Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G108000.1
Synonym Sb02g009180, ATMYOS1, ATM2, ATM4
Functional annotation myosin, putative, expressed
UniProt A0A1B6QAG9
Pfam -
Panther DB PTHR13140 PTHR13140:SF384
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G54280 : myosin 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g23220.1 : myosin, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a045608
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G032200 expressed protein -
2 Sobic.006G099200 pollen allergen Cyn d 23, putative, expressed -
3 Sobic.005G027250 - -
4 Sobic.004G338900 P21-Rho-binding domain containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.005G072850 - -
6 Sobic.010G015100 expressed protein -
7 Sobic.007G204800 receptor-like protein kinase 1, putative, expressed -
8 Sobic.007G119101 - -
9 Sobic.008G012500 - -
10 Sobic.009G044200 C2 domain containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.002G083100 cadmium/zinc-transporting ATPase, putative, expressed K01534: Zn2+/Cd2+-exporting ATPase
12 Sobic.009G237900 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.002G031301 - -
14 Sobic.001G160900 signal recognition particle 54 kDa protein, putative, expressed K03106: SRP54, signal recognition particle subunit SRP54
15 Sobic.006G130900 - -
16 Sobic.001G120800 - -
17 Sobic.009G111700 late embryogenesis abundant protein, putative, expressed -
18 Sobic.010G201100 expressed protein -
19 Sobic.010G257900 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative, expressed -
20 Sobic.003G315600 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic002G108000 Sobic002G108000 Sobic010G032200 Sobic010G032200 Sobic002G108000--Sobic010G032200 Sobic006G099200 Sobic006G099200 Sobic002G108000--Sobic006G099200 Sobic005G027250 Sobic005G027250 Sobic002G108000--Sobic005G027250 Sobic004G338900 Sobic004G338900 Sobic002G108000--Sobic004G338900 Sobic005G072850 Sobic005G072850 Sobic002G108000--Sobic005G072850 Sobic010G015100 Sobic010G015100 Sobic002G108000--Sobic010G015100 Sobic007G204800 Sobic007G204800 Sobic002G108000--Sobic007G204800 Sobic007G119101 Sobic007G119101 Sobic002G108000--Sobic007G119101 Sobic008G012500 Sobic008G012500 Sobic002G108000--Sobic008G012500 Sobic010G032200--Sobic006G099200 Sobic010G032200--Sobic005G027250 Sobic010G032200--Sobic007G204800 Sobic010G032200--Sobic010G015100 Sobic010G032200--Sobic004G338900 Sobic009G044200 Sobic009G044200 Sobic010G032200--Sobic009G044200 Sobic009G237900 Sobic009G237900 Sobic010G032200--Sobic009G237900 Sobic010G032200--Sobic005G072850 Sobic002G083100 Sobic002G083100 Sobic010G032200--Sobic002G083100 Sobic006G099200--Sobic005G027250 Sobic006G099200--Sobic007G204800 Sobic006G099200--Sobic004G338900 Sobic006G099200--Sobic009G044200 Sobic001G160900 Sobic001G160900 Sobic006G099200--Sobic001G160900 Sobic006G099200--Sobic010G032200 Sobic002G160200 Sobic002G160200 Sobic006G099200--Sobic002G160200 Sobic006G099200--Sobic002G083100 Sobic001G120800 Sobic001G120800 Sobic006G099200--Sobic001G120800 Sobic005G027250--Sobic006G099200 Sobic005G027250--Sobic009G044200 Sobic005G027250--Sobic004G338900 Sobic005G027250--Sobic007G204800 Sobic005G027250--Sobic002G160200 Sobic005G027250--Sobic001G160900 Sobic005G027250--Sobic002G083100 Sobic005G027250--Sobic010G032200 Sobic005G125200 Sobic005G125200 Sobic005G027250--Sobic005G125200 Sobic004G338900--Sobic002G160200 Sobic004G338900--Sobic007G204800 Sobic004G338900--Sobic001G160900 Sobic004G338900--Sobic006G099200 Sobic004G338900--Sobic002G083100 Sobic002G102600 Sobic002G102600 Sobic004G338900--Sobic002G102600 Sobic004G338900--Sobic005G027250 Sobic005G001200 Sobic005G001200 Sobic004G338900--Sobic005G001200 Sobic003G287800 Sobic003G287800 Sobic004G338900--Sobic003G287800 Sobic005G072850--Sobic010G015100 Sobic002G031301 Sobic002G031301 Sobic005G072850--Sobic002G031301 Sobic005G072850--Sobic007G119101 Sobic009G111700 Sobic009G111700 Sobic005G072850--Sobic009G111700 Sobic010G201100 Sobic010G201100 Sobic005G072850--Sobic010G201100 Sobic004G240700 Sobic004G240700 Sobic005G072850--Sobic004G240700 Sobic002G125500 Sobic002G125500 Sobic005G072850--Sobic002G125500 Sobic003G226950 Sobic003G226950 Sobic005G072850--Sobic003G226950 Sobic006G130900 Sobic006G130900 Sobic005G072850--Sobic006G130900 Sobic010G015100--Sobic005G072850 Sobic010G015100--Sobic002G031301 Sobic010G015100--Sobic004G240700 Sobic010G015100--Sobic009G111700 Sobic010G015100--Sobic007G119101 Sobic010G015100--Sobic006G130900 Sobic010G015100--Sobic010G201100 Sobic010G015100--Sobic002G125500 Sobic003G315600 Sobic003G315600 Sobic010G015100--Sobic003G315600 Sobic007G204800--Sobic002G160200 Sobic007G204800--Sobic004G338900 Sobic007G204800--Sobic006G099200 Sobic007G204800--Sobic001G160900 Sobic007G204800--Sobic001G120800 Sobic007G204800--Sobic002G102600 Sobic010G257900 Sobic010G257900 Sobic007G204800--Sobic010G257900 Sobic007G204800--Sobic005G027250 Sobic007G204800--Sobic002G083100 Sobic007G119101--Sobic002G031301 Sobic007G119101--Sobic010G201100 Sobic007G119101--Sobic009G111700 Sobic007G119101--Sobic005G072850 Sobic007G119101--Sobic010G015100 Sobic007G119101--Sobic002G125500 Sobic007G119101--Sobic003G226950 Sobic007G025350 Sobic007G025350 Sobic007G119101--Sobic007G025350 Sobic002G005500 Sobic002G005500 Sobic007G119101--Sobic002G005500 Sobic010G142600 Sobic010G142600 Sobic008G012500--Sobic010G142600 Sobic008G023801 Sobic008G023801 Sobic008G012500--Sobic008G023801 Sobic008G012500--Sobic006G130900 Sobic003G444700 Sobic003G444700 Sobic008G012500--Sobic003G444700 Sobic008G012500--Sobic001G120800 Sobic008G012500--Sobic004G240700 Sobic008G012500--Sobic010G257900 Sobic010G056900 Sobic010G056900 Sobic008G012500--Sobic010G056900 Sobic008G012500--Sobic005G072850
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.