Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G232000.1
Synonym Sb01g020340
Functional annotation glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed
UniProt C5WZJ0
Pfam -
Panther DB PTHR33548 PTHR33548:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g31540.1 : glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a006740 , Zm00025a017698
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G232000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G003400 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
2 Sobic.008G035800 glycosyltransferase, putative, expressed K08238: xyloglucan 6-xylosyltransferase
3 Sobic.003G419300 xylanase inhibitor, putative, expressed -
4 Sobic.007G090600 CSLC3 - cellulose synthase-like family C, expressed -
5 Sobic.003G282300 POEI51 - Pollen Ole e I allergen and extensin family protein precursor, expressed -
6 Sobic.008G077900 exostosin family domain containing protein, expressed -
7 Sobic.002G118900 auxin-induced protein 5NG4, putative, expressed -
8 Sobic.001G263300 glycosyltransferase, putative, expressed K18207: POMGNT2, protein O-mannose beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase
9 Sobic.009G208700 POEI45 - Pollen Ole e I allergen and extensin family protein precursor, expressed -
10 Sobic.004G322000 hypro1, putative, expressed -
11 Sobic.009G058400 expressed protein -
12 Sobic.002G343100 protein kinase, putative, expressed -
13 Sobic.003G140200 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
14 Sobic.010G130500 SAM dependent carboxyl methyltransferase, putative, expressed -
15 Sobic.002G239700 receptor-like protein kinase 2 precursor, putative, expressed -
16 Sobic.003G419400 xylanase inhibitor, putative, expressed -
17 Sobic.009G060700 receptor-like protein kinase 2 precursor, putative, expressed -
18 Sobic.002G076700 IPP transferase, putative, expressed K10760: adenylate dimethylallyltransferase (cytokinin synthase)
19 Sobic.002G391400 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
20 Sobic.004G271800 WRKY66, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G232000 Sobic001G232000 Sobic002G003400 Sobic002G003400 Sobic001G232000--Sobic002G003400 Sobic008G035800 Sobic008G035800 Sobic001G232000--Sobic008G035800 Sobic003G419300 Sobic003G419300 Sobic001G232000--Sobic003G419300 Sobic007G090600 Sobic007G090600 Sobic001G232000--Sobic007G090600 Sobic003G282300 Sobic003G282300 Sobic001G232000--Sobic003G282300 Sobic008G077900 Sobic008G077900 Sobic001G232000--Sobic008G077900 Sobic002G118900 Sobic002G118900 Sobic001G232000--Sobic002G118900 Sobic001G263300 Sobic001G263300 Sobic001G232000--Sobic001G263300 Sobic009G208700 Sobic009G208700 Sobic001G232000--Sobic009G208700 Sobic005G175900 Sobic005G175900 Sobic002G003400--Sobic005G175900 Sobic002G003400--Sobic001G232000 Sobic006G196400 Sobic006G196400 Sobic002G003400--Sobic006G196400 Sobic002G115600 Sobic002G115600 Sobic002G003400--Sobic002G115600 Sobic002G003400--Sobic007G090600 Sobic009G060700 Sobic009G060700 Sobic002G003400--Sobic009G060700 Sobic002G003400--Sobic001G263300 Sobic004G008600 Sobic004G008600 Sobic002G003400--Sobic004G008600 Sobic002G003400--Sobic002G118900 Sobic003G240400 Sobic003G240400 Sobic008G035800--Sobic003G240400 Sobic008G035800--Sobic003G282300 Sobic008G035800--Sobic007G090600 Sobic004G322000 Sobic004G322000 Sobic008G035800--Sobic004G322000 Sobic008G035800--Sobic009G208700 Sobic010G152400 Sobic010G152400 Sobic008G035800--Sobic010G152400 Sobic003G140200 Sobic003G140200 Sobic008G035800--Sobic003G140200 Sobic004G271800 Sobic004G271800 Sobic008G035800--Sobic004G271800 Sobic010G082000 Sobic010G082000 Sobic008G035800--Sobic010G082000 Sobic003G419300--Sobic001G232000 Sobic003G419400 Sobic003G419400 Sobic003G419300--Sobic003G419400 Sobic003G419300--Sobic008G035800 Sobic009G058600 Sobic009G058600 Sobic003G419300--Sobic009G058600 Sobic002G239700 Sobic002G239700 Sobic003G419300--Sobic002G239700 Sobic004G214300 Sobic004G214300 Sobic003G419300--Sobic004G214300 Sobic003G324600 Sobic003G324600 Sobic003G419300--Sobic003G324600 Sobic004G112200 Sobic004G112200 Sobic003G419300--Sobic004G112200 Sobic003G419300--Sobic009G208700 Sobic006G031100 Sobic006G031100 Sobic007G090600--Sobic006G031100 Sobic007G090600--Sobic003G282300 Sobic007G090600--Sobic004G322000 Sobic003G215300 Sobic003G215300 Sobic007G090600--Sobic003G215300 Sobic004G014600 Sobic004G014600 Sobic007G090600--Sobic004G014600 Sobic007G090600--Sobic006G196400 Sobic006G205700 Sobic006G205700 Sobic007G090600--Sobic006G205700 Sobic007G090600--Sobic003G240400 Sobic007G090600--Sobic002G115600 Sobic003G282300--Sobic007G090600 Sobic006G085700 Sobic006G085700 Sobic003G282300--Sobic006G085700 Sobic003G282300--Sobic003G140200 Sobic004G106100 Sobic004G106100 Sobic003G282300--Sobic004G106100 Sobic003G282300--Sobic008G035800 Sobic003G282300--Sobic006G205700 Sobic003G282300--Sobic006G031100 Sobic003G095100 Sobic003G095100 Sobic003G282300--Sobic003G095100 Sobic003G282300--Sobic004G322000 Sobic003G001300 Sobic003G001300 Sobic008G077900--Sobic003G001300 Sobic005G222600 Sobic005G222600 Sobic008G077900--Sobic005G222600 Sobic008G077900--Sobic003G140200 Sobic008G077900--Sobic004G322000 Sobic008G077900--Sobic002G239700 Sobic008G077900--Sobic009G060700 Sobic006G205500 Sobic006G205500 Sobic008G077900--Sobic006G205500 Sobic008G077900--Sobic007G090600 Sobic005G071700 Sobic005G071700 Sobic008G077900--Sobic005G071700 Sobic003G269900 Sobic003G269900 Sobic002G118900--Sobic003G269900 Sobic002G118900--Sobic002G115600 Sobic002G118900--Sobic001G263300 Sobic005G216500 Sobic005G216500 Sobic002G118900--Sobic005G216500 Sobic002G118900--Sobic002G003400 Sobic002G118900--Sobic006G196400 Sobic009G032900 Sobic009G032900 Sobic002G118900--Sobic009G032900 Sobic003G046700 Sobic003G046700 Sobic002G118900--Sobic003G046700 Sobic005G080600 Sobic005G080600 Sobic002G118900--Sobic005G080600 Sobic001G263300--Sobic003G240400 Sobic001G263300--Sobic005G175900 Sobic001G263300--Sobic003G215300 Sobic001G263300--Sobic002G115600 Sobic001G263300--Sobic007G090600 Sobic001G263300--Sobic006G196400 Sobic005G097600 Sobic005G097600 Sobic001G263300--Sobic005G097600 Sobic001G263300--Sobic006G031100 Sobic001G263300--Sobic004G322000 Sobic002G343100 Sobic002G343100 Sobic009G208700--Sobic002G343100 Sobic009G208700--Sobic003G282300 Sobic009G208700--Sobic008G035800 Sobic009G208700--Sobic007G090600 Sobic009G208700--Sobic004G322000 Sobic009G181600 Sobic009G181600 Sobic009G208700--Sobic009G181600 Sobic010G130500 Sobic010G130500 Sobic009G208700--Sobic010G130500 Sobic009G208700--Sobic006G085700 Sobic009G208700--Sobic003G240400
Octagon: transcription factors


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