Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G087000.1
Synonym POLA2, Sb08g009080
Functional annotation POLA2 - Putative DNA polymerase alpha complex subunit, expressed
UniProt C5YU41
Pfam PF04042
Panther DB PTHR23061 PTHR23061:SF12
NCBI CDD -
KEGG Orthology K02321; DNA polymerase alpha subunit B
Gene Ontology GO:0006260; DNA replication GO:0003887DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003677DNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G67630 : DNA polymerase alpha 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g13950.1 : POLA2 - Putative DNA polymerase alpha complex subunit, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a054294
Brachypodium KQJ91739
Barley -
Wheat TraesCS7B02G352800 , TraesCS7B02G352800 , TraesCS7A02G452800 , TraesCS7A02G452800 , TraesCS7D02G442100 , TraesCS7D02G442100
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.001G437600 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G087000 Sobic008G087000 Sobic004G048201 Sobic004G048201 Sobic008G087000--Sobic004G048201 Sobic009G174833 Sobic009G174833 Sobic008G087000--Sobic009G174833 Sobic010G002201 Sobic010G002201 Sobic008G087000--Sobic010G002201 Sobic004G173900 Sobic004G173900 Sobic008G087000--Sobic004G173900 Sobic007G201300 Sobic007G201300 Sobic008G087000--Sobic007G201300 Sobic008G139200 Sobic008G139200 Sobic008G087000--Sobic008G139200 Sobic006G069400 Sobic006G069400 Sobic008G087000--Sobic006G069400 Sobic003G387400 Sobic003G387400 Sobic008G087000--Sobic003G387400 Sobic004G200501 Sobic004G200501 Sobic008G087000--Sobic004G200501 Sobic004G048201--Sobic009G174833 Sobic004G048201--Sobic004G173900 Sobic004G048201--Sobic007G201300 Sobic004G048201--Sobic008G139200 Sobic004G048201--Sobic003G387400 Sobic004G048201--Sobic004G200501 Sobic005G059300 Sobic005G059300 Sobic004G048201--Sobic005G059300 Sobic003G118750 Sobic003G118750 Sobic004G048201--Sobic003G118750 Sobic003G141400 Sobic003G141400 Sobic004G048201--Sobic003G141400 Sobic009G174833--Sobic004G173900 Sobic009G174833--Sobic004G048201 Sobic009G174833--Sobic007G201300 Sobic009G174833--Sobic004G200501 Sobic009G174833--Sobic008G139200 Sobic009G174833--Sobic005G059300 Sobic009G174833--Sobic003G387400 Sobic008G045900 Sobic008G045900 Sobic009G174833--Sobic008G045900 Sobic008G045100 Sobic008G045100 Sobic009G174833--Sobic008G045100 Sobic001G453150 Sobic001G453150 Sobic010G002201--Sobic001G453150 Sobic002G285101 Sobic002G285101 Sobic010G002201--Sobic002G285101 Sobic010G002201--Sobic008G087000 Sobic010G002201--Sobic004G048201 Sobic005G065400 Sobic005G065400 Sobic010G002201--Sobic005G065400 Sobic002G088500 Sobic002G088500 Sobic010G002201--Sobic002G088500 Sobic010G002201--Sobic009G174833 Sobic001G439850 Sobic001G439850 Sobic010G002201--Sobic001G439850 Sobic003G385201 Sobic003G385201 Sobic010G002201--Sobic003G385201 Sobic004G173900--Sobic005G059300 Sobic004G173900--Sobic003G118750 Sobic004G173900--Sobic003G141400 Sobic004G173900--Sobic008G139200 Sobic004G173900--Sobic004G200501 Sobic004G173900--Sobic009G174833 Sobic002G103400 Sobic002G103400 Sobic004G173900--Sobic002G103400 Sobic004G173900--Sobic007G201300 Sobic007G087500 Sobic007G087500 Sobic004G173900--Sobic007G087500 Sobic007G201300--Sobic009G174833 Sobic007G201300--Sobic004G173900 Sobic007G201300--Sobic004G200501 Sobic007G201300--Sobic008G045100 Sobic001G160300 Sobic001G160300 Sobic007G201300--Sobic001G160300 Sobic007G201300--Sobic008G045900 Sobic001G234700 Sobic001G234700 Sobic007G201300--Sobic001G234700 Sobic008G139200--Sobic004G173900 Sobic008G139200--Sobic003G118750 Sobic008G139200--Sobic005G059300 Sobic008G139200--Sobic004G200501 Sobic008G139200--Sobic003G141400 Sobic008G139200--Sobic009G174833 Sobic010G010100 Sobic010G010100 Sobic008G139200--Sobic010G010100 Sobic010G091750 Sobic010G091750 Sobic008G139200--Sobic010G091750 Sobic008G139200--Sobic007G087500 Sobic003G212800 Sobic003G212800 Sobic006G069400--Sobic003G212800 Sobic007G193500 Sobic007G193500 Sobic006G069400--Sobic007G193500 Sobic009G133100 Sobic009G133100 Sobic006G069400--Sobic009G133100 Sobic001G022000 Sobic001G022000 Sobic006G069400--Sobic001G022000 Sobic005G030200 Sobic005G030200 Sobic006G069400--Sobic005G030200 Sobic008G045232 Sobic008G045232 Sobic006G069400--Sobic008G045232 Sobic005G085800 Sobic005G085800 Sobic006G069400--Sobic005G085800 Sobic002G289701 Sobic002G289701 Sobic006G069400--Sobic002G289701 Sobic009G196100 Sobic009G196100 Sobic006G069400--Sobic009G196100 Sobic003G387400--Sobic009G174833 Sobic003G387400--Sobic004G173900 Sobic006G144900 Sobic006G144900 Sobic003G387400--Sobic006G144900 Sobic003G387400--Sobic007G201300 Sobic003G387400--Sobic003G118750 Sobic002G260500 Sobic002G260500 Sobic003G387400--Sobic002G260500 Sobic003G210701 Sobic003G210701 Sobic003G387400--Sobic003G210701 Sobic003G387400--Sobic004G200501 Sobic003G387400--Sobic008G139200 Sobic003G023100 Sobic003G023100 Sobic004G200501--Sobic003G023100 Sobic004G200501--Sobic007G087500 Sobic008G008601 Sobic008G008601 Sobic004G200501--Sobic008G008601 Sobic003G120050 Sobic003G120050 Sobic004G200501--Sobic003G120050 Sobic005G013700 Sobic005G013700 Sobic004G200501--Sobic005G013700 Sobic001G452300 Sobic001G452300 Sobic004G200501--Sobic001G452300 Sobic004G200501--Sobic004G173900 Sobic004G122700 Sobic004G122700 Sobic004G200501--Sobic004G122700 Sobic008G008701 Sobic008G008701 Sobic004G200501--Sobic008G008701
Octagon: transcription factors


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