Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G066000.1
Synonym Sb02g005540
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XBZ1
Pfam PF03478
Panther DB PTHR33165 PTHR33165:SF11
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g72720.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G205800 ATXR, putative, expressed -
2 Sobic.005G189000 - -
3 Sobic.004G207500 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
4 Sobic.005G186250 - -
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8 Sobic.006G142850 - -
9 Sobic.008G181250 - -
10 Sobic.005G184400 - -
11 Sobic.005G184600 - -
12 Sobic.008G144201 - -
13 Sobic.005G227151 - -
14 Sobic.003G415200 DEF1 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
15 Sobic.003G326300 LTPL29 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
16 Sobic.003G099900 expressed protein -
17 Sobic.002G358000 transmembrane receptor, putative, expressed -
18 Sobic.009G086100 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
19 Sobic.002G105900 OsFBD15 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
20 Sobic.006G105300 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic002G066000 Sobic002G066000 Sobic005G205800 Sobic005G205800 Sobic002G066000--Sobic005G205800 Sobic005G189000 Sobic005G189000 Sobic002G066000--Sobic005G189000 Sobic004G207500 Sobic004G207500 Sobic002G066000--Sobic004G207500 Sobic005G186250 Sobic005G186250 Sobic002G066000--Sobic005G186250 Sobic005G083220 Sobic005G083220 Sobic002G066000--Sobic005G083220 Sobic009G007100 Sobic009G007100 Sobic002G066000--Sobic009G007100 Sobic007G049000 Sobic007G049000 Sobic002G066000--Sobic007G049000 Sobic006G142850 Sobic006G142850 Sobic002G066000--Sobic006G142850 Sobic008G181250 Sobic008G181250 Sobic002G066000--Sobic008G181250 Sobic005G205800--Sobic002G066000 Sobic005G205800--Sobic007G049000 Sobic005G184600 Sobic005G184600 Sobic005G205800--Sobic005G184600 Sobic005G184400 Sobic005G184400 Sobic005G205800--Sobic005G184400 Sobic005G205800--Sobic006G142850 Sobic005G205800--Sobic005G186250 Sobic006G105300 Sobic006G105300 Sobic005G205800--Sobic006G105300 Sobic005G205800--Sobic009G007100 Sobic005G184500 Sobic005G184500 Sobic005G205800--Sobic005G184500 Sobic005G189000--Sobic005G083220 Sobic008G144201 Sobic008G144201 Sobic005G189000--Sobic008G144201 Sobic005G189000--Sobic004G207500 Sobic005G189000--Sobic005G186250 Sobic005G189000--Sobic009G007100 Sobic003G415200 Sobic003G415200 Sobic005G189000--Sobic003G415200 Sobic009G086100 Sobic009G086100 Sobic005G189000--Sobic009G086100 Sobic009G019700 Sobic009G019700 Sobic005G189000--Sobic009G019700 Sobic003G326300 Sobic003G326300 Sobic005G189000--Sobic003G326300 Sobic004G207500--Sobic005G186250 Sobic004G207500--Sobic009G007100 Sobic004G207500--Sobic005G189000 Sobic005G227151 Sobic005G227151 Sobic004G207500--Sobic005G227151 Sobic004G207500--Sobic006G142850 Sobic004G207500--Sobic005G083220 Sobic002G105900 Sobic002G105900 Sobic004G207500--Sobic002G105900 Sobic004G207500--Sobic007G049000 Sobic003G099900 Sobic003G099900 Sobic004G207500--Sobic003G099900 Sobic005G186250--Sobic009G007100 Sobic005G186250--Sobic007G049000 Sobic005G186250--Sobic006G142850 Sobic005G186250--Sobic004G207500 Sobic005G186250--Sobic005G184400 Sobic005G186250--Sobic005G184600 Sobic005G186250--Sobic005G189000 Sobic005G186250--Sobic005G083220 Sobic005G186250--Sobic006G105300 Sobic005G083220--Sobic005G189000 Sobic005G083220--Sobic008G144201 Sobic005G083220--Sobic003G415200 Sobic005G083220--Sobic004G207500 Sobic005G083220--Sobic009G086100 Sobic005G083220--Sobic009G019700 Sobic005G148100 Sobic005G148100 Sobic005G083220--Sobic005G148100 Sobic005G083220--Sobic005G186250 Sobic005G083220--Sobic009G007100 Sobic009G007100--Sobic005G186250 Sobic009G007100--Sobic007G049000 Sobic009G007100--Sobic005G184400 Sobic009G007100--Sobic006G142850 Sobic009G007100--Sobic005G184600 Sobic009G007100--Sobic004G207500 Sobic009G007100--Sobic005G189000 Sobic002G358000 Sobic002G358000 Sobic009G007100--Sobic002G358000 Sobic008G082300 Sobic008G082300 Sobic009G007100--Sobic008G082300 Sobic007G049000--Sobic005G184600 Sobic007G049000--Sobic005G184400 Sobic007G049000--Sobic006G142850 Sobic007G049000--Sobic005G186250 Sobic007G049000--Sobic006G105300 Sobic007G049000--Sobic009G007100 Sobic007G049000--Sobic005G184500 Sobic010G035000 Sobic010G035000 Sobic007G049000--Sobic010G035000 Sobic005G185400 Sobic005G185400 Sobic007G049000--Sobic005G185400 Sobic006G142850--Sobic007G049000 Sobic006G142850--Sobic005G184600 Sobic006G142850--Sobic005G184400 Sobic006G142850--Sobic005G186250 Sobic006G142850--Sobic006G105300 Sobic006G142850--Sobic009G007100 Sobic006G142850--Sobic010G035000 Sobic006G142850--Sobic004G207500 Sobic006G142850--Sobic005G184500 Sobic008G181250--Sobic009G019700 Sobic008G181250--Sobic005G148100 Sobic008G181250--Sobic003G415200 Sobic005G189800 Sobic005G189800 Sobic008G181250--Sobic005G189800 Sobic010G136100 Sobic010G136100 Sobic008G181250--Sobic010G136100 Sobic008G181250--Sobic008G144201 Sobic008G181250--Sobic009G086100 Sobic009G196600 Sobic009G196600 Sobic008G181250--Sobic009G196600 Sobic008G181250--Sobic005G083220
Octagon: transcription factors


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