Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G136900.1
Synonym
Functional annotation transferase family protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6PLV1
Pfam -
Panther DB PTHR31642 PTHR31642:SF37
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g39850.1 : transferase family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.006G136900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G309600 wax synthase, putative, expressed -
2 Sobic.001G308450 - -
3 Sobic.004G199000 expressed protein -
4 Sobic.009G004000 - -
5 Sobic.010G197400 tetratricopeptide-like helical, putative, expressed -
6 Sobic.001G261553 - -
7 Sobic.002G003900 - -
8 Sobic.009G249301 - -
9 Sobic.008G150150 - -
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12 Sobic.009G225300 - -
13 Sobic.002G068500 expressed protein -
14 Sobic.003G335800 - -
15 Sobic.001G410800 OsTOP6A3 - Topoisomerase 6 subunit A homolog 3, expressed K10878: meiotic recombination protein SPO11
16 Sobic.001G197500 - -
17 Sobic.001G220200 exo70 exocyst complex subunit domain containing protein, expressed -
18 Sobic.001G139600 - -
19 Sobic.004G225450 - -
20 Sobic.010G206700 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic006G136900 Sobic006G136900 Sobic003G309600 Sobic003G309600 Sobic006G136900--Sobic003G309600 Sobic001G308450 Sobic001G308450 Sobic006G136900--Sobic001G308450 Sobic004G199000 Sobic004G199000 Sobic006G136900--Sobic004G199000 Sobic009G004000 Sobic009G004000 Sobic006G136900--Sobic009G004000 Sobic010G197400 Sobic010G197400 Sobic006G136900--Sobic010G197400 Sobic001G261553 Sobic001G261553 Sobic006G136900--Sobic001G261553 Sobic002G003900 Sobic002G003900 Sobic006G136900--Sobic002G003900 Sobic009G249301 Sobic009G249301 Sobic006G136900--Sobic009G249301 Sobic008G150150 Sobic008G150150 Sobic006G136900--Sobic008G150150 Sobic002G218200 Sobic002G218200 Sobic003G309600--Sobic002G218200 Sobic001G410800 Sobic001G410800 Sobic003G309600--Sobic001G410800 Sobic004G357033 Sobic004G357033 Sobic003G309600--Sobic004G357033 Sobic001G220200 Sobic001G220200 Sobic003G309600--Sobic001G220200 Sobic006G204000 Sobic006G204000 Sobic003G309600--Sobic006G204000 Sobic010G096801 Sobic010G096801 Sobic003G309600--Sobic010G096801 Sobic001G139600 Sobic001G139600 Sobic003G309600--Sobic001G139600 Sobic001G519300 Sobic001G519300 Sobic003G309600--Sobic001G519300 Sobic001G535601 Sobic001G535601 Sobic003G309600--Sobic001G535601 Sobic001G308450--Sobic002G003900 Sobic001G068901 Sobic001G068901 Sobic001G308450--Sobic001G068901 Sobic009G225300 Sobic009G225300 Sobic001G308450--Sobic009G225300 Sobic001G537600 Sobic001G537600 Sobic001G308450--Sobic001G537600 Sobic010G242100 Sobic010G242100 Sobic001G308450--Sobic010G242100 Sobic006G065200 Sobic006G065200 Sobic001G308450--Sobic006G065200 Sobic001G308450--Sobic010G197400 Sobic002G068500 Sobic002G068500 Sobic001G308450--Sobic002G068500 Sobic001G308450--Sobic010G096801 Sobic004G199000--Sobic009G004000 Sobic004G199000--Sobic001G261553 Sobic004G199000--Sobic010G096801 Sobic004G199000--Sobic001G139600 Sobic010G206700 Sobic010G206700 Sobic004G199000--Sobic010G206700 Sobic004G199000--Sobic002G003900 Sobic004G357066 Sobic004G357066 Sobic004G199000--Sobic004G357066 Sobic005G232200 Sobic005G232200 Sobic004G199000--Sobic005G232200 Sobic001G019100 Sobic001G019100 Sobic004G199000--Sobic001G019100 Sobic009G004000--Sobic004G199000 Sobic009G004000--Sobic001G261553 Sobic009G004000--Sobic001G019100 Sobic009G004000--Sobic008G150150 Sobic009G004000--Sobic010G206700 Sobic010G275550 Sobic010G275550 Sobic009G004000--Sobic010G275550 Sobic002G037000 Sobic002G037000 Sobic009G004000--Sobic002G037000 Sobic004G351866 Sobic004G351866 Sobic009G004000--Sobic004G351866 Sobic009G004000--Sobic001G139600 Sobic010G197400--Sobic010G242100 Sobic010G197400--Sobic001G308450 Sobic010G197400--Sobic001G068901 Sobic010G197400--Sobic002G003900 Sobic006G140900 Sobic006G140900 Sobic010G197400--Sobic006G140900 Sobic010G253700 Sobic010G253700 Sobic010G197400--Sobic010G253700 Sobic010G197400--Sobic002G068500 Sobic010G197400--Sobic009G225300 Sobic010G197400--Sobic001G537600 Sobic001G261553--Sobic004G199000 Sobic001G261553--Sobic009G004000 Sobic001G261553--Sobic004G357066 Sobic001G261553--Sobic010G096801 Sobic001G261553--Sobic001G139600 Sobic001G261553--Sobic005G232200 Sobic002G140100 Sobic002G140100 Sobic001G261553--Sobic002G140100 Sobic004G225450 Sobic004G225450 Sobic001G261553--Sobic004G225450 Sobic001G261553--Sobic001G220200 Sobic002G003900--Sobic004G199000 Sobic002G003900--Sobic001G308450 Sobic002G003900--Sobic001G261553 Sobic002G003900--Sobic009G004000 Sobic002G003900--Sobic010G096801 Sobic002G003900--Sobic004G357066 Sobic002G003900--Sobic004G225450 Sobic002G003900--Sobic001G220200 Sobic001G197500 Sobic001G197500 Sobic002G003900--Sobic001G197500 Sobic009G249301--Sobic008G150150 Sobic010G074960 Sobic010G074960 Sobic009G249301--Sobic010G074960 Sobic009G249301--Sobic001G019100 Sobic009G249301--Sobic010G275550 Sobic010G058650 Sobic010G058650 Sobic009G249301--Sobic010G058650 Sobic003G288900 Sobic003G288900 Sobic009G249301--Sobic003G288900 Sobic009G194600 Sobic009G194600 Sobic009G249301--Sobic009G194600 Sobic009G249301--Sobic009G004000 Sobic003G343100 Sobic003G343100 Sobic009G249301--Sobic003G343100 Sobic008G150150--Sobic001G019100 Sobic003G335800 Sobic003G335800 Sobic008G150150--Sobic003G335800 Sobic008G150150--Sobic002G037000 Sobic008G150150--Sobic010G275550 Sobic005G037500 Sobic005G037500 Sobic008G150150--Sobic005G037500 Sobic001G060666 Sobic001G060666 Sobic008G150150--Sobic001G060666 Sobic008G150150--Sobic009G004000 Sobic001G172900 Sobic001G172900 Sobic008G150150--Sobic001G172900 Sobic002G205201 Sobic002G205201 Sobic008G150150--Sobic002G205201
Octagon: transcription factors


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