Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G202200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QCI1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G066800 - -
2 Sobic.009G242032 - -
3 Sobic.007G124800 MLA1, putative, expressed -
4 Sobic.001G316500 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed -
5 Sobic.001G027400 - -
6 Sobic.002G367850 - -
7 Sobic.008G007100 lectin-like receptor kinase 7, putative, expressed -
8 Sobic.001G174300 GRAS family transcription factor containing protein, expressed -
9 Sobic.002G187350 - -
10 Sobic.001G391000 aspartic proteinase nepenthesin precursor, putative, expressed -
11 Sobic.004G295400 amino acid kinase, putative, expressed K00930: acetylglutamate kinase
12 Sobic.001G040701 - -
13 Sobic.005G230700 SCARECROW, putative, expressed -
14 Sobic.001G213200 ZOS10-05 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
15 Sobic.004G221150 - -
16 Sobic.008G007200 lectin-like receptor kinase, putative, expressed -
17 Sobic.009G027550 - -
18 Sobic.008G108000 expressed protein -
19 Sobic.010G036601 - -
20 Sobic.003G304900 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G202200 Sobic002G202200 Sobic005G066800 Sobic005G066800 Sobic002G202200--Sobic005G066800 Sobic009G242032 Sobic009G242032 Sobic002G202200--Sobic009G242032 Sobic007G124800 Sobic007G124800 Sobic002G202200--Sobic007G124800 Sobic001G316500 Sobic001G316500 Sobic002G202200--Sobic001G316500 Sobic001G027400 Sobic001G027400 Sobic002G202200--Sobic001G027400 Sobic002G367850 Sobic002G367850 Sobic002G202200--Sobic002G367850 Sobic008G007100 Sobic008G007100 Sobic002G202200--Sobic008G007100 Sobic001G174300 Sobic001G174300 Sobic002G202200--Sobic001G174300 Sobic002G187350 Sobic002G187350 Sobic002G202200--Sobic002G187350 Sobic005G066800--Sobic002G367850 Sobic001G391000 Sobic001G391000 Sobic005G066800--Sobic001G391000 Sobic004G355401 Sobic004G355401 Sobic005G066800--Sobic004G355401 Sobic003G265300 Sobic003G265300 Sobic005G066800--Sobic003G265300 Sobic005G066800--Sobic002G202200 Sobic007G206550 Sobic007G206550 Sobic005G066800--Sobic007G206550 Sobic004G295400 Sobic004G295400 Sobic005G066800--Sobic004G295400 Sobic001G457100 Sobic001G457100 Sobic005G066800--Sobic001G457100 Sobic004G206900 Sobic004G206900 Sobic005G066800--Sobic004G206900 Sobic009G053201 Sobic009G053201 Sobic009G242032--Sobic009G053201 Sobic009G242032--Sobic001G027400 Sobic009G242032--Sobic002G202200 Sobic003G119266 Sobic003G119266 Sobic009G242032--Sobic003G119266 Sobic007G157200 Sobic007G157200 Sobic009G242032--Sobic007G157200 Sobic002G234900 Sobic002G234900 Sobic009G242032--Sobic002G234900 Sobic010G097800 Sobic010G097800 Sobic009G242032--Sobic010G097800 Sobic003G279600 Sobic003G279600 Sobic009G242032--Sobic003G279600 Sobic002G284701 Sobic002G284701 Sobic009G242032--Sobic002G284701 Sobic007G124800--Sobic001G174300 Sobic007G124800--Sobic001G316500 Sobic008G108000 Sobic008G108000 Sobic007G124800--Sobic008G108000 Sobic010G217001 Sobic010G217001 Sobic007G124800--Sobic010G217001 Sobic004G045700 Sobic004G045700 Sobic007G124800--Sobic004G045700 Sobic008G086300 Sobic008G086300 Sobic007G124800--Sobic008G086300 Sobic007G124800--Sobic001G027400 Sobic008G007200 Sobic008G007200 Sobic007G124800--Sobic008G007200 Sobic007G124800--Sobic002G202200 Sobic001G316500--Sobic007G124800 Sobic003G304900 Sobic003G304900 Sobic001G316500--Sobic003G304900 Sobic001G316500--Sobic010G217001 Sobic004G306700 Sobic004G306700 Sobic001G316500--Sobic004G306700 Sobic001G316500--Sobic001G174300 Sobic001G316500--Sobic008G007200 Sobic010G059900 Sobic010G059900 Sobic001G316500--Sobic010G059900 Sobic001G316500--Sobic002G202200 Sobic001G316500--Sobic001G027400 Sobic001G027400--Sobic010G097800 Sobic001G027400--Sobic003G304900 Sobic001G027400--Sobic008G007100 Sobic001G027400--Sobic001G174300 Sobic001G027400--Sobic009G242032 Sobic001G027400--Sobic007G157200 Sobic005G230700 Sobic005G230700 Sobic001G027400--Sobic005G230700 Sobic001G027400--Sobic007G124800 Sobic003G005332 Sobic003G005332 Sobic001G027400--Sobic003G005332 Sobic002G367850--Sobic005G066800 Sobic002G367850--Sobic003G265300 Sobic002G367850--Sobic007G206550 Sobic002G367850--Sobic004G355401 Sobic002G367850--Sobic001G391000 Sobic002G367850--Sobic001G457100 Sobic002G367850--Sobic004G295400 Sobic007G157550 Sobic007G157550 Sobic002G367850--Sobic007G157550 Sobic002G367850--Sobic004G206900 Sobic008G007100--Sobic008G007200 Sobic006G111400 Sobic006G111400 Sobic008G007100--Sobic006G111400 Sobic008G007100--Sobic003G005332 Sobic008G007100--Sobic001G027400 Sobic008G007100--Sobic003G304900 Sobic009G199900 Sobic009G199900 Sobic008G007100--Sobic009G199900 Sobic003G259000 Sobic003G259000 Sobic008G007100--Sobic003G259000 Sobic003G251900 Sobic003G251900 Sobic008G007100--Sobic003G251900 Sobic006G169600 Sobic006G169600 Sobic008G007100--Sobic006G169600 Sobic001G174300--Sobic007G124800 Sobic001G174300--Sobic001G027400 Sobic001G174300--Sobic010G217001 Sobic001G174300--Sobic001G316500 Sobic002G138200 Sobic002G138200 Sobic001G174300--Sobic002G138200 Sobic001G174300--Sobic005G066800 Sobic001G174300--Sobic007G157200 Sobic001G174300--Sobic010G059900 Sobic001G174300--Sobic003G304900 Sobic002G187350--Sobic002G202200 Sobic002G187350--Sobic003G259000 Sobic002G187350--Sobic003G005332 Sobic010G113800 Sobic010G113800 Sobic002G187350--Sobic010G113800 Sobic002G187350--Sobic001G391000 Sobic002G187350--Sobic008G007100 Sobic008G134000 Sobic008G134000 Sobic002G187350--Sobic008G134000 Sobic002G187350--Sobic009G242032 Sobic002G187350--Sobic005G066800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.