Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G069400.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RCS2
Pfam -
Panther DB PTHR34120
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g33670.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a011512
Brachypodium KQJ82515
Barley HORVU2Hr1G073050.5 , HORVU2Hr1G073050.4 , HORVU2Hr1G073050.1 , HORVU2Hr1G073050.3 , HORVU2Hr1G073050.2
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G212800 kinesin motor domain containing protein, putative, expressed K10401: kinesin family member 18/19
2 Sobic.007G193500 Highest expression level in primordial inflorescence(PubMedID : 27501690)@"GW8/OsPL16(Ortholog in rice:Wang et al., 2012)"(PubMedID : 31659910)@OsSPL16 - SBP-box gene family member, expressed -
3 Sobic.009G133100 cytochrome P450 72A1, putative, expressed -
4 Sobic.001G022000 hydrolase, putative, expressed K14664: IAA-amino acid hydrolase
5 Sobic.005G030200 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
6 Sobic.008G045232 - -
7 Sobic.005G085800 expressed protein -
8 Sobic.002G289701 - -
9 Sobic.009G196100 dof zinc finger domain containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.008G087000 POLA2 - Putative DNA polymerase alpha complex subunit, expressed K02321: DNA polymerase alpha subunit B
11 Sobic.005G050900 - -
12 Sobic.005G205000 F-box/LRR-repeat protein 3, putative, expressed K10268: F-box and leucine-rich repeat protein 2/20
13 Sobic.007G131300 endoglucanase, putative, expressed -
14 Sobic.002G384800 pentatricopeptide, putative, expressed -
15 Sobic.001G482500 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, family 1, putative, expressed -
16 Sobic.009G174833 - -
17 Sobic.002G191300 expressed protein -
18 Sobic.008G053000 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
19 Sobic.010G065500 BHLH transcription factor, putative, expressed -
20 Sobic.002G237600 male sterility protein, putative, expressed K13356: alcohol-forming fatty acyl-CoA reductase


Gene co-expression network
sample Sobic006G069400 Sobic006G069400 Sobic003G212800 Sobic003G212800 Sobic006G069400--Sobic003G212800 Sobic007G193500 Sobic007G193500 Sobic006G069400--Sobic007G193500 Sobic009G133100 Sobic009G133100 Sobic006G069400--Sobic009G133100 Sobic001G022000 Sobic001G022000 Sobic006G069400--Sobic001G022000 Sobic005G030200 Sobic005G030200 Sobic006G069400--Sobic005G030200 Sobic008G045232 Sobic008G045232 Sobic006G069400--Sobic008G045232 Sobic005G085800 Sobic005G085800 Sobic006G069400--Sobic005G085800 Sobic002G289701 Sobic002G289701 Sobic006G069400--Sobic002G289701 Sobic009G196100 Sobic009G196100 Sobic006G069400--Sobic009G196100 Sobic003G212800--Sobic006G069400 Sobic003G212800--Sobic007G193500 Sobic003G212800--Sobic009G133100 Sobic003G212800--Sobic005G085800 Sobic002G384800 Sobic002G384800 Sobic003G212800--Sobic002G384800 Sobic004G290400 Sobic004G290400 Sobic003G212800--Sobic004G290400 Sobic001G482500 Sobic001G482500 Sobic003G212800--Sobic001G482500 Sobic003G212800--Sobic008G045232 Sobic002G267300 Sobic002G267300 Sobic003G212800--Sobic002G267300 Sobic007G193500--Sobic008G045232 Sobic007G193500--Sobic005G085800 Sobic007G193500--Sobic002G289701 Sobic008G053000 Sobic008G053000 Sobic007G193500--Sobic008G053000 Sobic007G193500--Sobic005G030200 Sobic001G152500 Sobic001G152500 Sobic007G193500--Sobic001G152500 Sobic001G189800 Sobic001G189800 Sobic007G193500--Sobic001G189800 Sobic007G007650 Sobic007G007650 Sobic007G193500--Sobic007G007650 Sobic007G193500--Sobic001G482500 Sobic007G131300 Sobic007G131300 Sobic009G133100--Sobic007G131300 Sobic004G072400 Sobic004G072400 Sobic009G133100--Sobic004G072400 Sobic010G065500 Sobic010G065500 Sobic009G133100--Sobic010G065500 Sobic001G364200 Sobic001G364200 Sobic009G133100--Sobic001G364200 Sobic002G070400 Sobic002G070400 Sobic009G133100--Sobic002G070400 Sobic008G055650 Sobic008G055650 Sobic009G133100--Sobic008G055650 Sobic009G133100--Sobic005G030200 Sobic008G147800 Sobic008G147800 Sobic009G133100--Sobic008G147800 Sobic005G005100 Sobic005G005100 Sobic009G133100--Sobic005G005100 Sobic003G391700 Sobic003G391700 Sobic001G022000--Sobic003G391700 Sobic008G024000 Sobic008G024000 Sobic001G022000--Sobic008G024000 Sobic007G090418 Sobic007G090418 Sobic001G022000--Sobic007G090418 Sobic002G237600 Sobic002G237600 Sobic001G022000--Sobic002G237600 Sobic006G163066 Sobic006G163066 Sobic001G022000--Sobic006G163066 Sobic003G326100 Sobic003G326100 Sobic001G022000--Sobic003G326100 Sobic008G078966 Sobic008G078966 Sobic001G022000--Sobic008G078966 Sobic002G067050 Sobic002G067050 Sobic001G022000--Sobic002G067050 Sobic002G078600 Sobic002G078600 Sobic001G022000--Sobic002G078600 Sobic002G191300 Sobic002G191300 Sobic005G030200--Sobic002G191300 Sobic003G083100 Sobic003G083100 Sobic005G030200--Sobic003G083100 Sobic005G030200--Sobic002G289701 Sobic001G406600 Sobic001G406600 Sobic005G030200--Sobic001G406600 Sobic005G120433 Sobic005G120433 Sobic005G030200--Sobic005G120433 Sobic008G045100 Sobic008G045100 Sobic005G030200--Sobic008G045100 Sobic001G234700 Sobic001G234700 Sobic005G030200--Sobic001G234700 Sobic008G045232--Sobic002G289701 Sobic008G045232--Sobic005G030200 Sobic008G045232--Sobic002G191300 Sobic008G045232--Sobic001G189800 Sobic008G045232--Sobic005G085800 Sobic008G045232--Sobic008G045100 Sobic008G045232--Sobic001G234700 Sobic005G085800--Sobic002G289701 Sobic005G085800--Sobic002G067050 Sobic001G001000 Sobic001G001000 Sobic005G085800--Sobic001G001000 Sobic005G085800--Sobic008G045232 Sobic005G085800--Sobic005G030200 Sobic005G085800--Sobic002G191300 Sobic001G033701 Sobic001G033701 Sobic005G085800--Sobic001G033701 Sobic003G210701 Sobic003G210701 Sobic005G085800--Sobic003G210701 Sobic004G325150 Sobic004G325150 Sobic005G085800--Sobic004G325150 Sobic002G289701--Sobic008G045232 Sobic002G289701--Sobic002G191300 Sobic002G289701--Sobic005G030200 Sobic002G289701--Sobic001G189800 Sobic003G190701 Sobic003G190701 Sobic002G289701--Sobic003G190701 Sobic009G125700 Sobic009G125700 Sobic002G289701--Sobic009G125700 Sobic002G289701--Sobic008G045100 Sobic002G289701--Sobic001G234700 Sobic001G060001 Sobic001G060001 Sobic009G196100--Sobic001G060001 Sobic007G120600 Sobic007G120600 Sobic009G196100--Sobic007G120600 Sobic009G196100--Sobic002G078600 Sobic009G196100--Sobic007G007650 Sobic004G052700 Sobic004G052700 Sobic009G196100--Sobic004G052700 Sobic008G096401 Sobic008G096401 Sobic009G196100--Sobic008G096401 Sobic009G196100--Sobic003G326100 Sobic010G267651 Sobic010G267651 Sobic009G196100--Sobic010G267651 Sobic010G146350 Sobic010G146350 Sobic009G196100--Sobic010G146350
Octagon: transcription factors


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