Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G226700.1
Synonym Sb05g027500
Functional annotation zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
UniProt C5Y8I4
Pfam PF13639
Panther DB PTHR14155 PTHR14155:SF124
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding GO:0005515protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G33565 : RING/U-box superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g47700.1 : zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a044277
Brachypodium KQJ87105 , KQJ87102 , KQJ87101
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic005G226700 Sobic005G226700 Sobic001G055300 Sobic001G055300 Sobic005G226700--Sobic001G055300 Sobic001G177700 Sobic001G177700 Sobic005G226700--Sobic001G177700 Sobic002G364301 Sobic002G364301 Sobic005G226700--Sobic002G364301 Sobic006G107332 Sobic006G107332 Sobic005G226700--Sobic006G107332 Sobic007G129500 Sobic007G129500 Sobic005G226700--Sobic007G129500 Sobic007G059800 Sobic007G059800 Sobic005G226700--Sobic007G059800 Sobic002G069601 Sobic002G069601 Sobic005G226700--Sobic002G069601 Sobic003G318400 Sobic003G318400 Sobic005G226700--Sobic003G318400 Sobic005G181700 Sobic005G181700 Sobic005G226700--Sobic005G181700 Sobic001G055300--Sobic006G107332 Sobic005G057600 Sobic005G057600 Sobic001G055300--Sobic005G057600 Sobic003G372950 Sobic003G372950 Sobic001G055300--Sobic003G372950 Sobic001G055300--Sobic007G059800 Sobic004G286450 Sobic004G286450 Sobic001G055300--Sobic004G286450 Sobic003G064000 Sobic003G064000 Sobic001G055300--Sobic003G064000 Sobic001G062200 Sobic001G062200 Sobic001G055300--Sobic001G062200 Sobic004G201200 Sobic004G201200 Sobic001G055300--Sobic004G201200 Sobic008G154200 Sobic008G154200 Sobic001G055300--Sobic008G154200 Sobic001G177700--Sobic007G129500 Sobic001G177700--Sobic002G364301 Sobic002G088500 Sobic002G088500 Sobic001G177700--Sobic002G088500 Sobic001G177700--Sobic005G226700 Sobic001G177700--Sobic001G055300 Sobic001G177700--Sobic006G107332 Sobic009G214700 Sobic009G214700 Sobic001G177700--Sobic009G214700 Sobic007G141001 Sobic007G141001 Sobic001G177700--Sobic007G141001 Sobic003G353050 Sobic003G353050 Sobic001G177700--Sobic003G353050 Sobic002G364301--Sobic001G177700 Sobic002G364301--Sobic005G226700 Sobic001G220066 Sobic001G220066 Sobic002G364301--Sobic001G220066 Sobic002G157350 Sobic002G157350 Sobic002G364301--Sobic002G157350 Sobic002G348200 Sobic002G348200 Sobic002G364301--Sobic002G348200 Sobic001G272300 Sobic001G272300 Sobic002G364301--Sobic001G272300 Sobic006G107332--Sobic001G055300 Sobic002G185000 Sobic002G185000 Sobic006G107332--Sobic002G185000 Sobic006G107332--Sobic003G372950 Sobic006G107332--Sobic005G057600 Sobic006G107332--Sobic004G286450 Sobic006G107332--Sobic003G064000 Sobic006G107332--Sobic007G059800 Sobic006G107332--Sobic008G154200 Sobic006G107332--Sobic004G201200 Sobic007G129500--Sobic002G088500 Sobic007G129500--Sobic001G177700 Sobic007G129500--Sobic002G364301 Sobic007G129500--Sobic005G226700 Sobic007G129500--Sobic001G055300 Sobic007G129500--Sobic007G141001 Sobic007G129500--Sobic006G107332 Sobic005G065400 Sobic005G065400 Sobic007G129500--Sobic005G065400 Sobic007G129500--Sobic009G214700 Sobic007G059800--Sobic005G181700 Sobic007G059800--Sobic004G201200 Sobic007G059800--Sobic003G318400 Sobic007G059800--Sobic005G057600 Sobic007G059800--Sobic002G069601 Sobic007G059800--Sobic001G062200 Sobic001G025201 Sobic001G025201 Sobic007G059800--Sobic001G025201 Sobic007G059800--Sobic003G372950 Sobic007G059800--Sobic004G286450 Sobic002G069601--Sobic003G318400 Sobic002G069601--Sobic005G181700 Sobic002G069601--Sobic007G059800 Sobic002G069601--Sobic001G025201 Sobic002G069601--Sobic003G353050 Sobic008G192200 Sobic008G192200 Sobic002G069601--Sobic008G192200 Sobic002G069601--Sobic001G272300 Sobic003G318400--Sobic002G069601 Sobic003G318400--Sobic005G181700 Sobic003G318400--Sobic007G059800 Sobic003G318400--Sobic004G201200 Sobic003G318400--Sobic001G025201 Sobic003G318400--Sobic003G353050 Sobic003G286650 Sobic003G286650 Sobic003G318400--Sobic003G286650 Sobic001G267950 Sobic001G267950 Sobic003G318400--Sobic001G267950 Sobic003G318400--Sobic005G057600 Sobic005G181700--Sobic007G059800 Sobic005G181700--Sobic003G318400 Sobic005G181700--Sobic004G201200 Sobic005G181700--Sobic002G069601 Sobic005G181700--Sobic005G057600 Sobic005G181700--Sobic001G062200 Sobic005G181700--Sobic001G025201 Sobic005G181700--Sobic003G372950 Sobic005G181700--Sobic004G286450
Octagon: transcription factors


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