Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G242900.1
Synonym Sb09g029450
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YW44
Pfam -
Panther DB PTHR35738 PTHR35738:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G27930 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g50200.2 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a036687
Brachypodium KQK04728
Barley HORVU1Hr1G091210.4 , HORVU1Hr1G091210.5 , HORVU1Hr1G091210.6 , HORVU1Hr1G091210.7 , HORVU1Hr1G091210.1 , HORVU1Hr1G091210.2 , HORVU1Hr1G091210.3 , HORVU1Hr1G091210.8 , HORVU1Hr1G091210.9 , HORVU1Hr1G091210.16 , HORVU1Hr1G091210.17 , HORVU1Hr1G091210.14 , HORVU1Hr1G091210.15 , HORVU1Hr1G091210.12 , HORVU1Hr1G091210.13 , HORVU1Hr1G091210.10 , HORVU1Hr1G091210.18
Wheat TraesCS1B02G446700 , TraesCS1A02G416500 , TraesCSU02G047900 , TraesCS1D02G424300 , TraesCSU02G047900 , TraesCS3D02G048100
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G108401 - -
2 Sobic.009G163000 - -
3 Sobic.006G128450 - -
4 Sobic.010G164600 resistance protein, putative, expressed -
5 Sobic.003G003900 - -
6 Sobic.005G214900 cytochrome P450, putative, expressed -
7 Sobic.001G310133 - -
8 Sobic.010G034700 transferase family protein, putative, expressed -
9 Sobic.008G163750 - -
10 Sobic.001G070900 expressed protein -
11 Sobic.005G035850 - -
12 Sobic.002G113066 - -
13 Sobic.004G147600 U-box domain-containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.002G180200 - -
15 Sobic.003G077001 - -
16 Sobic.001G311400 - -
17 Sobic.008G098032 - -
18 Sobic.004G139800 - -
19 Sobic.006G031866 - -
20 Sobic.005G159100 dirigent-like protein pDIR17, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G242900 Sobic009G242900 Sobic003G108401 Sobic003G108401 Sobic009G242900--Sobic003G108401 Sobic009G163000 Sobic009G163000 Sobic009G242900--Sobic009G163000 Sobic006G128450 Sobic006G128450 Sobic009G242900--Sobic006G128450 Sobic010G164600 Sobic010G164600 Sobic009G242900--Sobic010G164600 Sobic003G003900 Sobic003G003900 Sobic009G242900--Sobic003G003900 Sobic005G214900 Sobic005G214900 Sobic009G242900--Sobic005G214900 Sobic001G310133 Sobic001G310133 Sobic009G242900--Sobic001G310133 Sobic010G034700 Sobic010G034700 Sobic009G242900--Sobic010G034700 Sobic008G163750 Sobic008G163750 Sobic009G242900--Sobic008G163750 Sobic003G108401--Sobic009G163000 Sobic003G108401--Sobic006G128450 Sobic002G180200 Sobic002G180200 Sobic003G108401--Sobic002G180200 Sobic004G343733 Sobic004G343733 Sobic003G108401--Sobic004G343733 Sobic006G118850 Sobic006G118850 Sobic003G108401--Sobic006G118850 Sobic003G108401--Sobic010G164600 Sobic001G070900 Sobic001G070900 Sobic003G108401--Sobic001G070900 Sobic003G108401--Sobic010G034700 Sobic003G108401--Sobic003G003900 Sobic009G163000--Sobic003G108401 Sobic009G163000--Sobic010G164600 Sobic009G163000--Sobic002G180200 Sobic009G163000--Sobic001G070900 Sobic009G163000--Sobic003G003900 Sobic009G163000--Sobic004G343733 Sobic005G120101 Sobic005G120101 Sobic009G163000--Sobic005G120101 Sobic009G163000--Sobic006G128450 Sobic008G052700 Sobic008G052700 Sobic009G163000--Sobic008G052700 Sobic006G128450--Sobic002G180200 Sobic006G128450--Sobic006G118850 Sobic006G128450--Sobic003G108401 Sobic002G076450 Sobic002G076450 Sobic006G128450--Sobic002G076450 Sobic006G128450--Sobic004G343733 Sobic001G311400 Sobic001G311400 Sobic006G128450--Sobic001G311400 Sobic006G128450--Sobic009G163000 Sobic008G119100 Sobic008G119100 Sobic006G128450--Sobic008G119100 Sobic003G092150 Sobic003G092150 Sobic006G128450--Sobic003G092150 Sobic010G164600--Sobic003G003900 Sobic001G415901 Sobic001G415901 Sobic010G164600--Sobic001G415901 Sobic003G077001 Sobic003G077001 Sobic010G164600--Sobic003G077001 Sobic002G113066 Sobic002G113066 Sobic010G164600--Sobic002G113066 Sobic010G164600--Sobic009G163000 Sobic001G120850 Sobic001G120850 Sobic010G164600--Sobic001G120850 Sobic006G221900 Sobic006G221900 Sobic010G164600--Sobic006G221900 Sobic005G159100 Sobic005G159100 Sobic010G164600--Sobic005G159100 Sobic010G216500 Sobic010G216500 Sobic010G164600--Sobic010G216500 Sobic003G003900--Sobic002G113066 Sobic003G003900--Sobic003G077001 Sobic005G035850 Sobic005G035850 Sobic003G003900--Sobic005G035850 Sobic003G003900--Sobic005G214900 Sobic003G003900--Sobic001G310133 Sobic003G003900--Sobic001G415901 Sobic004G139800 Sobic004G139800 Sobic003G003900--Sobic004G139800 Sobic003G003900--Sobic008G163750 Sobic003G003900--Sobic001G120850 Sobic005G214900--Sobic005G035850 Sobic005G214900--Sobic003G003900 Sobic005G214900--Sobic002G113066 Sobic005G214900--Sobic001G310133 Sobic005G214900--Sobic004G139800 Sobic005G214900--Sobic003G077001 Sobic008G098032 Sobic008G098032 Sobic005G214900--Sobic008G098032 Sobic005G214900--Sobic008G163750 Sobic003G152050 Sobic003G152050 Sobic005G214900--Sobic003G152050 Sobic001G310133--Sobic005G035850 Sobic001G310133--Sobic004G139800 Sobic001G310133--Sobic008G098032 Sobic001G310133--Sobic005G214900 Sobic004G019250 Sobic004G019250 Sobic001G310133--Sobic004G019250 Sobic001G310133--Sobic003G003900 Sobic004G087750 Sobic004G087750 Sobic001G310133--Sobic004G087750 Sobic009G174200 Sobic009G174200 Sobic001G310133--Sobic009G174200 Sobic001G310133--Sobic003G152050 Sobic005G134900 Sobic005G134900 Sobic010G034700--Sobic005G134900 Sobic002G059700 Sobic002G059700 Sobic010G034700--Sobic002G059700 Sobic001G230600 Sobic001G230600 Sobic010G034700--Sobic001G230600 Sobic003G314566 Sobic003G314566 Sobic010G034700--Sobic003G314566 Sobic001G209550 Sobic001G209550 Sobic010G034700--Sobic001G209550 Sobic004G184600 Sobic004G184600 Sobic010G034700--Sobic004G184600 Sobic010G034700--Sobic010G164600 Sobic010G197566 Sobic010G197566 Sobic010G034700--Sobic010G197566 Sobic006G147101 Sobic006G147101 Sobic010G034700--Sobic006G147101 Sobic008G163750--Sobic005G035850 Sobic008G163750--Sobic003G003900 Sobic008G163750--Sobic005G214900 Sobic008G163750--Sobic001G310133 Sobic008G163750--Sobic002G113066 Sobic008G163750--Sobic004G139800 Sobic008G163750--Sobic003G077001 Sobic008G163750--Sobic008G098032 Sobic008G163750--Sobic004G019250
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.