Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G184900.1
Synonym Sb01g016050
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence. (PubMedID : 27586543)
"Expressed protein(Ortholog in rice:Huang et al., 2012)" (PubMedID : 31659837)
expressed protein
UniProt C5WUB9
Pfam -
Panther DB PTHR33386 PTHR33386:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G48180 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g37810.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a007087
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G178200 - -
2 Sobic.010G004001 - -
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12 Sobic.002G205201 - -
13 Sobic.006G209100 - -
14 Sobic.006G090201 - -
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18 Sobic.008G023500 expressed protein -
19 Sobic.007G033200 fringe-related protein, putative, expressed -
20 Sobic.003G245700 3-5 exonuclease domain-containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G184900 Sobic001G184900 Sobic001G178200 Sobic001G178200 Sobic001G184900--Sobic001G178200 Sobic010G004001 Sobic010G004001 Sobic001G184900--Sobic010G004001 Sobic002G410050 Sobic002G410050 Sobic001G184900--Sobic002G410050 Sobic005G037500 Sobic005G037500 Sobic001G184900--Sobic005G037500 Sobic002G052500 Sobic002G052500 Sobic001G184900--Sobic002G052500 Sobic006G136900 Sobic006G136900 Sobic001G184900--Sobic006G136900 Sobic010G173550 Sobic010G173550 Sobic001G184900--Sobic010G173550 Sobic004G330500 Sobic004G330500 Sobic001G184900--Sobic004G330500 Sobic006G185400 Sobic006G185400 Sobic001G184900--Sobic006G185400 Sobic006G080600 Sobic006G080600 Sobic001G178200--Sobic006G080600 Sobic001G178200--Sobic002G052500 Sobic005G208500 Sobic005G208500 Sobic001G178200--Sobic005G208500 Sobic006G272450 Sobic006G272450 Sobic001G178200--Sobic006G272450 Sobic001G378550 Sobic001G378550 Sobic001G178200--Sobic001G378550 Sobic010G244600 Sobic010G244600 Sobic001G178200--Sobic010G244600 Sobic001G178200--Sobic001G184900 Sobic001G339900 Sobic001G339900 Sobic001G178200--Sobic001G339900 Sobic009G125500 Sobic009G125500 Sobic001G178200--Sobic009G125500 Sobic010G004001--Sobic002G052500 Sobic006G166300 Sobic006G166300 Sobic010G004001--Sobic006G166300 Sobic007G210400 Sobic007G210400 Sobic010G004001--Sobic007G210400 Sobic002G138500 Sobic002G138500 Sobic010G004001--Sobic002G138500 Sobic008G168000 Sobic008G168000 Sobic010G004001--Sobic008G168000 Sobic010G004001--Sobic005G037500 Sobic003G245700 Sobic003G245700 Sobic010G004001--Sobic003G245700 Sobic002G037000 Sobic002G037000 Sobic010G004001--Sobic002G037000 Sobic010G004001--Sobic006G185400 Sobic009G165050 Sobic009G165050 Sobic002G410050--Sobic009G165050 Sobic005G106800 Sobic005G106800 Sobic002G410050--Sobic005G106800 Sobic003G299400 Sobic003G299400 Sobic002G410050--Sobic003G299400 Sobic006G214101 Sobic006G214101 Sobic002G410050--Sobic006G214101 Sobic010G149900 Sobic010G149900 Sobic002G410050--Sobic010G149900 Sobic004G351866 Sobic004G351866 Sobic002G410050--Sobic004G351866 Sobic010G014600 Sobic010G014600 Sobic002G410050--Sobic010G014600 Sobic003G396400 Sobic003G396400 Sobic002G410050--Sobic003G396400 Sobic003G045800 Sobic003G045800 Sobic002G410050--Sobic003G045800 Sobic005G037500--Sobic002G037000 Sobic005G037500--Sobic006G185400 Sobic005G037500--Sobic004G330500 Sobic005G189400 Sobic005G189400 Sobic005G037500--Sobic005G189400 Sobic002G205201 Sobic002G205201 Sobic005G037500--Sobic002G205201 Sobic007G152200 Sobic007G152200 Sobic005G037500--Sobic007G152200 Sobic006G209100 Sobic006G209100 Sobic005G037500--Sobic006G209100 Sobic001G361500 Sobic001G361500 Sobic005G037500--Sobic001G361500 Sobic008G023500 Sobic008G023500 Sobic005G037500--Sobic008G023500 Sobic007G072901 Sobic007G072901 Sobic002G052500--Sobic007G072901 Sobic002G052500--Sobic003G245700 Sobic003G343100 Sobic003G343100 Sobic002G052500--Sobic003G343100 Sobic002G052500--Sobic008G023500 Sobic006G090201 Sobic006G090201 Sobic002G052500--Sobic006G090201 Sobic002G052500--Sobic006G185400 Sobic009G010800 Sobic009G010800 Sobic002G052500--Sobic009G010800 Sobic003G178200 Sobic003G178200 Sobic002G052500--Sobic003G178200 Sobic002G052500--Sobic004G330500 Sobic003G309600 Sobic003G309600 Sobic006G136900--Sobic003G309600 Sobic001G308450 Sobic001G308450 Sobic006G136900--Sobic001G308450 Sobic004G199000 Sobic004G199000 Sobic006G136900--Sobic004G199000 Sobic009G004000 Sobic009G004000 Sobic006G136900--Sobic009G004000 Sobic010G197400 Sobic010G197400 Sobic006G136900--Sobic010G197400 Sobic001G261553 Sobic001G261553 Sobic006G136900--Sobic001G261553 Sobic002G003900 Sobic002G003900 Sobic006G136900--Sobic002G003900 Sobic009G249301 Sobic009G249301 Sobic006G136900--Sobic009G249301 Sobic008G150150 Sobic008G150150 Sobic006G136900--Sobic008G150150 Sobic010G173550--Sobic005G106800 Sobic010G173550--Sobic003G299400 Sobic010G173550--Sobic009G165050 Sobic004G325766 Sobic004G325766 Sobic010G173550--Sobic004G325766 Sobic005G008301 Sobic005G008301 Sobic010G173550--Sobic005G008301 Sobic010G173550--Sobic003G045800 Sobic010G173550--Sobic002G205201 Sobic010G173550--Sobic007G152200 Sobic010G275550 Sobic010G275550 Sobic010G173550--Sobic010G275550 Sobic004G330500--Sobic005G189400 Sobic004G330500--Sobic006G185400 Sobic004G330500--Sobic007G152200 Sobic004G330500--Sobic002G205201 Sobic004G330500--Sobic001G361500 Sobic004G330500--Sobic006G209100 Sobic004G330500--Sobic008G023500 Sobic004G330500--Sobic005G037500 Sobic004G330500--Sobic006G090201 Sobic006G185400--Sobic004G330500 Sobic006G185400--Sobic005G189400 Sobic006G185400--Sobic001G361500 Sobic006G185400--Sobic007G152200 Sobic006G185400--Sobic002G205201 Sobic006G185400--Sobic006G209100 Sobic006G185400--Sobic008G023500 Sobic006G185400--Sobic005G037500 Sobic009G164200 Sobic009G164200 Sobic006G185400--Sobic009G164200
Octagon: transcription factors


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