Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G115900.1,Sobic.002G115900.2
Synonym Sb02g009860, HD-GL2-1, HDG1
Functional annotation homeobox and START domains containing protein, putative, expressed
UniProt A0A1W0W3G6 , C5X4D5
Pfam PF00046 PF01852
Panther DB PTHR24326 PTHR24326:SF288
NCBI CDD KOG0484; Transcription factor PHOX2/ARIX, contains HOX domain
KEGG Orthology K09338; homeobox-leucine zipper protein
Gene Ontology GO:0003677; DNA binding GO:0008289lipid binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G61150 : homeodomain GLABROUS 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g35760.1 : homeobox and START domains containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a045723
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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18 Sobic.010G258900 - -
19 Sobic.005G124400 - -
20 Sobic.007G036400 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic002G115900 Sobic002G115900 Sobic004G008700 Sobic004G008700 Sobic002G115900--Sobic004G008700 Sobic010G029800 Sobic010G029800 Sobic002G115900--Sobic010G029800 Sobic003G099800 Sobic003G099800 Sobic002G115900--Sobic003G099800 Sobic005G042400 Sobic005G042400 Sobic002G115900--Sobic005G042400 Sobic008G069000 Sobic008G069000 Sobic002G115900--Sobic008G069000 Sobic005G052200 Sobic005G052200 Sobic002G115900--Sobic005G052200 Sobic007G040900 Sobic007G040900 Sobic002G115900--Sobic007G040900 Sobic002G098100 Sobic002G098100 Sobic002G115900--Sobic002G098100 Sobic004G114700 Sobic004G114700 Sobic002G115900--Sobic004G114700 Sobic004G008700--Sobic003G099800 Sobic004G008700--Sobic010G029800 Sobic004G008700--Sobic005G042400 Sobic004G008700--Sobic007G040900 Sobic004G008700--Sobic005G052200 Sobic004G008700--Sobic002G098100 Sobic004G008700--Sobic004G114700 Sobic009G020000 Sobic009G020000 Sobic004G008700--Sobic009G020000 Sobic004G008700--Sobic008G069000 Sobic010G029800--Sobic004G008700 Sobic010G029800--Sobic005G042400 Sobic010G029800--Sobic008G069000 Sobic010G029800--Sobic003G099800 Sobic010G029800--Sobic005G052200 Sobic010G137600 Sobic010G137600 Sobic010G029800--Sobic010G137600 Sobic008G181200 Sobic008G181200 Sobic010G029800--Sobic008G181200 Sobic010G029800--Sobic007G040900 Sobic010G029800--Sobic004G114700 Sobic003G099800--Sobic004G008700 Sobic003G099800--Sobic002G098100 Sobic003G099800--Sobic009G020000 Sobic003G099800--Sobic007G040900 Sobic003G099800--Sobic004G114700 Sobic003G099800--Sobic005G052200 Sobic004G316300 Sobic004G316300 Sobic003G099800--Sobic004G316300 Sobic010G258900 Sobic010G258900 Sobic003G099800--Sobic010G258900 Sobic005G150000 Sobic005G150000 Sobic003G099800--Sobic005G150000 Sobic005G042400--Sobic010G029800 Sobic003G103100 Sobic003G103100 Sobic005G042400--Sobic003G103100 Sobic005G042400--Sobic004G008700 Sobic005G042400--Sobic005G052200 Sobic005G124400 Sobic005G124400 Sobic005G042400--Sobic005G124400 Sobic009G062300 Sobic009G062300 Sobic005G042400--Sobic009G062300 Sobic005G042400--Sobic010G137600 Sobic005G042400--Sobic004G114700 Sobic005G226800 Sobic005G226800 Sobic005G042400--Sobic005G226800 Sobic008G069000--Sobic010G029800 Sobic004G048300 Sobic004G048300 Sobic008G069000--Sobic004G048300 Sobic006G139400 Sobic006G139400 Sobic008G069000--Sobic006G139400 Sobic003G238900 Sobic003G238900 Sobic008G069000--Sobic003G238900 Sobic008G069000--Sobic004G008700 Sobic002G238900 Sobic002G238900 Sobic008G069000--Sobic002G238900 Sobic005G177200 Sobic005G177200 Sobic008G069000--Sobic005G177200 Sobic008G069000--Sobic007G040900 Sobic008G069000--Sobic008G181200 Sobic005G052200--Sobic004G114700 Sobic005G052200--Sobic004G316300 Sobic005G052200--Sobic003G103100 Sobic005G052200--Sobic009G020000 Sobic005G052200--Sobic005G042400 Sobic005G052200--Sobic002G098100 Sobic005G052200--Sobic005G150000 Sobic005G052200--Sobic004G008700 Sobic005G052200--Sobic003G099800 Sobic003G179300 Sobic003G179300 Sobic007G040900--Sobic003G179300 Sobic007G040900--Sobic010G258900 Sobic008G182100 Sobic008G182100 Sobic007G040900--Sobic008G182100 Sobic007G040900--Sobic004G048300 Sobic008G070100 Sobic008G070100 Sobic007G040900--Sobic008G070100 Sobic003G330800 Sobic003G330800 Sobic007G040900--Sobic003G330800 Sobic004G316200 Sobic004G316200 Sobic007G040900--Sobic004G316200 Sobic003G010000 Sobic003G010000 Sobic007G040900--Sobic003G010000 Sobic007G040900--Sobic003G099800 Sobic002G098100--Sobic004G114700 Sobic002G098100--Sobic003G099800 Sobic002G098100--Sobic004G316300 Sobic002G098100--Sobic009G020000 Sobic002G098100--Sobic005G052200 Sobic002G098100--Sobic005G150000 Sobic002G098100--Sobic004G008700 Sobic005G148201 Sobic005G148201 Sobic002G098100--Sobic005G148201 Sobic008G068900 Sobic008G068900 Sobic002G098100--Sobic008G068900 Sobic004G114700--Sobic009G020000 Sobic004G114700--Sobic005G052200 Sobic004G114700--Sobic004G316300 Sobic004G114700--Sobic005G150000 Sobic004G114700--Sobic002G098100 Sobic004G114700--Sobic003G099800 Sobic004G114700--Sobic003G103100 Sobic004G114700--Sobic005G148201 Sobic004G114700--Sobic004G008700
Octagon: transcription factors


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