Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G421200.2
Synonym PLL5, Sb01g039620
Functional annotation protein phosphatase 2C, putative, expressed
UniProt A0A1Z5SA73
Pfam PF00481
Panther DB PTHR13832 PTHR13832:SF349
NCBI CDD KOG0700; Protein phosphatase 2C/pyruvate dehydrogenase (lipoamide) phosphatase
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0003824; catalytic activity GO:0006470protein dephosphorylation GO:0004722protein serine/threonine phosphatase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G07630 : pol-like 5
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g16760.1 : protein phosphatase 2C, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a001837 , Zm00025a052757 , Zm00025a052758
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic001G421200 Sobic001G421200 Sobic009G117800 Sobic009G117800 Sobic001G421200--Sobic009G117800 Sobic002G018166 Sobic002G018166 Sobic001G421200--Sobic002G018166 Sobic003G038901 Sobic003G038901 Sobic001G421200--Sobic003G038901 Sobic009G082100 Sobic009G082100 Sobic001G421200--Sobic009G082100 Sobic006G082200 Sobic006G082200 Sobic001G421200--Sobic006G082200 Sobic003G027700 Sobic003G027700 Sobic001G421200--Sobic003G027700 Sobic006G028000 Sobic006G028000 Sobic001G421200--Sobic006G028000 Sobic010G078200 Sobic010G078200 Sobic001G421200--Sobic010G078200 Sobic003G437300 Sobic003G437300 Sobic001G421200--Sobic003G437300 Sobic009G117800--Sobic002G018166 Sobic009G117800--Sobic003G038901 Sobic009G117800--Sobic001G421200 Sobic004G139400 Sobic004G139400 Sobic009G117800--Sobic004G139400 Sobic009G117800--Sobic009G082100 Sobic010G111500 Sobic010G111500 Sobic009G117800--Sobic010G111500 Sobic009G117800--Sobic003G027700 Sobic008G059566 Sobic008G059566 Sobic009G117800--Sobic008G059566 Sobic009G117800--Sobic006G082200 Sobic002G018166--Sobic009G117800 Sobic002G018166--Sobic003G038901 Sobic002G018166--Sobic001G421200 Sobic002G018166--Sobic010G111500 Sobic002G018166--Sobic004G139400 Sobic002G018166--Sobic008G059566 Sobic008G073700 Sobic008G073700 Sobic002G018166--Sobic008G073700 Sobic002G078600 Sobic002G078600 Sobic002G018166--Sobic002G078600 Sobic002G018166--Sobic009G082100 Sobic003G038901--Sobic009G117800 Sobic003G038901--Sobic002G018166 Sobic003G038901--Sobic001G421200 Sobic003G038901--Sobic010G111500 Sobic003G038901--Sobic002G078600 Sobic003G391700 Sobic003G391700 Sobic003G038901--Sobic003G391700 Sobic007G196201 Sobic007G196201 Sobic003G038901--Sobic007G196201 Sobic007G090418 Sobic007G090418 Sobic003G038901--Sobic007G090418 Sobic003G038901--Sobic008G059566 Sobic009G082100--Sobic003G027700 Sobic005G083160 Sobic005G083160 Sobic009G082100--Sobic005G083160 Sobic010G107300 Sobic010G107300 Sobic009G082100--Sobic010G107300 Sobic009G218100 Sobic009G218100 Sobic009G082100--Sobic009G218100 Sobic005G226150 Sobic005G226150 Sobic009G082100--Sobic005G226150 Sobic003G342000 Sobic003G342000 Sobic009G082100--Sobic003G342000 Sobic001G233900 Sobic001G233900 Sobic009G082100--Sobic001G233900 Sobic008G088881 Sobic008G088881 Sobic009G082100--Sobic008G088881 Sobic009G082100--Sobic010G078200 Sobic003G159850 Sobic003G159850 Sobic006G082200--Sobic003G159850 Sobic009G040000 Sobic009G040000 Sobic006G082200--Sobic009G040000 Sobic005G173800 Sobic005G173800 Sobic006G082200--Sobic005G173800 Sobic003G414000 Sobic003G414000 Sobic006G082200--Sobic003G414000 Sobic010G085700 Sobic010G085700 Sobic006G082200--Sobic010G085700 Sobic002G007700 Sobic002G007700 Sobic006G082200--Sobic002G007700 Sobic001G233600 Sobic001G233600 Sobic006G082200--Sobic001G233600 Sobic004G099750 Sobic004G099750 Sobic006G082200--Sobic004G099750 Sobic001G175501 Sobic001G175501 Sobic006G082200--Sobic001G175501 Sobic002G381750 Sobic002G381750 Sobic003G027700--Sobic002G381750 Sobic003G027700--Sobic003G342000 Sobic003G027700--Sobic009G082100 Sobic002G016250 Sobic002G016250 Sobic003G027700--Sobic002G016250 Sobic005G165632 Sobic005G165632 Sobic003G027700--Sobic005G165632 Sobic008G064250 Sobic008G064250 Sobic003G027700--Sobic008G064250 Sobic003G027700--Sobic009G218100 Sobic003G027700--Sobic005G083160 Sobic003G389400 Sobic003G389400 Sobic003G027700--Sobic003G389400 Sobic007G205100 Sobic007G205100 Sobic006G028000--Sobic007G205100 Sobic002G338600 Sobic002G338600 Sobic006G028000--Sobic002G338600 Sobic010G200200 Sobic010G200200 Sobic006G028000--Sobic010G200200 Sobic010G200400 Sobic010G200400 Sobic006G028000--Sobic010G200400 Sobic008G039700 Sobic008G039700 Sobic006G028000--Sobic008G039700 Sobic001G259250 Sobic001G259250 Sobic006G028000--Sobic001G259250 Sobic005G153200 Sobic005G153200 Sobic006G028000--Sobic005G153200 Sobic002G028100 Sobic002G028100 Sobic006G028000--Sobic002G028100 Sobic004G142000 Sobic004G142000 Sobic006G028000--Sobic004G142000 Sobic007G070700 Sobic007G070700 Sobic010G078200--Sobic007G070700 Sobic007G083300 Sobic007G083300 Sobic010G078200--Sobic007G083300 Sobic007G049400 Sobic007G049400 Sobic010G078200--Sobic007G049400 Sobic001G277800 Sobic001G277800 Sobic010G078200--Sobic001G277800 Sobic005G140400 Sobic005G140400 Sobic010G078200--Sobic005G140400 Sobic003G247700 Sobic003G247700 Sobic010G078200--Sobic003G247700 Sobic002G077500 Sobic002G077500 Sobic010G078200--Sobic002G077500 Sobic001G253501 Sobic001G253501 Sobic010G078200--Sobic001G253501 Sobic009G245750 Sobic009G245750 Sobic010G078200--Sobic009G245750 Sobic006G244500 Sobic006G244500 Sobic003G437300--Sobic006G244500 Sobic003G062200 Sobic003G062200 Sobic003G437300--Sobic003G062200 Sobic009G009800 Sobic009G009800 Sobic003G437300--Sobic009G009800 Sobic003G437300--Sobic006G028000 Sobic008G037000 Sobic008G037000 Sobic003G437300--Sobic008G037000 Sobic003G437300--Sobic001G277800 Sobic003G437300--Sobic006G082200 Sobic007G194100 Sobic007G194100 Sobic003G437300--Sobic007G194100 Sobic003G437300--Sobic009G082100
Octagon: transcription factors


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