Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G377050.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S9V5
Pfam -
Panther DB PTHR33186 PTHR33186:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g20440.2 : OsMADS69 - MADS-box family gene with M-alpha type-box, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G394000 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
2 Sobic.007G090466 - -
3 Sobic.002G007400 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
4 Sobic.002G429900 PHD finger family protein, putative, expressed -
5 Sobic.004G214500 plant protein of unknown function DUF869 domain containing protein, expressed -
6 Sobic.002G010150 - -
7 Sobic.004G289200 OsSub43 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
8 Sobic.001G266500 LTPL37 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
9 Sobic.001G116300 - -
10 Sobic.007G078200 cycloartenol synthase, putative, expressed K01853: cycloartenol synthase
11 Sobic.010G108001 - K15397: 3-ketoacyl-CoA synthase
12 Sobic.003G239400 wax synthase isoform 3, putative, expressed -
13 Sobic.003G206000 THION27 - Plant thionin family protein precursor, expressed -
14 Sobic.003G162500 expressed protein -
15 Sobic.001G332050 - -
16 Sobic.001G332050 - -
17 Sobic.001G332050 - -
18 Sobic.001G332050 - -
19 Sobic.001G332050 - -
20 Sobic.001G332050 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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