Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G190900.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6P980
Pfam PF04578 PF13968
Panther DB PTHR31325 PTHR31325:SF13
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G45470 : Protein of unknown function (DUF594)
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g43252.2 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a037911
Brachypodium KQK05512
Barley HORVU5Hr1G121230.4 , HORVU5Hr1G121230.2 , HORVU5Hr1G121230.3 , HORVU5Hr1G121170.2 , HORVU5Hr1G121220.4 , HORVU5Hr1G121220.3 , HORVU5Hr1G121220.2 , HORVU5Hr1G121220.1
Wheat TraesCS4A02G338300 , TraesCS5D02G534800
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G277900 ki1 protein, putative, expressed -
2 Sobic.001G152240 - -
3 Sobic.005G144101 - -
4 Sobic.010G266000 uncharacterized protein(PubMedID : 28640841)@expressed protein -
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6 Sobic.003G008100 U-box domain containing protein, expressed -
7 Sobic.002G103400 - -
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9 Sobic.004G082050 - K02935: RP-L7, MRPL12, large subunit ribosomal protein L7/L12
10 Sobic.002G063500 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
11 Sobic.008G053700 - -
12 Sobic.004G173800 - -
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14 Sobic.004G184900 pentatricopeptide repeat domain containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.002G237600 male sterility protein, putative, expressed K13356: alcohol-forming fatty acyl-CoA reductase
16 Sobic.003G046000 - -
17 Sobic.003G060900 OsFBX320 - F-box domain containing protein, expressed -
18 Sobic.007G087500 hypothetical protein -
19 Sobic.009G029800 endoglucanase, putative, expressed -
20 Sobic.002G407500 sex determination protein tasselseed-2, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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