Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G117800.1
Synonym SCL-3, SCL3, Sb09g018550
Functional annotation Scarecrow-like 3 (PubMedID : 26320239)
GRAS family transcription factor containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5R369
Pfam PF03514
Panther DB PTHR31636 PTHR31636:SF13
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005634; nucleus GO:0000989obsolete transcription factor activity, transcription factor binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G50420 : scarecrow-like 3
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g31380.1 : GRAS family transcription factor containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic009G117800 Sobic009G117800 Sobic002G018166 Sobic002G018166 Sobic009G117800--Sobic002G018166 Sobic003G038901 Sobic003G038901 Sobic009G117800--Sobic003G038901 Sobic001G421200 Sobic001G421200 Sobic009G117800--Sobic001G421200 Sobic004G139400 Sobic004G139400 Sobic009G117800--Sobic004G139400 Sobic009G082100 Sobic009G082100 Sobic009G117800--Sobic009G082100 Sobic010G111500 Sobic010G111500 Sobic009G117800--Sobic010G111500 Sobic003G027700 Sobic003G027700 Sobic009G117800--Sobic003G027700 Sobic008G059566 Sobic008G059566 Sobic009G117800--Sobic008G059566 Sobic006G082200 Sobic006G082200 Sobic009G117800--Sobic006G082200 Sobic002G018166--Sobic009G117800 Sobic002G018166--Sobic003G038901 Sobic002G018166--Sobic001G421200 Sobic002G018166--Sobic010G111500 Sobic002G018166--Sobic004G139400 Sobic002G018166--Sobic008G059566 Sobic008G073700 Sobic008G073700 Sobic002G018166--Sobic008G073700 Sobic002G078600 Sobic002G078600 Sobic002G018166--Sobic002G078600 Sobic002G018166--Sobic009G082100 Sobic003G038901--Sobic009G117800 Sobic003G038901--Sobic002G018166 Sobic003G038901--Sobic001G421200 Sobic003G038901--Sobic010G111500 Sobic003G038901--Sobic002G078600 Sobic003G391700 Sobic003G391700 Sobic003G038901--Sobic003G391700 Sobic007G196201 Sobic007G196201 Sobic003G038901--Sobic007G196201 Sobic007G090418 Sobic007G090418 Sobic003G038901--Sobic007G090418 Sobic003G038901--Sobic008G059566 Sobic001G421200--Sobic009G117800 Sobic001G421200--Sobic002G018166 Sobic001G421200--Sobic003G038901 Sobic001G421200--Sobic009G082100 Sobic001G421200--Sobic006G082200 Sobic001G421200--Sobic003G027700 Sobic006G028000 Sobic006G028000 Sobic001G421200--Sobic006G028000 Sobic010G078200 Sobic010G078200 Sobic001G421200--Sobic010G078200 Sobic003G437300 Sobic003G437300 Sobic001G421200--Sobic003G437300 Sobic004G139400--Sobic010G111500 Sobic004G139400--Sobic008G059566 Sobic004G139400--Sobic002G018166 Sobic009G053001 Sobic009G053001 Sobic004G139400--Sobic009G053001 Sobic004G139400--Sobic009G117800 Sobic002G005500 Sobic002G005500 Sobic004G139400--Sobic002G005500 Sobic002G349800 Sobic002G349800 Sobic004G139400--Sobic002G349800 Sobic010G062600 Sobic010G062600 Sobic004G139400--Sobic010G062600 Sobic004G133800 Sobic004G133800 Sobic004G139400--Sobic004G133800 Sobic009G082100--Sobic003G027700 Sobic005G083160 Sobic005G083160 Sobic009G082100--Sobic005G083160 Sobic010G107300 Sobic010G107300 Sobic009G082100--Sobic010G107300 Sobic009G218100 Sobic009G218100 Sobic009G082100--Sobic009G218100 Sobic005G226150 Sobic005G226150 Sobic009G082100--Sobic005G226150 Sobic003G342000 Sobic003G342000 Sobic009G082100--Sobic003G342000 Sobic001G233900 Sobic001G233900 Sobic009G082100--Sobic001G233900 Sobic008G088881 Sobic008G088881 Sobic009G082100--Sobic008G088881 Sobic009G082100--Sobic010G078200 Sobic010G111500--Sobic007G090418 Sobic001G022000 Sobic001G022000 Sobic010G111500--Sobic001G022000 Sobic010G111500--Sobic002G078600 Sobic010G111500--Sobic003G391700 Sobic002G352900 Sobic002G352900 Sobic010G111500--Sobic002G352900 Sobic002G303950 Sobic002G303950 Sobic010G111500--Sobic002G303950 Sobic010G111500--Sobic004G139400 Sobic008G024000 Sobic008G024000 Sobic010G111500--Sobic008G024000 Sobic010G111500--Sobic002G018166 Sobic002G381750 Sobic002G381750 Sobic003G027700--Sobic002G381750 Sobic003G027700--Sobic003G342000 Sobic003G027700--Sobic009G082100 Sobic002G016250 Sobic002G016250 Sobic003G027700--Sobic002G016250 Sobic005G165632 Sobic005G165632 Sobic003G027700--Sobic005G165632 Sobic008G064250 Sobic008G064250 Sobic003G027700--Sobic008G064250 Sobic003G027700--Sobic009G218100 Sobic003G027700--Sobic005G083160 Sobic003G389400 Sobic003G389400 Sobic003G027700--Sobic003G389400 Sobic008G059566--Sobic002G078600 Sobic003G326100 Sobic003G326100 Sobic008G059566--Sobic003G326100 Sobic008G059566--Sobic009G053001 Sobic003G118700 Sobic003G118700 Sobic008G059566--Sobic003G118700 Sobic008G059566--Sobic002G303950 Sobic009G196100 Sobic009G196100 Sobic008G059566--Sobic009G196100 Sobic001G539760 Sobic001G539760 Sobic008G059566--Sobic001G539760 Sobic007G035100 Sobic007G035100 Sobic008G059566--Sobic007G035100 Sobic010G111700 Sobic010G111700 Sobic008G059566--Sobic010G111700 Sobic003G159850 Sobic003G159850 Sobic006G082200--Sobic003G159850 Sobic009G040000 Sobic009G040000 Sobic006G082200--Sobic009G040000 Sobic005G173800 Sobic005G173800 Sobic006G082200--Sobic005G173800 Sobic003G414000 Sobic003G414000 Sobic006G082200--Sobic003G414000 Sobic010G085700 Sobic010G085700 Sobic006G082200--Sobic010G085700 Sobic002G007700 Sobic002G007700 Sobic006G082200--Sobic002G007700 Sobic001G233600 Sobic001G233600 Sobic006G082200--Sobic001G233600 Sobic004G099750 Sobic004G099750 Sobic006G082200--Sobic004G099750 Sobic001G175501 Sobic001G175501 Sobic006G082200--Sobic001G175501
Octagon: transcription factors


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