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Transcriptome id Sobic.002G127700.1
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Functional annotation -
UniProt C5X575
Pfam -
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NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G074900 LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
2 Sobic.009G086800 no apical meristem protein, putative, expressed -
3 Sobic.006G036201 - -
4 Sobic.004G196200 cytochrome P450, putative, expressed K12639: CYP724B1, cytochrome P450 family 724 subfamily B polypeptide 1
5 Sobic.005G090500 - -
6 Sobic.005G148600 - -
7 Sobic.005G074800 LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
8 Sobic.008G001700 Homologous to Dof genes in Arabidopsis and rice.(PubMedID : 21161392)@Phylogenetic analysis of cloned SbDof genes along with other reported Dof proteins. The 3D structural prediction of SbDof proteins based on multiple threading method.(PubMedID : 22476870)@"PBF1(Ortholog in maize:Lang et al., 2014)"(PubMedID : 31659911)@Upregulated in response to drought and salt stress(PubMedID : 27230576)@dof zinc finger domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.003G350900 homeobox domain containing protein, expressed -
10 Sobic.004G116200 expressed protein -
11 Sobic.009G061800 BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 1 precursor, putative, expressed -
12 Sobic.005G188000 no apical meristem protein, putative, expressed -
13 Sobic.007G147300 Not investigated(PubMedID : 23766026)@AP2 domain containing protein, expressed K09286: EREBP-like factor
14 Sobic.002G088000 cytokinin-N-glucosyltransferase 1, putative, expressed -
15 Sobic.004G171500 basic helix-loop-helix, putative, expressed -
16 Sobic.001G362900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@cytochrome P450 71D7, putative, expressed -
17 Sobic.009G051301 - -
18 Sobic.002G417900 nucleotidyltransferase, putative, expressed -
19 Sobic.004G085100 mitochondrial carrier protein, putative, expressed -
20 Sobic.008G064000 LTPL36 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G127700 Sobic002G127700 Sobic005G074900 Sobic005G074900 Sobic002G127700--Sobic005G074900 Sobic009G086800 Sobic009G086800 Sobic002G127700--Sobic009G086800 Sobic006G036201 Sobic006G036201 Sobic002G127700--Sobic006G036201 Sobic004G196200 Sobic004G196200 Sobic002G127700--Sobic004G196200 Sobic005G090500 Sobic005G090500 Sobic002G127700--Sobic005G090500 Sobic005G148600 Sobic005G148600 Sobic002G127700--Sobic005G148600 Sobic005G074800 Sobic005G074800 Sobic002G127700--Sobic005G074800 Sobic008G001700 Sobic008G001700 Sobic002G127700--Sobic008G001700 Sobic003G350900 Sobic003G350900 Sobic002G127700--Sobic003G350900 Sobic005G074900--Sobic006G036201 Sobic009G051301 Sobic009G051301 Sobic005G074900--Sobic009G051301 Sobic005G074900--Sobic005G148600 Sobic005G074900--Sobic004G196200 Sobic005G074900--Sobic005G090500 Sobic006G271400 Sobic006G271400 Sobic005G074900--Sobic006G271400 Sobic005G074900--Sobic005G074800 Sobic005G074900--Sobic009G086800 Sobic006G279000 Sobic006G279000 Sobic005G074900--Sobic006G279000 Sobic007G147300 Sobic007G147300 Sobic009G086800--Sobic007G147300 Sobic004G116200 Sobic004G116200 Sobic009G086800--Sobic004G116200 Sobic009G086800--Sobic008G001700 Sobic009G061800 Sobic009G061800 Sobic009G086800--Sobic009G061800 Sobic002G291132 Sobic002G291132 Sobic009G086800--Sobic002G291132 Sobic002G088000 Sobic002G088000 Sobic009G086800--Sobic002G088000 Sobic005G188000 Sobic005G188000 Sobic009G086800--Sobic005G188000 Sobic009G086800--Sobic003G350900 Sobic004G171500 Sobic004G171500 Sobic009G086800--Sobic004G171500 Sobic006G036201--Sobic005G074900 Sobic006G036201--Sobic009G051301 Sobic006G036201--Sobic002G291132 Sobic006G036201--Sobic009G086800 Sobic001G530400 Sobic001G530400 Sobic006G036201--Sobic001G530400 Sobic006G036201--Sobic004G196200 Sobic006G036201--Sobic009G061800 Sobic006G036201--Sobic005G148600 Sobic006G036201--Sobic006G279000 Sobic004G196200--Sobic005G148600 Sobic004G196200--Sobic005G074800 Sobic007G082900 Sobic007G082900 Sobic004G196200--Sobic007G082900 Sobic010G219300 Sobic010G219300 Sobic004G196200--Sobic010G219300 Sobic009G039900 Sobic009G039900 Sobic004G196200--Sobic009G039900 Sobic004G196200--Sobic005G090500 Sobic005G153400 Sobic005G153400 Sobic004G196200--Sobic005G153400 Sobic010G034900 Sobic010G034900 Sobic004G196200--Sobic010G034900 Sobic004G196200--Sobic005G074900 Sobic005G090500--Sobic005G074800 Sobic005G090500--Sobic005G148600 Sobic002G053100 Sobic002G053100 Sobic005G090500--Sobic002G053100 Sobic005G090500--Sobic004G196200 Sobic005G090500--Sobic006G271400 Sobic005G090500--Sobic004G171500 Sobic006G064700 Sobic006G064700 Sobic005G090500--Sobic006G064700 Sobic005G090500--Sobic008G001700 Sobic005G090500--Sobic005G074900 Sobic005G148600--Sobic004G196200 Sobic005G148600--Sobic005G074800 Sobic005G148600--Sobic005G090500 Sobic005G148600--Sobic009G039900 Sobic005G148600--Sobic006G064700 Sobic005G148600--Sobic005G153400 Sobic009G039100 Sobic009G039100 Sobic005G148600--Sobic009G039100 Sobic005G148600--Sobic007G082900 Sobic005G148600--Sobic005G074900 Sobic005G074800--Sobic005G148600 Sobic005G074800--Sobic004G196200 Sobic005G074800--Sobic005G090500 Sobic005G074800--Sobic010G034900 Sobic002G345400 Sobic002G345400 Sobic005G074800--Sobic002G345400 Sobic005G102451 Sobic005G102451 Sobic005G074800--Sobic005G102451 Sobic005G074800--Sobic010G219300 Sobic005G056100 Sobic005G056100 Sobic005G074800--Sobic005G056100 Sobic008G064000 Sobic008G064000 Sobic005G074800--Sobic008G064000 Sobic008G001700--Sobic004G171500 Sobic008G071900 Sobic008G071900 Sobic008G001700--Sobic008G071900 Sobic001G362900 Sobic001G362900 Sobic008G001700--Sobic001G362900 Sobic008G001700--Sobic004G116200 Sobic009G021300 Sobic009G021300 Sobic008G001700--Sobic009G021300 Sobic004G085100 Sobic004G085100 Sobic008G001700--Sobic004G085100 Sobic010G102900 Sobic010G102900 Sobic008G001700--Sobic010G102900 Sobic008G001700--Sobic007G147300 Sobic008G001700--Sobic002G088000 Sobic003G350900--Sobic005G188000 Sobic003G350900--Sobic008G064000 Sobic003G350900--Sobic009G061800 Sobic001G259300 Sobic001G259300 Sobic003G350900--Sobic001G259300 Sobic003G350900--Sobic002G088000 Sobic003G156100 Sobic003G156100 Sobic003G350900--Sobic003G156100 Sobic003G323000 Sobic003G323000 Sobic003G350900--Sobic003G323000 Sobic003G105600 Sobic003G105600 Sobic003G350900--Sobic003G105600 Sobic003G350900--Sobic010G034900
Octagon: transcription factors


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