Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G040701.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S4B3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g38289.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley HORVU7Hr1G110320.1 , HORVU7Hr1G110180.1 , HORVU7Hr1G110280.1 , HORVU6Hr1G006100.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G108000 expressed protein -
2 Sobic.007G124800 MLA1, putative, expressed -
3 Sobic.005G066800 - -
4 Sobic.001G174300 GRAS family transcription factor containing protein, expressed -
5 Sobic.002G316301 - -
6 Sobic.002G367850 - -
7 Sobic.002G202200 - -
8 Sobic.001G316500 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed -
9 Sobic.001G037550 - -
10 Sobic.002G331050 - -
11 Sobic.004G007032 - -
12 Sobic.001G391000 aspartic proteinase nepenthesin precursor, putative, expressed -
13 Sobic.004G295400 amino acid kinase, putative, expressed K00930: acetylglutamate kinase
14 Sobic.008G086300 - -
15 Sobic.003G253900 - -
16 Sobic.003G265300 lectin-like receptor kinase, putative, expressed -
17 Sobic.010G059900 flavonol synthase/flavanone 3-hydroxylase, putative, expressed -
18 Sobic.009G151500 cinnamoyl-CoA reductase-related, putative, expressed -
19 Sobic.001G075900 bZIP transcription factor domain containing protein, expressed -
20 Sobic.010G078800 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G040701 Sobic001G040701 Sobic008G108000 Sobic008G108000 Sobic001G040701--Sobic008G108000 Sobic007G124800 Sobic007G124800 Sobic001G040701--Sobic007G124800 Sobic005G066800 Sobic005G066800 Sobic001G040701--Sobic005G066800 Sobic001G174300 Sobic001G174300 Sobic001G040701--Sobic001G174300 Sobic002G316301 Sobic002G316301 Sobic001G040701--Sobic002G316301 Sobic002G367850 Sobic002G367850 Sobic001G040701--Sobic002G367850 Sobic002G202200 Sobic002G202200 Sobic001G040701--Sobic002G202200 Sobic001G316500 Sobic001G316500 Sobic001G040701--Sobic001G316500 Sobic001G037550 Sobic001G037550 Sobic001G040701--Sobic001G037550 Sobic008G108000--Sobic007G124800 Sobic008G108000--Sobic001G040701 Sobic008G108000--Sobic001G316500 Sobic008G108000--Sobic001G174300 Sobic008G108000--Sobic005G066800 Sobic008G108000--Sobic001G037550 Sobic003G253900 Sobic003G253900 Sobic008G108000--Sobic003G253900 Sobic008G108000--Sobic002G316301 Sobic003G304900 Sobic003G304900 Sobic008G108000--Sobic003G304900 Sobic007G124800--Sobic001G174300 Sobic007G124800--Sobic001G316500 Sobic007G124800--Sobic008G108000 Sobic010G217001 Sobic010G217001 Sobic007G124800--Sobic010G217001 Sobic004G045700 Sobic004G045700 Sobic007G124800--Sobic004G045700 Sobic008G086300 Sobic008G086300 Sobic007G124800--Sobic008G086300 Sobic001G027400 Sobic001G027400 Sobic007G124800--Sobic001G027400 Sobic008G007200 Sobic008G007200 Sobic007G124800--Sobic008G007200 Sobic007G124800--Sobic002G202200 Sobic005G066800--Sobic002G367850 Sobic001G391000 Sobic001G391000 Sobic005G066800--Sobic001G391000 Sobic004G355401 Sobic004G355401 Sobic005G066800--Sobic004G355401 Sobic003G265300 Sobic003G265300 Sobic005G066800--Sobic003G265300 Sobic005G066800--Sobic002G202200 Sobic007G206550 Sobic007G206550 Sobic005G066800--Sobic007G206550 Sobic004G295400 Sobic004G295400 Sobic005G066800--Sobic004G295400 Sobic001G457100 Sobic001G457100 Sobic005G066800--Sobic001G457100 Sobic004G206900 Sobic004G206900 Sobic005G066800--Sobic004G206900 Sobic001G174300--Sobic007G124800 Sobic001G174300--Sobic001G027400 Sobic001G174300--Sobic010G217001 Sobic001G174300--Sobic001G316500 Sobic002G138200 Sobic002G138200 Sobic001G174300--Sobic002G138200 Sobic001G174300--Sobic005G066800 Sobic007G157200 Sobic007G157200 Sobic001G174300--Sobic007G157200 Sobic010G059900 Sobic010G059900 Sobic001G174300--Sobic010G059900 Sobic001G174300--Sobic003G304900 Sobic002G316301--Sobic002G367850 Sobic001G006900 Sobic001G006900 Sobic002G316301--Sobic001G006900 Sobic004G007032 Sobic004G007032 Sobic002G316301--Sobic004G007032 Sobic002G316301--Sobic001G040701 Sobic002G331050 Sobic002G331050 Sobic002G316301--Sobic002G331050 Sobic002G316301--Sobic005G066800 Sobic002G316301--Sobic004G295400 Sobic002G316301--Sobic007G124800 Sobic002G316301--Sobic008G108000 Sobic002G367850--Sobic005G066800 Sobic002G367850--Sobic003G265300 Sobic002G367850--Sobic007G206550 Sobic002G367850--Sobic004G355401 Sobic002G367850--Sobic001G391000 Sobic002G367850--Sobic001G457100 Sobic002G367850--Sobic004G295400 Sobic007G157550 Sobic007G157550 Sobic002G367850--Sobic007G157550 Sobic002G367850--Sobic004G206900 Sobic002G202200--Sobic005G066800 Sobic009G242032 Sobic009G242032 Sobic002G202200--Sobic009G242032 Sobic002G202200--Sobic007G124800 Sobic002G202200--Sobic001G316500 Sobic002G202200--Sobic001G027400 Sobic002G202200--Sobic002G367850 Sobic008G007100 Sobic008G007100 Sobic002G202200--Sobic008G007100 Sobic002G202200--Sobic001G174300 Sobic002G187350 Sobic002G187350 Sobic002G202200--Sobic002G187350 Sobic001G316500--Sobic007G124800 Sobic001G316500--Sobic003G304900 Sobic001G316500--Sobic010G217001 Sobic004G306700 Sobic004G306700 Sobic001G316500--Sobic004G306700 Sobic001G316500--Sobic001G174300 Sobic001G316500--Sobic008G007200 Sobic001G316500--Sobic010G059900 Sobic001G316500--Sobic002G202200 Sobic001G316500--Sobic001G027400 Sobic010G275600 Sobic010G275600 Sobic001G037550--Sobic010G275600 Sobic001G037550--Sobic008G108000 Sobic010G263101 Sobic010G263101 Sobic001G037550--Sobic010G263101 Sobic001G037550--Sobic001G040701 Sobic008G083650 Sobic008G083650 Sobic001G037550--Sobic008G083650 Sobic001G075900 Sobic001G075900 Sobic001G037550--Sobic001G075900 Sobic001G037550--Sobic007G124800 Sobic001G037550--Sobic008G086300 Sobic001G037550--Sobic002G367850
Octagon: transcription factors


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