Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G114600.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6QIG8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g50600.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G122900 lysine ketoglutarate reductase trans-splicing related 1, putative, expressed -
2 Sobic.006G057300 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@leucoanthocyanidin dioxygenase, putative, expressed -
3 Sobic.009G080233 - -
4 Sobic.004G101100 STIGL3 - Stigma-specific Stig1 family protein precursor, putative, expressed -
5 Sobic.004G281600 uncharacterized mscS family protein, putative, expressed K16052: ynaI, MscS family membrane protein
6 Sobic.010G129000 aspartic proteinase nepenthesin-2 precursor, putative, expressed -
7 Sobic.007G136300 no apical meristem protein, putative, expressed -
8 Sobic.005G123000 gibberellin response modulator protein, putative, expressed -
9 Sobic.003G152050 - -
10 Sobic.002G199200 No apical meristem protein, putative, expressed -
11 Sobic.003G223600 hydroquinone glucosyltransferase, putative, expressed K08237: hydroquinone glucosyltransferase
12 Sobic.004G043301 - -
13 Sobic.009G081700 C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein, expressed -
14 Sobic.004G087750 - -
15 Sobic.009G174200 S-domain receptor-like protein kinase, putative, expressed -
16 Sobic.004G019250 - -
17 Sobic.004G139800 - -
18 Sobic.008G098032 - -
19 Sobic.005G214900 cytochrome P450, putative, expressed -
20 Sobic.005G035850 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G114600 Sobic001G114600 Sobic002G122900 Sobic002G122900 Sobic001G114600--Sobic002G122900 Sobic006G057300 Sobic006G057300 Sobic001G114600--Sobic006G057300 Sobic009G080233 Sobic009G080233 Sobic001G114600--Sobic009G080233 Sobic004G101100 Sobic004G101100 Sobic001G114600--Sobic004G101100 Sobic004G281600 Sobic004G281600 Sobic001G114600--Sobic004G281600 Sobic010G129000 Sobic010G129000 Sobic001G114600--Sobic010G129000 Sobic007G136300 Sobic007G136300 Sobic001G114600--Sobic007G136300 Sobic005G123000 Sobic005G123000 Sobic001G114600--Sobic005G123000 Sobic003G152050 Sobic003G152050 Sobic001G114600--Sobic003G152050 Sobic002G122900--Sobic006G057300 Sobic002G122900--Sobic009G080233 Sobic006G246800 Sobic006G246800 Sobic002G122900--Sobic006G246800 Sobic006G035950 Sobic006G035950 Sobic002G122900--Sobic006G035950 Sobic004G355101 Sobic004G355101 Sobic002G122900--Sobic004G355101 Sobic003G014832 Sobic003G014832 Sobic002G122900--Sobic003G014832 Sobic001G285700 Sobic001G285700 Sobic002G122900--Sobic001G285700 Sobic004G342700 Sobic004G342700 Sobic002G122900--Sobic004G342700 Sobic008G176401 Sobic008G176401 Sobic002G122900--Sobic008G176401 Sobic006G057300--Sobic002G122900 Sobic006G057300--Sobic004G101100 Sobic006G057300--Sobic001G285700 Sobic006G057300--Sobic006G035950 Sobic001G121000 Sobic001G121000 Sobic006G057300--Sobic001G121000 Sobic006G057300--Sobic006G246800 Sobic006G057300--Sobic004G355101 Sobic010G228300 Sobic010G228300 Sobic006G057300--Sobic010G228300 Sobic007G215300 Sobic007G215300 Sobic006G057300--Sobic007G215300 Sobic004G087750 Sobic004G087750 Sobic009G080233--Sobic004G087750 Sobic009G174200 Sobic009G174200 Sobic009G080233--Sobic009G174200 Sobic008G098032 Sobic008G098032 Sobic009G080233--Sobic008G098032 Sobic004G139800 Sobic004G139800 Sobic009G080233--Sobic004G139800 Sobic004G019250 Sobic004G019250 Sobic009G080233--Sobic004G019250 Sobic005G035850 Sobic005G035850 Sobic009G080233--Sobic005G035850 Sobic009G080233--Sobic008G176401 Sobic001G310133 Sobic001G310133 Sobic009G080233--Sobic001G310133 Sobic009G080233--Sobic004G342700 Sobic004G101100--Sobic006G057300 Sobic006G194700 Sobic006G194700 Sobic004G101100--Sobic006G194700 Sobic004G072400 Sobic004G072400 Sobic004G101100--Sobic004G072400 Sobic004G233900 Sobic004G233900 Sobic004G101100--Sobic004G233900 Sobic009G133100 Sobic009G133100 Sobic004G101100--Sobic009G133100 Sobic001G160400 Sobic001G160400 Sobic004G101100--Sobic001G160400 Sobic001G058000 Sobic001G058000 Sobic004G101100--Sobic001G058000 Sobic008G010700 Sobic008G010700 Sobic004G101100--Sobic008G010700 Sobic004G101100--Sobic002G122900 Sobic010G081800 Sobic010G081800 Sobic004G281600--Sobic010G081800 Sobic004G281600--Sobic001G114600 Sobic004G281600--Sobic002G122900 Sobic004G281600--Sobic006G057300 Sobic002G384100 Sobic002G384100 Sobic004G281600--Sobic002G384100 Sobic004G281600--Sobic004G101100 Sobic002G241700 Sobic002G241700 Sobic004G281600--Sobic002G241700 Sobic009G194100 Sobic009G194100 Sobic004G281600--Sobic009G194100 Sobic002G316900 Sobic002G316900 Sobic004G281600--Sobic002G316900 Sobic004G043301 Sobic004G043301 Sobic010G129000--Sobic004G043301 Sobic009G081700 Sobic009G081700 Sobic010G129000--Sobic009G081700 Sobic002G199200 Sobic002G199200 Sobic010G129000--Sobic002G199200 Sobic010G128800 Sobic010G128800 Sobic010G129000--Sobic010G128800 Sobic002G132500 Sobic002G132500 Sobic010G129000--Sobic002G132500 Sobic005G037850 Sobic005G037850 Sobic010G129000--Sobic005G037850 Sobic006G141900 Sobic006G141900 Sobic010G129000--Sobic006G141900 Sobic010G129000--Sobic001G114600 Sobic002G182601 Sobic002G182601 Sobic010G129000--Sobic002G182601 Sobic003G223600 Sobic003G223600 Sobic007G136300--Sobic003G223600 Sobic007G136300--Sobic010G128800 Sobic007G136300--Sobic001G114600 Sobic004G093300 Sobic004G093300 Sobic007G136300--Sobic004G093300 Sobic003G123800 Sobic003G123800 Sobic007G136300--Sobic003G123800 Sobic008G122200 Sobic008G122200 Sobic007G136300--Sobic008G122200 Sobic004G022700 Sobic004G022700 Sobic007G136300--Sobic004G022700 Sobic004G279900 Sobic004G279900 Sobic007G136300--Sobic004G279900 Sobic009G005000 Sobic009G005000 Sobic007G136300--Sobic009G005000 Sobic009G028700 Sobic009G028700 Sobic005G123000--Sobic009G028700 Sobic005G214900 Sobic005G214900 Sobic005G123000--Sobic005G214900 Sobic005G123000--Sobic009G080233 Sobic005G123000--Sobic003G152050 Sobic005G123000--Sobic004G139800 Sobic005G123000--Sobic008G098032 Sobic005G123000--Sobic005G035850 Sobic005G123000--Sobic004G087750 Sobic005G123000--Sobic009G174200 Sobic003G152050--Sobic005G035850 Sobic003G152050--Sobic004G139800 Sobic003G152050--Sobic008G098032 Sobic003G152050--Sobic001G310133 Sobic003G152050--Sobic005G214900 Sobic003G152050--Sobic004G019250 Sobic003G152050--Sobic004G087750 Sobic003G152050--Sobic009G174200 Sobic003G003900 Sobic003G003900 Sobic003G152050--Sobic003G003900
Octagon: transcription factors


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