobic003G025500 Sobic003G025500 Sobic009G200750--Sobic003G025500 Sobic007G047200 Sobic007G047200 Sobic006G252532--Sobic007G047200 Sobic003G380700 Sobic003G380700 Sobic006G252532--Sobic003G380700 Sobic009G240100 Sobic009G240100 Sobic006G252532--Sobic009G240100 Sobic006G252532--Sobic008G110151 Sobic006G130700 Sobic006G130700 Sobic006G252532--Sobic006G130700 Sobic006G252532--Sobic003G188700 Sobic006G252532--Sobic003G199650 Sobic010G043350 Sobic010G043350 Sobic006G252532--Sobic010G043350 Sobic004G279900 Sobic004G279900 Sobic006G252532--Sobic004G279900 Sobic007G191150 Sobic007G191150 Sobic008G110151--Sobic007G191150 Sobic010G263151 Sobic010G263151 Sobic008G110151--Sobic010G263151 Sobic003G267400 Sobic003G267400 Sobic008G110151--Sobic003G267400 Sobic008G110151--Sobic003G188700 Sobic003G254400 Sobic003G254400 Sobic008G110151--Sobic003G254400 Sobic001G209000 Sobic001G209000 Sobic008G110151--Sobic001G209000 Sobic003G008400 Sobic003G008400 Sobic008G110151--Sobic003G008400 Sobic001G355850 Sobic001G355850 Sobic008G110151--Sobic001G355850 Sobic003G360500 Sobic003G360500 Sobic008G110151--Sobic003G360500 Sobic003G199650--Sobic010G165925 Sobic003G199650--Sobic010G263151 Sobic006G196800 Sobic006G196800 Sobic003G199650--Sobic006G196800 Sobic003G199650--Sobic007G003250 Sobic003G199650--Sobic001G369701 Sobic003G199650--Sobic002G142550 Sobic003G199650--Sobic005G107250 Sobic003G199650--Sobic003G267400 Sobic003G199650--Sobic003G188700 Sobic002G069700 Sobic002G069700 Sobic004G020500--Sobic002G069700 Sobic010G101350 Sobic010G101350 Sobic004G020500--Sobic010G101350 Sobic010G197632 Sobic010G197632 Sobic004G020500--Sobic010G197632 Sobic003G095301 Sobic003G095301 Sobic004G020500--Sobic003G095301 Sobic001G218300 Sobic001G218300 Sobic004G020500--Sobic001G218300 Sobic004G177050 Sobic004G177050 Sobic004G020500--Sobic004G177050 Sobic005G094266 Sobic005G094266 Sobic004G020500--Sobic005G094266 Sobic009G110300 Sobic009G110300 Sobic004G020500--Sobic009G110300 Sobic003G358500 Sobic003G358500 Sobic004G020500--Sobic003G358500 Sobic010G023066--Sobic005G071500 Sobic010G023066--Sobic003G417500 Sobic010G023066--Sobic004G204300 Sobic010G023066--Sobic004G020500 Sobic010G023066--Sobic001G138700 Sobic010G124800 Sobic010G124800 Sobic010G023066--Sobic010G124800 Sobic010G023066--Sobic001G216900 Sobic010G023066--Sobic006G217950 Sobic010G023066--Sobic010G022350 Sobic003G188700--Sobic010G263151 Sobic003G188700--Sobic006G196800 Sobic003G188700--Sobic010G165925 Sobic003G188700--Sobic007G003250 Sobic003G188700--Sobic003G267400 Sobic003G188700--Sobic001G369701 Sobic006G007700 Sobic006G007700 Sobic003G188700--Sobic006G007700 Sobic003G419100 Sobic003G419100 Sobic003G188700--Sobic003G419100 Sobic003G188700--Sobic001G209000
Octagon: transcription factors


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