Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G065400.1
Synonym Sb05g005520
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PQJ1
Pfam PF07762
Panther DB PTHR33074 PTHR33074:SF10
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g08010.2 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G439850 - -
2 Sobic.001G453150 - -
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15 Sobic.001G055300 expressed protein -
16 Sobic.003G217566 - -
17 Sobic.006G125301 - -
18 Sobic.009G218450 - K05658: ABCB1, ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 1
19 Sobic.006G107332 - -
20 Sobic.010G213100 RNA-dependent RNA polymerase, putative, expressed K11699: RDR, RNA-dependent RNA polymerase


Gene co-expression network
sample Sobic005G065400 Sobic005G065400 Sobic001G439850 Sobic001G439850 Sobic005G065400--Sobic001G439850 Sobic001G453150 Sobic001G453150 Sobic005G065400--Sobic001G453150 Sobic002G088500 Sobic002G088500 Sobic005G065400--Sobic002G088500 Sobic002G227400 Sobic002G227400 Sobic005G065400--Sobic002G227400 Sobic002G285101 Sobic002G285101 Sobic005G065400--Sobic002G285101 Sobic008G091500 Sobic008G091500 Sobic005G065400--Sobic008G091500 Sobic007G129500 Sobic007G129500 Sobic005G065400--Sobic007G129500 Sobic007G171300 Sobic007G171300 Sobic005G065400--Sobic007G171300 Sobic001G195866 Sobic001G195866 Sobic005G065400--Sobic001G195866 Sobic001G439850--Sobic005G065400 Sobic001G439850--Sobic001G453150 Sobic001G439850--Sobic002G088500 Sobic001G439850--Sobic002G227400 Sobic001G439850--Sobic002G285101 Sobic001G439850--Sobic008G091500 Sobic001G439850--Sobic007G129500 Sobic001G439850--Sobic007G171300 Sobic010G135700 Sobic010G135700 Sobic001G439850--Sobic010G135700 Sobic001G453150--Sobic005G065400 Sobic001G453150--Sobic002G285101 Sobic010G002201 Sobic010G002201 Sobic001G453150--Sobic010G002201 Sobic001G453150--Sobic001G439850 Sobic001G453150--Sobic002G227400 Sobic001G453150--Sobic007G171300 Sobic004G048201 Sobic004G048201 Sobic001G453150--Sobic004G048201 Sobic008G087000 Sobic008G087000 Sobic001G453150--Sobic008G087000 Sobic001G453150--Sobic002G088500 Sobic002G088500--Sobic007G129500 Sobic001G177700 Sobic001G177700 Sobic002G088500--Sobic001G177700 Sobic002G364301 Sobic002G364301 Sobic002G088500--Sobic002G364301 Sobic005G226700 Sobic005G226700 Sobic002G088500--Sobic005G226700 Sobic002G088500--Sobic005G065400 Sobic001G055300 Sobic001G055300 Sobic002G088500--Sobic001G055300 Sobic002G088500--Sobic001G439850 Sobic006G107332 Sobic006G107332 Sobic002G088500--Sobic006G107332 Sobic001G120750 Sobic001G120750 Sobic002G088500--Sobic001G120750 Sobic002G227400--Sobic007G171300 Sobic002G227400--Sobic005G065400 Sobic002G227400--Sobic001G453150 Sobic002G227400--Sobic001G439850 Sobic001G135000 Sobic001G135000 Sobic002G227400--Sobic001G135000 Sobic002G227400--Sobic008G091500 Sobic001G529301 Sobic001G529301 Sobic002G227400--Sobic001G529301 Sobic006G031866 Sobic006G031866 Sobic002G227400--Sobic006G031866 Sobic010G213100 Sobic010G213100 Sobic002G227400--Sobic010G213100 Sobic002G285101--Sobic001G453150 Sobic002G285101--Sobic010G002201 Sobic002G285101--Sobic005G065400 Sobic002G285101--Sobic004G048201 Sobic002G285101--Sobic001G439850 Sobic002G285101--Sobic008G087000 Sobic009G174833 Sobic009G174833 Sobic002G285101--Sobic009G174833 Sobic008G139200 Sobic008G139200 Sobic002G285101--Sobic008G139200 Sobic003G385201 Sobic003G385201 Sobic002G285101--Sobic003G385201 Sobic008G091500--Sobic005G065400 Sobic008G091500--Sobic002G227400 Sobic008G091500--Sobic001G439850 Sobic008G091500--Sobic001G453150 Sobic008G091500--Sobic002G285101 Sobic008G091500--Sobic010G135700 Sobic008G091500--Sobic007G171300 Sobic008G091500--Sobic001G195866 Sobic008G091500--Sobic002G088500 Sobic007G129500--Sobic002G088500 Sobic007G129500--Sobic001G177700 Sobic007G129500--Sobic002G364301 Sobic007G129500--Sobic005G226700 Sobic007G129500--Sobic001G055300 Sobic007G141001 Sobic007G141001 Sobic007G129500--Sobic007G141001 Sobic007G129500--Sobic006G107332 Sobic007G129500--Sobic005G065400 Sobic009G214700 Sobic009G214700 Sobic007G129500--Sobic009G214700 Sobic007G171300--Sobic002G227400 Sobic007G171300--Sobic006G031866 Sobic007G171300--Sobic001G135000 Sobic007G171300--Sobic001G529301 Sobic002G268450 Sobic002G268450 Sobic007G171300--Sobic002G268450 Sobic007G171300--Sobic010G213100 Sobic007G171300--Sobic005G065400 Sobic008G052700 Sobic008G052700 Sobic007G171300--Sobic008G052700 Sobic007G171300--Sobic001G453150 Sobic009G218450 Sobic009G218450 Sobic001G195866--Sobic009G218450 Sobic001G195866--Sobic010G135700 Sobic001G221700 Sobic001G221700 Sobic001G195866--Sobic001G221700 Sobic003G348300 Sobic003G348300 Sobic001G195866--Sobic003G348300 Sobic002G221000 Sobic002G221000 Sobic001G195866--Sobic002G221000 Sobic002G262250 Sobic002G262250 Sobic001G195866--Sobic002G262250 Sobic008G154500 Sobic008G154500 Sobic001G195866--Sobic008G154500 Sobic003G217566 Sobic003G217566 Sobic001G195866--Sobic003G217566 Sobic001G486400 Sobic001G486400 Sobic001G195866--Sobic001G486400
Octagon: transcription factors


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