Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G004001.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt C5Z251
Pfam -
Panther DB PTHR33074 PTHR33074:SF7
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g38470.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G052500 - -
2 Sobic.006G166300 WRKY36, expressed -
3 Sobic.007G210400 lipoxygenase, chloroplast precursor, putative, expressed K00454: lipoxygenase
4 Sobic.002G138500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@-(PubMedID : 27329702)@expressed protein -
5 Sobic.008G168000 Methyltransferase small domain containing protein, expressed K02493: hemK, prmC, release factor glutamine methyltransferase
6 Sobic.005G037500 expressed protein -
7 Sobic.003G245700 3-5 exonuclease domain-containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.002G037000 ZOS7-02 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
9 Sobic.006G185400 - -
10 Sobic.004G330500 expressed protein -
11 Sobic.005G189400 MBTB51 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
12 Sobic.006G090201 - -
13 Sobic.007G152200 cytokinesis negative regulator RCP1, putative, expressed -
14 Sobic.008G023500 expressed protein -
15 Sobic.003G178200 tetratricopeptide repeat containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.001G339900 - -
17 Sobic.002G034400 expressed protein -
18 Sobic.001G172900 - -
19 Sobic.009G010800 expressed protein -
20 Sobic.002G205201 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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