Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G139400.4,Sobic.004G139400.3,Sobic.004G139400.2,Sobic.004G139400.1
Synonym Sb04g017036
Functional annotation -
UniProt A0A194YPN3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G111500 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
2 Sobic.008G059566 - -
3 Sobic.002G018166 - -
4 Sobic.009G053001 - -
5 Sobic.009G117800 Scarecrow-like 3(PubMedID : 26320239)@GRAS family transcription factor containing protein, expressed -
6 Sobic.002G005500 dirigent, putative, expressed -
7 Sobic.002G349800 ubiquitin-like protein SMT3, putative, expressed K12160: SUMO, small ubiquitin-related modifier
8 Sobic.010G062600 - -
9 Sobic.004G133800 expressed protein -
10 Sobic.001G263801 - -
11 Sobic.004G303150 - -
12 Sobic.007G025350 - -
13 Sobic.010G172666 - -
14 Sobic.001G493600 vesicle-associated membrane protein, putative, expressed -
15 Sobic.002G078600 LTPL169 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
16 Sobic.002G223100 annexin, putative, expressed -
17 Sobic.009G111700 late embryogenesis abundant protein, putative, expressed -
18 Sobic.009G239000 OsMADS78 - MADS-box family gene with M-alpha type-box, expressed -
19 Sobic.002G069232 - -
20 Sobic.008G116900 OsFBL38 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G139400 Sobic004G139400 Sobic010G111500 Sobic010G111500 Sobic004G139400--Sobic010G111500 Sobic008G059566 Sobic008G059566 Sobic004G139400--Sobic008G059566 Sobic002G018166 Sobic002G018166 Sobic004G139400--Sobic002G018166 Sobic009G053001 Sobic009G053001 Sobic004G139400--Sobic009G053001 Sobic009G117800 Sobic009G117800 Sobic004G139400--Sobic009G117800 Sobic002G005500 Sobic002G005500 Sobic004G139400--Sobic002G005500 Sobic002G349800 Sobic002G349800 Sobic004G139400--Sobic002G349800 Sobic010G062600 Sobic010G062600 Sobic004G139400--Sobic010G062600 Sobic004G133800 Sobic004G133800 Sobic004G139400--Sobic004G133800 Sobic007G090418 Sobic007G090418 Sobic010G111500--Sobic007G090418 Sobic001G022000 Sobic001G022000 Sobic010G111500--Sobic001G022000 Sobic002G078600 Sobic002G078600 Sobic010G111500--Sobic002G078600 Sobic003G391700 Sobic003G391700 Sobic010G111500--Sobic003G391700 Sobic002G352900 Sobic002G352900 Sobic010G111500--Sobic002G352900 Sobic002G303950 Sobic002G303950 Sobic010G111500--Sobic002G303950 Sobic010G111500--Sobic004G139400 Sobic008G024000 Sobic008G024000 Sobic010G111500--Sobic008G024000 Sobic010G111500--Sobic002G018166 Sobic008G059566--Sobic002G078600 Sobic003G326100 Sobic003G326100 Sobic008G059566--Sobic003G326100 Sobic008G059566--Sobic009G053001 Sobic003G118700 Sobic003G118700 Sobic008G059566--Sobic003G118700 Sobic008G059566--Sobic002G303950 Sobic009G196100 Sobic009G196100 Sobic008G059566--Sobic009G196100 Sobic001G539760 Sobic001G539760 Sobic008G059566--Sobic001G539760 Sobic007G035100 Sobic007G035100 Sobic008G059566--Sobic007G035100 Sobic010G111700 Sobic010G111700 Sobic008G059566--Sobic010G111700 Sobic002G018166--Sobic009G117800 Sobic003G038901 Sobic003G038901 Sobic002G018166--Sobic003G038901 Sobic001G421200 Sobic001G421200 Sobic002G018166--Sobic001G421200 Sobic002G018166--Sobic010G111500 Sobic002G018166--Sobic004G139400 Sobic002G018166--Sobic008G059566 Sobic008G073700 Sobic008G073700 Sobic002G018166--Sobic008G073700 Sobic002G018166--Sobic002G078600 Sobic009G082100 Sobic009G082100 Sobic002G018166--Sobic009G082100 Sobic004G303150 Sobic004G303150 Sobic009G053001--Sobic004G303150 Sobic010G172666 Sobic010G172666 Sobic009G053001--Sobic010G172666 Sobic001G493600 Sobic001G493600 Sobic009G053001--Sobic001G493600 Sobic004G286351 Sobic004G286351 Sobic009G053001--Sobic004G286351 Sobic009G239000 Sobic009G239000 Sobic009G053001--Sobic009G239000 Sobic008G116900 Sobic008G116900 Sobic009G053001--Sobic008G116900 Sobic007G069450 Sobic007G069450 Sobic009G053001--Sobic007G069450 Sobic009G053001--Sobic010G111700 Sobic009G053001--Sobic007G035100 Sobic009G117800--Sobic002G018166 Sobic009G117800--Sobic003G038901 Sobic009G117800--Sobic001G421200 Sobic009G117800--Sobic004G139400 Sobic009G117800--Sobic009G082100 Sobic009G117800--Sobic010G111500 Sobic003G027700 Sobic003G027700 Sobic009G117800--Sobic003G027700 Sobic009G117800--Sobic008G059566 Sobic006G082200 Sobic006G082200 Sobic009G117800--Sobic006G082200 Sobic001G263801 Sobic001G263801 Sobic002G005500--Sobic001G263801 Sobic007G025350 Sobic007G025350 Sobic002G005500--Sobic007G025350 Sobic003G226950 Sobic003G226950 Sobic002G005500--Sobic003G226950 Sobic010G201100 Sobic010G201100 Sobic002G005500--Sobic010G201100 Sobic009G111700 Sobic009G111700 Sobic002G005500--Sobic009G111700 Sobic002G005500--Sobic004G133800 Sobic007G119101 Sobic007G119101 Sobic002G005500--Sobic007G119101 Sobic002G031301 Sobic002G031301 Sobic002G005500--Sobic002G031301 Sobic002G125500 Sobic002G125500 Sobic002G005500--Sobic002G125500 Sobic007G139800 Sobic007G139800 Sobic002G349800--Sobic007G139800 Sobic002G349800--Sobic004G133800 Sobic002G069232 Sobic002G069232 Sobic002G349800--Sobic002G069232 Sobic002G349800--Sobic008G116900 Sobic002G349800--Sobic010G062600 Sobic002G349800--Sobic002G005500 Sobic002G349800--Sobic009G239000 Sobic009G017300 Sobic009G017300 Sobic002G349800--Sobic009G017300 Sobic002G349800--Sobic007G119101 Sobic010G062600--Sobic002G349800 Sobic010G062600--Sobic004G133800 Sobic010G062600--Sobic002G069232 Sobic010G062600--Sobic002G005500 Sobic010G062600--Sobic008G116900 Sobic001G359601 Sobic001G359601 Sobic010G062600--Sobic001G359601 Sobic010G062600--Sobic009G239000 Sobic010G062600--Sobic001G263801 Sobic010G062600--Sobic009G111700 Sobic004G133800--Sobic002G069232 Sobic004G133800--Sobic008G116900 Sobic004G133800--Sobic002G005500 Sobic004G133800--Sobic010G201100 Sobic004G133800--Sobic007G119101 Sobic004G133800--Sobic001G263801 Sobic004G133800--Sobic007G025350 Sobic004G133800--Sobic002G031301 Sobic004G133800--Sobic009G111700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.