Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G101100.2
Synonym
Functional annotation STIGL3 - Stigma-specific Stig1 family protein precursor, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RLQ4
Pfam PF04885
Panther DB PTHR33227
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G53130 : Stigma-specific Stig1 family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g18940.1 : STIGL3 - Stigma-specific Stig1 family protein precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G057300 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@leucoanthocyanidin dioxygenase, putative, expressed -
2 Sobic.006G194700 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10663: E3 ubiquitin-protein ligase ATL4
3 Sobic.004G072400 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
4 Sobic.004G233900 CRAL/TRIO domain containing protein, expressed -
5 Sobic.009G133100 cytochrome P450 72A1, putative, expressed -
6 Sobic.001G160400 integral membrane protein DUF6 containing protein, expressed -
7 Sobic.001G058000 - -
8 Sobic.008G010700 RGH1A, putative, expressed -
9 Sobic.002G122900 lysine ketoglutarate reductase trans-splicing related 1, putative, expressed -
10 Sobic.010G081800 bZIP transcription factor, putative, expressed K14432: ABA responsive element binding factor
11 Sobic.001G392000 WD40-like Beta Propeller Repeat family protein, expressed -
12 Sobic.007G131300 endoglucanase, putative, expressed -
13 Sobic.008G055650 - -
14 Sobic.002G241700 phosphatidylinositol transfer, putative, expressed -
15 Sobic.006G069400 expressed protein -
16 Sobic.005G050900 - -
17 Sobic.009G190900 expressed protein -
18 Sobic.005G219900 NB-ARC domain containing protein, expressed -
19 Sobic.009G142700 - -
20 Sobic.001G364200 cytochrome P450, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G101100 Sobic004G101100 Sobic006G057300 Sobic006G057300 Sobic004G101100--Sobic006G057300 Sobic006G194700 Sobic006G194700 Sobic004G101100--Sobic006G194700 Sobic004G072400 Sobic004G072400 Sobic004G101100--Sobic004G072400 Sobic004G233900 Sobic004G233900 Sobic004G101100--Sobic004G233900 Sobic009G133100 Sobic009G133100 Sobic004G101100--Sobic009G133100 Sobic001G160400 Sobic001G160400 Sobic004G101100--Sobic001G160400 Sobic001G058000 Sobic001G058000 Sobic004G101100--Sobic001G058000 Sobic008G010700 Sobic008G010700 Sobic004G101100--Sobic008G010700 Sobic002G122900 Sobic002G122900 Sobic004G101100--Sobic002G122900 Sobic006G057300--Sobic002G122900 Sobic006G057300--Sobic004G101100 Sobic001G285700 Sobic001G285700 Sobic006G057300--Sobic001G285700 Sobic006G035950 Sobic006G035950 Sobic006G057300--Sobic006G035950 Sobic001G121000 Sobic001G121000 Sobic006G057300--Sobic001G121000 Sobic006G246800 Sobic006G246800 Sobic006G057300--Sobic006G246800 Sobic004G355101 Sobic004G355101 Sobic006G057300--Sobic004G355101 Sobic010G228300 Sobic010G228300 Sobic006G057300--Sobic010G228300 Sobic007G215300 Sobic007G215300 Sobic006G057300--Sobic007G215300 Sobic006G194700--Sobic004G101100 Sobic006G194700--Sobic004G072400 Sobic001G392000 Sobic001G392000 Sobic006G194700--Sobic001G392000 Sobic006G194700--Sobic001G058000 Sobic006G194700--Sobic001G160400 Sobic006G194700--Sobic004G233900 Sobic006G069400 Sobic006G069400 Sobic006G194700--Sobic006G069400 Sobic006G194700--Sobic008G010700 Sobic005G005800 Sobic005G005800 Sobic006G194700--Sobic005G005800 Sobic004G072400--Sobic009G133100 Sobic004G072400--Sobic001G058000 Sobic001G364200 Sobic001G364200 Sobic004G072400--Sobic001G364200 Sobic007G131300 Sobic007G131300 Sobic004G072400--Sobic007G131300 Sobic008G055650 Sobic008G055650 Sobic004G072400--Sobic008G055650 Sobic004G072400--Sobic004G101100 Sobic005G050900 Sobic005G050900 Sobic004G072400--Sobic005G050900 Sobic004G072400--Sobic001G392000 Sobic004G072400--Sobic004G233900 Sobic004G233900--Sobic009G133100 Sobic004G233900--Sobic004G072400 Sobic004G233900--Sobic001G058000 Sobic004G233900--Sobic004G101100 Sobic004G233900--Sobic001G364200 Sobic004G233900--Sobic007G131300 Sobic004G133301 Sobic004G133301 Sobic004G233900--Sobic004G133301 Sobic001G270200 Sobic001G270200 Sobic004G233900--Sobic001G270200 Sobic001G393600 Sobic001G393600 Sobic004G233900--Sobic001G393600 Sobic009G133100--Sobic007G131300 Sobic009G133100--Sobic004G072400 Sobic010G065500 Sobic010G065500 Sobic009G133100--Sobic010G065500 Sobic009G133100--Sobic001G364200 Sobic002G070400 Sobic002G070400 Sobic009G133100--Sobic002G070400 Sobic009G133100--Sobic008G055650 Sobic005G030200 Sobic005G030200 Sobic009G133100--Sobic005G030200 Sobic008G147800 Sobic008G147800 Sobic009G133100--Sobic008G147800 Sobic005G005100 Sobic005G005100 Sobic009G133100--Sobic005G005100 Sobic001G303600 Sobic001G303600 Sobic001G160400--Sobic001G303600 Sobic001G160400--Sobic004G101100 Sobic001G160400--Sobic004G072400 Sobic001G160400--Sobic001G392000 Sobic001G160400--Sobic006G057300 Sobic003G125000 Sobic003G125000 Sobic001G160400--Sobic003G125000 Sobic001G160400--Sobic008G010700 Sobic001G160400--Sobic006G194700 Sobic001G160400--Sobic001G058000 Sobic001G058000--Sobic004G072400 Sobic001G058000--Sobic009G133100 Sobic001G058000--Sobic004G233900 Sobic001G058000--Sobic001G364200 Sobic009G190900 Sobic009G190900 Sobic001G058000--Sobic009G190900 Sobic001G058000--Sobic005G050900 Sobic001G058000--Sobic004G101100 Sobic001G058000--Sobic007G131300 Sobic001G058000--Sobic005G005800 Sobic008G010700--Sobic001G392000 Sobic008G010700--Sobic001G303600 Sobic008G010700--Sobic004G072400 Sobic004G126200 Sobic004G126200 Sobic008G010700--Sobic004G126200 Sobic008G010700--Sobic004G101100 Sobic008G010700--Sobic001G160400 Sobic003G238200 Sobic003G238200 Sobic008G010700--Sobic003G238200 Sobic004G012200 Sobic004G012200 Sobic008G010700--Sobic004G012200 Sobic005G219900 Sobic005G219900 Sobic008G010700--Sobic005G219900 Sobic002G122900--Sobic006G057300 Sobic009G080233 Sobic009G080233 Sobic002G122900--Sobic009G080233 Sobic002G122900--Sobic006G246800 Sobic002G122900--Sobic006G035950 Sobic002G122900--Sobic004G355101 Sobic003G014832 Sobic003G014832 Sobic002G122900--Sobic003G014832 Sobic002G122900--Sobic001G285700 Sobic004G342700 Sobic004G342700 Sobic002G122900--Sobic004G342700 Sobic008G176401 Sobic008G176401 Sobic002G122900--Sobic008G176401
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.