Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G108000.1
Synonym Sb08g016280
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YP23
Pfam PF03242
Panther DB PTHR35109 PTHR35109:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006950; response to stress


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G19550 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g32290.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a040665 , Zm00025a025580
Brachypodium KQJ86610
Barley HORVU0Hr1G011840.1 , HORVU0Hr1G011840.2
Wheat TraesCS5D02G115700 , TraesCS5B02G108100
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G124800 MLA1, putative, expressed -
2 Sobic.001G040701 - -
3 Sobic.001G316500 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed -
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5 Sobic.005G066800 - -
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9 Sobic.003G304900 - -
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14 Sobic.008G086300 - -
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16 Sobic.008G007200 lectin-like receptor kinase, putative, expressed -
17 Sobic.001G027400 - -
18 Sobic.009G027550 - -
19 Sobic.010G059900 flavonol synthase/flavanone 3-hydroxylase, putative, expressed -
20 Sobic.004G007032 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G108000 Sobic008G108000 Sobic007G124800 Sobic007G124800 Sobic008G108000--Sobic007G124800 Sobic001G040701 Sobic001G040701 Sobic008G108000--Sobic001G040701 Sobic001G316500 Sobic001G316500 Sobic008G108000--Sobic001G316500 Sobic001G174300 Sobic001G174300 Sobic008G108000--Sobic001G174300 Sobic005G066800 Sobic005G066800 Sobic008G108000--Sobic005G066800 Sobic001G037550 Sobic001G037550 Sobic008G108000--Sobic001G037550 Sobic003G253900 Sobic003G253900 Sobic008G108000--Sobic003G253900 Sobic002G316301 Sobic002G316301 Sobic008G108000--Sobic002G316301 Sobic003G304900 Sobic003G304900 Sobic008G108000--Sobic003G304900 Sobic007G124800--Sobic001G174300 Sobic007G124800--Sobic001G316500 Sobic007G124800--Sobic008G108000 Sobic010G217001 Sobic010G217001 Sobic007G124800--Sobic010G217001 Sobic004G045700 Sobic004G045700 Sobic007G124800--Sobic004G045700 Sobic008G086300 Sobic008G086300 Sobic007G124800--Sobic008G086300 Sobic001G027400 Sobic001G027400 Sobic007G124800--Sobic001G027400 Sobic008G007200 Sobic008G007200 Sobic007G124800--Sobic008G007200 Sobic002G202200 Sobic002G202200 Sobic007G124800--Sobic002G202200 Sobic001G040701--Sobic008G108000 Sobic001G040701--Sobic007G124800 Sobic001G040701--Sobic005G066800 Sobic001G040701--Sobic001G174300 Sobic001G040701--Sobic002G316301 Sobic002G367850 Sobic002G367850 Sobic001G040701--Sobic002G367850 Sobic001G040701--Sobic002G202200 Sobic001G040701--Sobic001G316500 Sobic001G040701--Sobic001G037550 Sobic001G316500--Sobic007G124800 Sobic001G316500--Sobic003G304900 Sobic001G316500--Sobic010G217001 Sobic004G306700 Sobic004G306700 Sobic001G316500--Sobic004G306700 Sobic001G316500--Sobic001G174300 Sobic001G316500--Sobic008G007200 Sobic010G059900 Sobic010G059900 Sobic001G316500--Sobic010G059900 Sobic001G316500--Sobic002G202200 Sobic001G316500--Sobic001G027400 Sobic001G174300--Sobic007G124800 Sobic001G174300--Sobic001G027400 Sobic001G174300--Sobic010G217001 Sobic001G174300--Sobic001G316500 Sobic002G138200 Sobic002G138200 Sobic001G174300--Sobic002G138200 Sobic001G174300--Sobic005G066800 Sobic007G157200 Sobic007G157200 Sobic001G174300--Sobic007G157200 Sobic001G174300--Sobic010G059900 Sobic001G174300--Sobic003G304900 Sobic005G066800--Sobic002G367850 Sobic001G391000 Sobic001G391000 Sobic005G066800--Sobic001G391000 Sobic004G355401 Sobic004G355401 Sobic005G066800--Sobic004G355401 Sobic003G265300 Sobic003G265300 Sobic005G066800--Sobic003G265300 Sobic005G066800--Sobic002G202200 Sobic007G206550 Sobic007G206550 Sobic005G066800--Sobic007G206550 Sobic004G295400 Sobic004G295400 Sobic005G066800--Sobic004G295400 Sobic001G457100 Sobic001G457100 Sobic005G066800--Sobic001G457100 Sobic004G206900 Sobic004G206900 Sobic005G066800--Sobic004G206900 Sobic010G275600 Sobic010G275600 Sobic001G037550--Sobic010G275600 Sobic001G037550--Sobic008G108000 Sobic010G263101 Sobic010G263101 Sobic001G037550--Sobic010G263101 Sobic001G037550--Sobic001G040701 Sobic008G083650 Sobic008G083650 Sobic001G037550--Sobic008G083650 Sobic001G075900 Sobic001G075900 Sobic001G037550--Sobic001G075900 Sobic001G037550--Sobic007G124800 Sobic001G037550--Sobic008G086300 Sobic001G037550--Sobic002G367850 Sobic002G331050 Sobic002G331050 Sobic003G253900--Sobic002G331050 Sobic003G386400 Sobic003G386400 Sobic003G253900--Sobic003G386400 Sobic003G253900--Sobic001G316500 Sobic009G192450 Sobic009G192450 Sobic003G253900--Sobic009G192450 Sobic003G439200 Sobic003G439200 Sobic003G253900--Sobic003G439200 Sobic002G025100 Sobic002G025100 Sobic003G253900--Sobic002G025100 Sobic010G088100 Sobic010G088100 Sobic003G253900--Sobic010G088100 Sobic003G253900--Sobic008G108000 Sobic004G007032 Sobic004G007032 Sobic003G253900--Sobic004G007032 Sobic002G316301--Sobic002G367850 Sobic001G006900 Sobic001G006900 Sobic002G316301--Sobic001G006900 Sobic002G316301--Sobic004G007032 Sobic002G316301--Sobic001G040701 Sobic002G316301--Sobic002G331050 Sobic002G316301--Sobic005G066800 Sobic002G316301--Sobic004G295400 Sobic002G316301--Sobic007G124800 Sobic002G316301--Sobic008G108000 Sobic003G304900--Sobic001G027400 Sobic003G304900--Sobic008G007200 Sobic003G304900--Sobic001G316500 Sobic008G007100 Sobic008G007100 Sobic003G304900--Sobic008G007100 Sobic009G252600 Sobic009G252600 Sobic003G304900--Sobic009G252600 Sobic010G097800 Sobic010G097800 Sobic003G304900--Sobic010G097800 Sobic003G304900--Sobic002G138200 Sobic003G371900 Sobic003G371900 Sobic003G304900--Sobic003G371900 Sobic001G060200 Sobic001G060200 Sobic003G304900--Sobic001G060200
Octagon: transcription factors


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