Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G285101.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W6B4
Pfam PF02519
Panther DB PTHR31175 PTHR31175:SF6
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0009733; response to auxin


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G29430 : SAUR-like auxin-responsive protein family
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g37500.1 : OsSAUR55 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a047989
Brachypodium PNT65076
Barley -
Wheat TraesCS5D02G349100
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G453150 - -
2 Sobic.010G002201 - -
3 Sobic.005G065400 expressed protein -
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15 Sobic.010G051600 - -
16 Sobic.003G118750 - -
17 Sobic.003G387400 - -
18 Sobic.007G201300 30S ribosomal protein S16, putative, expressed -
19 Sobic.005G106900 expressed protein K17757: ATP-dependent NAD(P)H-hydrate dehydratase
20 Sobic.004G200501 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G285101 Sobic002G285101 Sobic001G453150 Sobic001G453150 Sobic002G285101--Sobic001G453150 Sobic010G002201 Sobic010G002201 Sobic002G285101--Sobic010G002201 Sobic005G065400 Sobic005G065400 Sobic002G285101--Sobic005G065400 Sobic004G048201 Sobic004G048201 Sobic002G285101--Sobic004G048201 Sobic001G439850 Sobic001G439850 Sobic002G285101--Sobic001G439850 Sobic008G087000 Sobic008G087000 Sobic002G285101--Sobic008G087000 Sobic009G174833 Sobic009G174833 Sobic002G285101--Sobic009G174833 Sobic008G139200 Sobic008G139200 Sobic002G285101--Sobic008G139200 Sobic003G385201 Sobic003G385201 Sobic002G285101--Sobic003G385201 Sobic001G453150--Sobic005G065400 Sobic001G453150--Sobic002G285101 Sobic001G453150--Sobic010G002201 Sobic001G453150--Sobic001G439850 Sobic002G227400 Sobic002G227400 Sobic001G453150--Sobic002G227400 Sobic007G171300 Sobic007G171300 Sobic001G453150--Sobic007G171300 Sobic001G453150--Sobic004G048201 Sobic001G453150--Sobic008G087000 Sobic002G088500 Sobic002G088500 Sobic001G453150--Sobic002G088500 Sobic010G002201--Sobic001G453150 Sobic010G002201--Sobic002G285101 Sobic010G002201--Sobic008G087000 Sobic010G002201--Sobic004G048201 Sobic010G002201--Sobic005G065400 Sobic010G002201--Sobic002G088500 Sobic010G002201--Sobic009G174833 Sobic010G002201--Sobic001G439850 Sobic010G002201--Sobic003G385201 Sobic005G065400--Sobic001G439850 Sobic005G065400--Sobic001G453150 Sobic005G065400--Sobic002G088500 Sobic005G065400--Sobic002G227400 Sobic005G065400--Sobic002G285101 Sobic008G091500 Sobic008G091500 Sobic005G065400--Sobic008G091500 Sobic007G129500 Sobic007G129500 Sobic005G065400--Sobic007G129500 Sobic005G065400--Sobic007G171300 Sobic001G195866 Sobic001G195866 Sobic005G065400--Sobic001G195866 Sobic004G048201--Sobic009G174833 Sobic004G173900 Sobic004G173900 Sobic004G048201--Sobic004G173900 Sobic007G201300 Sobic007G201300 Sobic004G048201--Sobic007G201300 Sobic004G048201--Sobic008G139200 Sobic003G387400 Sobic003G387400 Sobic004G048201--Sobic003G387400 Sobic004G200501 Sobic004G200501 Sobic004G048201--Sobic004G200501 Sobic005G059300 Sobic005G059300 Sobic004G048201--Sobic005G059300 Sobic003G118750 Sobic003G118750 Sobic004G048201--Sobic003G118750 Sobic003G141400 Sobic003G141400 Sobic004G048201--Sobic003G141400 Sobic001G439850--Sobic005G065400 Sobic001G439850--Sobic001G453150 Sobic001G439850--Sobic002G088500 Sobic001G439850--Sobic002G227400 Sobic001G439850--Sobic002G285101 Sobic001G439850--Sobic008G091500 Sobic001G439850--Sobic007G129500 Sobic001G439850--Sobic007G171300 Sobic010G135700 Sobic010G135700 Sobic001G439850--Sobic010G135700 Sobic008G087000--Sobic004G048201 Sobic008G087000--Sobic009G174833 Sobic008G087000--Sobic010G002201 Sobic008G087000--Sobic004G173900 Sobic008G087000--Sobic007G201300 Sobic008G087000--Sobic008G139200 Sobic006G069400 Sobic006G069400 Sobic008G087000--Sobic006G069400 Sobic008G087000--Sobic003G387400 Sobic008G087000--Sobic004G200501 Sobic009G174833--Sobic004G173900 Sobic009G174833--Sobic004G048201 Sobic009G174833--Sobic007G201300 Sobic009G174833--Sobic004G200501 Sobic009G174833--Sobic008G139200 Sobic009G174833--Sobic005G059300 Sobic009G174833--Sobic003G387400 Sobic008G045900 Sobic008G045900 Sobic009G174833--Sobic008G045900 Sobic008G045100 Sobic008G045100 Sobic009G174833--Sobic008G045100 Sobic008G139200--Sobic004G173900 Sobic008G139200--Sobic003G118750 Sobic008G139200--Sobic005G059300 Sobic008G139200--Sobic004G200501 Sobic008G139200--Sobic003G141400 Sobic008G139200--Sobic009G174833 Sobic010G010100 Sobic010G010100 Sobic008G139200--Sobic010G010100 Sobic010G091750 Sobic010G091750 Sobic008G139200--Sobic010G091750 Sobic007G087500 Sobic007G087500 Sobic008G139200--Sobic007G087500 Sobic003G385201--Sobic002G285101 Sobic002G011200 Sobic002G011200 Sobic003G385201--Sobic002G011200 Sobic003G385201--Sobic004G048201 Sobic003G385201--Sobic003G387400 Sobic003G385201--Sobic001G453150 Sobic003G336600 Sobic003G336600 Sobic003G385201--Sobic003G336600 Sobic003G385201--Sobic010G002201 Sobic003G243750 Sobic003G243750 Sobic003G385201--Sobic003G243750 Sobic005G061300 Sobic005G061300 Sobic003G385201--Sobic005G061300
Octagon: transcription factors


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