Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G129500.1
Synonym Sb07g020540
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5R9Q3
Pfam -
Panther DB PTHR11439 PTHR11439:SF161
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G00980 : zinc knuckle (CCHC-type) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g32550.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G088500 expressed protein -
2 Sobic.001G177700 zinc knuckle domain containing protein, expressed -
3 Sobic.002G364301 - -
4 Sobic.005G226700 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
5 Sobic.001G055300 expressed protein -
6 Sobic.007G141001 - -
7 Sobic.006G107332 - -
8 Sobic.005G065400 expressed protein -
9 Sobic.009G214700 Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@bHelix-loop-helix transcription factor, putative, expressed -
10 Sobic.001G218701 - -
11 Sobic.003G049100 prolyl 4-hydroxylase, putative, expressed K00472: prolyl 4-hydroxylase
12 Sobic.003G353050 - -
13 Sobic.009G030701 - -
14 Sobic.002G069601 - -
15 Sobic.008G192200 - -
16 Sobic.003G046900 expressed protein -
17 Sobic.001G272300 OsFBX356 - F-box domain containing protein, expressed -
18 Sobic.001G272300 OsFBX356 - F-box domain containing protein, expressed -
19 Sobic.001G272300 OsFBX356 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.001G272300 OsFBX356 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G129500 Sobic007G129500 Sobic002G088500 Sobic002G088500 Sobic007G129500--Sobic002G088500 Sobic001G177700 Sobic001G177700 Sobic007G129500--Sobic001G177700 Sobic002G364301 Sobic002G364301 Sobic007G129500--Sobic002G364301 Sobic005G226700 Sobic005G226700 Sobic007G129500--Sobic005G226700 Sobic001G055300 Sobic001G055300 Sobic007G129500--Sobic001G055300 Sobic007G141001 Sobic007G141001 Sobic007G129500--Sobic007G141001 Sobic006G107332 Sobic006G107332 Sobic007G129500--Sobic006G107332 Sobic005G065400 Sobic005G065400 Sobic007G129500--Sobic005G065400 Sobic009G214700 Sobic009G214700 Sobic007G129500--Sobic009G214700 Sobic002G088500--Sobic007G129500 Sobic002G088500--Sobic001G177700 Sobic002G088500--Sobic002G364301 Sobic002G088500--Sobic005G226700 Sobic002G088500--Sobic005G065400 Sobic002G088500--Sobic001G055300 Sobic001G439850 Sobic001G439850 Sobic002G088500--Sobic001G439850 Sobic002G088500--Sobic006G107332 Sobic001G120750 Sobic001G120750 Sobic002G088500--Sobic001G120750 Sobic001G177700--Sobic007G129500 Sobic001G177700--Sobic002G364301 Sobic001G177700--Sobic002G088500 Sobic001G177700--Sobic005G226700 Sobic001G177700--Sobic001G055300 Sobic001G177700--Sobic006G107332 Sobic001G177700--Sobic009G214700 Sobic001G177700--Sobic007G141001 Sobic003G353050 Sobic003G353050 Sobic001G177700--Sobic003G353050 Sobic002G364301--Sobic001G177700 Sobic002G364301--Sobic005G226700 Sobic001G220066 Sobic001G220066 Sobic002G364301--Sobic001G220066 Sobic002G157350 Sobic002G157350 Sobic002G364301--Sobic002G157350 Sobic002G348200 Sobic002G348200 Sobic002G364301--Sobic002G348200 Sobic001G272300 Sobic001G272300 Sobic002G364301--Sobic001G272300 Sobic005G226700--Sobic001G055300 Sobic005G226700--Sobic001G177700 Sobic005G226700--Sobic002G364301 Sobic005G226700--Sobic006G107332 Sobic005G226700--Sobic007G129500 Sobic007G059800 Sobic007G059800 Sobic005G226700--Sobic007G059800 Sobic002G069601 Sobic002G069601 Sobic005G226700--Sobic002G069601 Sobic003G318400 Sobic003G318400 Sobic005G226700--Sobic003G318400 Sobic005G181700 Sobic005G181700 Sobic005G226700--Sobic005G181700 Sobic001G055300--Sobic006G107332 Sobic005G057600 Sobic005G057600 Sobic001G055300--Sobic005G057600 Sobic003G372950 Sobic003G372950 Sobic001G055300--Sobic003G372950 Sobic001G055300--Sobic007G059800 Sobic004G286450 Sobic004G286450 Sobic001G055300--Sobic004G286450 Sobic003G064000 Sobic003G064000 Sobic001G055300--Sobic003G064000 Sobic001G062200 Sobic001G062200 Sobic001G055300--Sobic001G062200 Sobic004G201200 Sobic004G201200 Sobic001G055300--Sobic004G201200 Sobic008G154200 Sobic008G154200 Sobic001G055300--Sobic008G154200 Sobic001G218701 Sobic001G218701 Sobic007G141001--Sobic001G218701 Sobic008G154000 Sobic008G154000 Sobic007G141001--Sobic008G154000 Sobic003G091100 Sobic003G091100 Sobic007G141001--Sobic003G091100 Sobic007G141001--Sobic001G272300 Sobic006G107332--Sobic001G055300 Sobic002G185000 Sobic002G185000 Sobic006G107332--Sobic002G185000 Sobic006G107332--Sobic003G372950 Sobic006G107332--Sobic005G057600 Sobic006G107332--Sobic004G286450 Sobic006G107332--Sobic003G064000 Sobic006G107332--Sobic007G059800 Sobic006G107332--Sobic008G154200 Sobic006G107332--Sobic004G201200 Sobic005G065400--Sobic001G439850 Sobic001G453150 Sobic001G453150 Sobic005G065400--Sobic001G453150 Sobic005G065400--Sobic002G088500 Sobic002G227400 Sobic002G227400 Sobic005G065400--Sobic002G227400 Sobic002G285101 Sobic002G285101 Sobic005G065400--Sobic002G285101 Sobic008G091500 Sobic008G091500 Sobic005G065400--Sobic008G091500 Sobic005G065400--Sobic007G129500 Sobic007G171300 Sobic007G171300 Sobic005G065400--Sobic007G171300 Sobic001G195866 Sobic001G195866 Sobic005G065400--Sobic001G195866 Sobic006G261000 Sobic006G261000 Sobic009G214700--Sobic006G261000 Sobic007G075200 Sobic007G075200 Sobic009G214700--Sobic007G075200 Sobic001G267950 Sobic001G267950 Sobic009G214700--Sobic001G267950 Sobic003G046900 Sobic003G046900 Sobic009G214700--Sobic003G046900 Sobic006G018500 Sobic006G018500 Sobic009G214700--Sobic006G018500 Sobic005G199500 Sobic005G199500 Sobic009G214700--Sobic005G199500 Sobic003G049100 Sobic003G049100 Sobic009G214700--Sobic003G049100 Sobic004G196000 Sobic004G196000 Sobic009G214700--Sobic004G196000 Sobic008G192200 Sobic008G192200 Sobic009G214700--Sobic008G192200
Octagon: transcription factors


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