Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G015600.1
Synonym Sb01g001530
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WSZ4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g18070.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a009000
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G044100 Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@cytochrome P450, putative, expressed -
2 Sobic.008G009450 - -
3 Sobic.002G237500 - -
4 Sobic.010G088400 phosphate-induced protein 1 conserved region domain containing protein, expressed -
5 Sobic.009G237900 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.006G138700 - -
7 Sobic.006G077100 serine/threonine-protein kinase receptor precursor, putative, expressed -
8 Sobic.007G165000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
9 Sobic.009G258700 SCP-like extracellular protein, expressed -
10 Sobic.009G017300 - -
11 Sobic.008G116900 OsFBL38 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
12 Sobic.002G069232 - -
13 Sobic.002G349800 ubiquitin-like protein SMT3, putative, expressed K12160: SUMO, small ubiquitin-related modifier
14 Sobic.005G183000 resistance protein, putative, expressed -
15 Sobic.007G139800 - -
16 Sobic.009G239000 OsMADS78 - MADS-box family gene with M-alpha type-box, expressed -
17 Sobic.004G133800 expressed protein -
18 Sobic.002G221500 ANTH domain containing protein, expressed -
19 Sobic.002G008000 DnaK family protein, putative, expressed -
20 Sobic.001G474001 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G015600 Sobic001G015600 Sobic001G044100 Sobic001G044100 Sobic001G015600--Sobic001G044100 Sobic008G009450 Sobic008G009450 Sobic001G015600--Sobic008G009450 Sobic002G237500 Sobic002G237500 Sobic001G015600--Sobic002G237500 Sobic010G088400 Sobic010G088400 Sobic001G015600--Sobic010G088400 Sobic009G237900 Sobic009G237900 Sobic001G015600--Sobic009G237900 Sobic006G138700 Sobic006G138700 Sobic001G015600--Sobic006G138700 Sobic006G077100 Sobic006G077100 Sobic001G015600--Sobic006G077100 Sobic007G165000 Sobic007G165000 Sobic001G015600--Sobic007G165000 Sobic009G258700 Sobic009G258700 Sobic001G015600--Sobic009G258700 Sobic001G044100--Sobic008G009450 Sobic001G044100--Sobic010G088400 Sobic001G044100--Sobic001G015600 Sobic001G393600 Sobic001G393600 Sobic001G044100--Sobic001G393600 Sobic002G156700 Sobic002G156700 Sobic001G044100--Sobic002G156700 Sobic005G183000 Sobic005G183000 Sobic001G044100--Sobic005G183000 Sobic001G270200 Sobic001G270200 Sobic001G044100--Sobic001G270200 Sobic001G044100--Sobic007G165000 Sobic001G364200 Sobic001G364200 Sobic001G044100--Sobic001G364200 Sobic008G009450--Sobic001G044100 Sobic008G009450--Sobic007G165000 Sobic008G009450--Sobic001G015600 Sobic008G009450--Sobic001G270200 Sobic008G009450--Sobic010G088400 Sobic003G161950 Sobic003G161950 Sobic008G009450--Sobic003G161950 Sobic008G009450--Sobic001G393600 Sobic004G133301 Sobic004G133301 Sobic008G009450--Sobic004G133301 Sobic008G009450--Sobic001G364200 Sobic002G237500--Sobic001G015600 Sobic002G398400 Sobic002G398400 Sobic002G237500--Sobic002G398400 Sobic008G183800 Sobic008G183800 Sobic002G237500--Sobic008G183800 Sobic001G474001 Sobic001G474001 Sobic002G237500--Sobic001G474001 Sobic003G315600 Sobic003G315600 Sobic002G237500--Sobic003G315600 Sobic002G237500--Sobic009G237900 Sobic009G118100 Sobic009G118100 Sobic002G237500--Sobic009G118100 Sobic010G062600 Sobic010G062600 Sobic002G237500--Sobic010G062600 Sobic002G349800 Sobic002G349800 Sobic002G237500--Sobic002G349800 Sobic010G088400--Sobic001G044100 Sobic010G088400--Sobic008G009450 Sobic010G088400--Sobic001G015600 Sobic010G088400--Sobic007G165000 Sobic005G019900 Sobic005G019900 Sobic010G088400--Sobic005G019900 Sobic010G088400--Sobic002G156700 Sobic010G088400--Sobic001G270200 Sobic010G088400--Sobic005G183000 Sobic002G407500 Sobic002G407500 Sobic010G088400--Sobic002G407500 Sobic010G032200 Sobic010G032200 Sobic009G237900--Sobic010G032200 Sobic007G119101 Sobic007G119101 Sobic009G237900--Sobic007G119101 Sobic004G133800 Sobic004G133800 Sobic009G237900--Sobic004G133800 Sobic002G031301 Sobic002G031301 Sobic009G237900--Sobic002G031301 Sobic005G072850 Sobic005G072850 Sobic009G237900--Sobic005G072850 Sobic010G015100 Sobic010G015100 Sobic009G237900--Sobic010G015100 Sobic010G201100 Sobic010G201100 Sobic009G237900--Sobic010G201100 Sobic001G359601 Sobic001G359601 Sobic009G237900--Sobic001G359601 Sobic009G111700 Sobic009G111700 Sobic009G237900--Sobic009G111700 Sobic009G017300 Sobic009G017300 Sobic006G138700--Sobic009G017300 Sobic006G138700--Sobic006G077100 Sobic006G138700--Sobic009G258700 Sobic002G069232 Sobic002G069232 Sobic006G138700--Sobic002G069232 Sobic009G239000 Sobic009G239000 Sobic006G138700--Sobic009G239000 Sobic008G116900 Sobic008G116900 Sobic006G138700--Sobic008G116900 Sobic006G138700--Sobic004G133800 Sobic006G138700--Sobic001G359601 Sobic006G138700--Sobic009G237900 Sobic006G077900 Sobic006G077900 Sobic006G077100--Sobic006G077900 Sobic006G077100--Sobic009G239000 Sobic006G077100--Sobic006G138700 Sobic006G077100--Sobic002G069232 Sobic006G077100--Sobic008G116900 Sobic004G274000 Sobic004G274000 Sobic006G077100--Sobic004G274000 Sobic010G111700 Sobic010G111700 Sobic006G077100--Sobic010G111700 Sobic004G286351 Sobic004G286351 Sobic006G077100--Sobic004G286351 Sobic007G035100 Sobic007G035100 Sobic006G077100--Sobic007G035100 Sobic007G165000--Sobic008G009450 Sobic001G288900 Sobic001G288900 Sobic007G165000--Sobic001G288900 Sobic007G165000--Sobic001G270200 Sobic007G165000--Sobic001G044100 Sobic007G165000--Sobic010G088400 Sobic007G165000--Sobic001G015600 Sobic006G240650 Sobic006G240650 Sobic007G165000--Sobic006G240650 Sobic007G165000--Sobic004G133301 Sobic003G125000 Sobic003G125000 Sobic007G165000--Sobic003G125000 Sobic009G258700--Sobic006G138700 Sobic002G221500 Sobic002G221500 Sobic009G258700--Sobic002G221500 Sobic009G258700--Sobic002G069232 Sobic009G258700--Sobic006G077100 Sobic009G258700--Sobic009G237900 Sobic009G258700--Sobic004G133800 Sobic009G258700--Sobic008G116900 Sobic009G258700--Sobic009G239000 Sobic009G258700--Sobic002G349800
Octagon: transcription factors


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