Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G399501.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5SA88
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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TAIR -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G144100 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
2 Sobic.004G089700 - -
3 Sobic.002G339250 - -
4 Sobic.009G187500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@MONOCULM 1, putative, expressed -
5 Sobic.010G002850 - -
6 Sobic.008G023000 expressed protein -
7 Sobic.001G527400 - -
8 Sobic.008G002100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein -
9 Sobic.004G224300 5-azacytidine resistance protein related, putative, expressed -
10 Sobic.007G183000 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
11 Sobic.004G206900 expressed protein -
12 Sobic.004G226300 expressed protein -
13 Sobic.002G048250 - -
14 Sobic.003G173032 - -
15 Sobic.005G231800 tropinone reductase, putative, expressed K08081: tropinone reductase I
16 Sobic.005G209800 nodulin, putative, expressed -
17 Sobic.006G171000 Highest expression level in primordial inflorescence(PubMedID : 27501690)@OsSPL7 - SBP-box gene family member, expressed -
18 Sobic.003G337700 WRKY20, expressed -
19 Sobic.001G457100 - -
20 Sobic.003G290700 anthocyanidin 5,3-O-glucosyltransferase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G399501 Sobic001G399501 Sobic008G144100 Sobic008G144100 Sobic001G399501--Sobic008G144100 Sobic004G089700 Sobic004G089700 Sobic001G399501--Sobic004G089700 Sobic002G339250 Sobic002G339250 Sobic001G399501--Sobic002G339250 Sobic009G187500 Sobic009G187500 Sobic001G399501--Sobic009G187500 Sobic010G002850 Sobic010G002850 Sobic001G399501--Sobic010G002850 Sobic008G023000 Sobic008G023000 Sobic001G399501--Sobic008G023000 Sobic001G527400 Sobic001G527400 Sobic001G399501--Sobic001G527400 Sobic008G002100 Sobic008G002100 Sobic001G399501--Sobic008G002100 Sobic004G224300 Sobic004G224300 Sobic001G399501--Sobic004G224300 Sobic008G144100--Sobic001G399501 Sobic008G144100--Sobic004G089700 Sobic008G144100--Sobic002G339250 Sobic008G144100--Sobic009G187500 Sobic008G144100--Sobic008G023000 Sobic008G144100--Sobic010G002850 Sobic004G226300 Sobic004G226300 Sobic008G144100--Sobic004G226300 Sobic006G171000 Sobic006G171000 Sobic008G144100--Sobic006G171000 Sobic008G144100--Sobic001G527400 Sobic002G048250 Sobic002G048250 Sobic004G089700--Sobic002G048250 Sobic007G183000 Sobic007G183000 Sobic004G089700--Sobic007G183000 Sobic005G231800 Sobic005G231800 Sobic004G089700--Sobic005G231800 Sobic004G089700--Sobic008G023000 Sobic004G089700--Sobic001G527400 Sobic004G089700--Sobic004G226300 Sobic004G089700--Sobic008G002100 Sobic005G209800 Sobic005G209800 Sobic004G089700--Sobic005G209800 Sobic004G347866 Sobic004G347866 Sobic004G089700--Sobic004G347866 Sobic002G339250--Sobic004G347866 Sobic002G339250--Sobic004G089700 Sobic002G339250--Sobic002G048250 Sobic001G457100 Sobic001G457100 Sobic002G339250--Sobic001G457100 Sobic002G339250--Sobic004G226300 Sobic002G339250--Sobic007G183000 Sobic007G157550 Sobic007G157550 Sobic002G339250--Sobic007G157550 Sobic002G339250--Sobic001G527400 Sobic004G206900 Sobic004G206900 Sobic002G339250--Sobic004G206900 Sobic009G187500--Sobic002G048250 Sobic009G187500--Sobic008G002100 Sobic009G187500--Sobic004G089700 Sobic009G187500--Sobic007G183000 Sobic009G187500--Sobic001G527400 Sobic009G187500--Sobic008G023000 Sobic009G187500--Sobic005G209800 Sobic009G187500--Sobic004G226300 Sobic009G187500--Sobic004G224300 Sobic010G002850--Sobic005G209800 Sobic010G002850--Sobic008G023000 Sobic010G002850--Sobic008G002100 Sobic010G002850--Sobic004G226300 Sobic010G002850--Sobic001G527400 Sobic010G002850--Sobic007G183000 Sobic010G002850--Sobic006G171000 Sobic005G156700 Sobic005G156700 Sobic010G002850--Sobic005G156700 Sobic010G002850--Sobic005G231800 Sobic008G023000--Sobic008G002100 Sobic008G023000--Sobic001G527400 Sobic008G023000--Sobic007G183000 Sobic008G023000--Sobic005G209800 Sobic008G023000--Sobic004G226300 Sobic003G173032 Sobic003G173032 Sobic008G023000--Sobic003G173032 Sobic008G023000--Sobic005G231800 Sobic008G023000--Sobic002G048250 Sobic008G023000--Sobic006G171000 Sobic001G527400--Sobic008G023000 Sobic001G527400--Sobic008G002100 Sobic001G527400--Sobic007G183000 Sobic001G527400--Sobic004G226300 Sobic001G527400--Sobic002G048250 Sobic001G527400--Sobic005G209800 Sobic001G527400--Sobic005G231800 Sobic001G527400--Sobic003G173032 Sobic001G527400--Sobic006G171000 Sobic008G002100--Sobic008G023000 Sobic008G002100--Sobic001G527400 Sobic008G002100--Sobic005G209800 Sobic008G002100--Sobic007G183000 Sobic008G002100--Sobic004G226300 Sobic008G002100--Sobic005G231800 Sobic008G002100--Sobic003G173032 Sobic008G002100--Sobic002G048250 Sobic008G002100--Sobic006G171000 Sobic004G224300--Sobic008G023000 Sobic004G224300--Sobic001G527400 Sobic004G224300--Sobic007G183000 Sobic004G224300--Sobic002G048250 Sobic004G224300--Sobic008G002100 Sobic003G337700 Sobic003G337700 Sobic004G224300--Sobic003G337700 Sobic004G224300--Sobic004G226300 Sobic004G224300--Sobic005G231800 Sobic004G224300--Sobic005G209800
Octagon: transcription factors


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