Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G055650.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R4W5
Pfam -
Panther DB PTHR32212 PTHR32212:SF77
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g42310.1 : OsFBL58 - F-box domain and LRR containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium PNT63127 , KQJ87539
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G065500 BHLH transcription factor, putative, expressed -
2 Sobic.002G277366 - -
3 Sobic.003G021401 - -
4 Sobic.004G082050 - K02935: RP-L7, MRPL12, large subunit ribosomal protein L7/L12
5 Sobic.003G120050 - -
6 Sobic.003G023100 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@- -
7 Sobic.010G267651 - -
8 Sobic.008G008601 - -
9 Sobic.004G013400 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FKBP-type, putative, expressed K01802: peptidylprolyl isomerase
10 Sobic.001G452300 NAD dependent epimerase/dehydratase family protein, putative, expressed -
11 Sobic.007G087500 hypothetical protein -
12 Sobic.002G063201 - -
13 Sobic.006G137900 heavy metal-associated domain containing protein, expressed -
14 Sobic.002G063500 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
15 Sobic.010G091750 - -
16 Sobic.006G077900 cysteine synthase, putative, expressed K01738: cysteine synthase
17 Sobic.005G207600 - -
18 Sobic.010G146350 - -
19 Sobic.002G070400 - -
20 Sobic.009G196100 dof zinc finger domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G055650 Sobic008G055650 Sobic010G065500 Sobic010G065500 Sobic008G055650--Sobic010G065500 Sobic002G277366 Sobic002G277366 Sobic008G055650--Sobic002G277366 Sobic003G021401 Sobic003G021401 Sobic008G055650--Sobic003G021401 Sobic004G082050 Sobic004G082050 Sobic008G055650--Sobic004G082050 Sobic003G120050 Sobic003G120050 Sobic008G055650--Sobic003G120050 Sobic003G023100 Sobic003G023100 Sobic008G055650--Sobic003G023100 Sobic010G267651 Sobic010G267651 Sobic008G055650--Sobic010G267651 Sobic008G008601 Sobic008G008601 Sobic008G055650--Sobic008G008601 Sobic004G013400 Sobic004G013400 Sobic008G055650--Sobic004G013400 Sobic006G137900 Sobic006G137900 Sobic010G065500--Sobic006G137900 Sobic010G065500--Sobic008G008601 Sobic005G013700 Sobic005G013700 Sobic010G065500--Sobic005G013700 Sobic002G063500 Sobic002G063500 Sobic010G065500--Sobic002G063500 Sobic001G452300 Sobic001G452300 Sobic010G065500--Sobic001G452300 Sobic010G065500--Sobic003G120050 Sobic004G122700 Sobic004G122700 Sobic010G065500--Sobic004G122700 Sobic010G065500--Sobic004G013400 Sobic002G070400 Sobic002G070400 Sobic010G065500--Sobic002G070400 Sobic002G277366--Sobic003G021401 Sobic002G277366--Sobic003G023100 Sobic002G277366--Sobic003G120050 Sobic003G323750 Sobic003G323750 Sobic002G277366--Sobic003G323750 Sobic002G063201 Sobic002G063201 Sobic002G277366--Sobic002G063201 Sobic010G091750 Sobic010G091750 Sobic002G277366--Sobic010G091750 Sobic006G077900 Sobic006G077900 Sobic002G277366--Sobic006G077900 Sobic002G277366--Sobic001G452300 Sobic007G087500 Sobic007G087500 Sobic002G277366--Sobic007G087500 Sobic003G021401--Sobic003G120050 Sobic003G021401--Sobic003G023100 Sobic003G021401--Sobic002G277366 Sobic003G021401--Sobic001G452300 Sobic003G021401--Sobic008G008601 Sobic003G021401--Sobic004G013400 Sobic003G021401--Sobic006G137900 Sobic003G021401--Sobic007G087500 Sobic001G190600 Sobic001G190600 Sobic003G021401--Sobic001G190600 Sobic004G082050--Sobic010G065500 Sobic004G082050--Sobic007G087500 Sobic004G082050--Sobic001G452300 Sobic006G004700 Sobic006G004700 Sobic004G082050--Sobic006G004700 Sobic004G082050--Sobic002G070400 Sobic004G082050--Sobic008G008601 Sobic004G082050--Sobic005G013700 Sobic004G082050--Sobic002G063500 Sobic004G082050--Sobic003G021401 Sobic003G120050--Sobic003G021401 Sobic003G120050--Sobic003G023100 Sobic003G120050--Sobic008G008601 Sobic003G120050--Sobic001G452300 Sobic003G120050--Sobic004G013400 Sobic003G120050--Sobic006G137900 Sobic001G138500 Sobic001G138500 Sobic003G120050--Sobic001G138500 Sobic005G207600 Sobic005G207600 Sobic003G120050--Sobic005G207600 Sobic003G120050--Sobic001G190600 Sobic003G023100--Sobic003G120050 Sobic003G023100--Sobic003G021401 Sobic004G200501 Sobic004G200501 Sobic003G023100--Sobic004G200501 Sobic010G146350 Sobic010G146350 Sobic003G023100--Sobic010G146350 Sobic003G023100--Sobic005G207600 Sobic003G023100--Sobic002G277366 Sobic010G228200 Sobic010G228200 Sobic003G023100--Sobic010G228200 Sobic003G023100--Sobic006G137900 Sobic007G120600 Sobic007G120600 Sobic003G023100--Sobic007G120600 Sobic002G188800 Sobic002G188800 Sobic010G267651--Sobic002G188800 Sobic010G267651--Sobic007G120600 Sobic008G096401 Sobic008G096401 Sobic010G267651--Sobic008G096401 Sobic004G052700 Sobic004G052700 Sobic010G267651--Sobic004G052700 Sobic004G181100 Sobic004G181100 Sobic010G267651--Sobic004G181100 Sobic001G060001 Sobic001G060001 Sobic010G267651--Sobic001G060001 Sobic006G042800 Sobic006G042800 Sobic010G267651--Sobic006G042800 Sobic010G267651--Sobic006G077900 Sobic002G159400 Sobic002G159400 Sobic010G267651--Sobic002G159400 Sobic008G008601--Sobic001G452300 Sobic008G008601--Sobic004G122700 Sobic008G008701 Sobic008G008701 Sobic008G008601--Sobic008G008701 Sobic008G008601--Sobic002G063500 Sobic004G090900 Sobic004G090900 Sobic008G008601--Sobic004G090900 Sobic008G069901 Sobic008G069901 Sobic008G008601--Sobic008G069901 Sobic008G008601--Sobic007G087500 Sobic001G033701 Sobic001G033701 Sobic008G008601--Sobic001G033701 Sobic004G184900 Sobic004G184900 Sobic008G008601--Sobic004G184900 Sobic004G013400--Sobic001G190600 Sobic004G013400--Sobic008G008601 Sobic004G013400--Sobic004G122700 Sobic004G013400--Sobic006G137900 Sobic004G013400--Sobic001G452300 Sobic004G013400--Sobic001G138500 Sobic004G013400--Sobic008G008701 Sobic005G207550 Sobic005G207550 Sobic004G013400--Sobic005G207550 Sobic004G013400--Sobic003G120050
Octagon: transcription factors


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