Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G037550.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt C5WV41
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G275600 resistance protein, putative, expressed -
2 Sobic.008G108000 expressed protein -
3 Sobic.010G263101 - -
4 Sobic.001G040701 - -
5 Sobic.008G083650 - -
6 Sobic.001G075900 bZIP transcription factor domain containing protein, expressed -
7 Sobic.007G124800 MLA1, putative, expressed -
8 Sobic.008G086300 - -
9 Sobic.002G367850 - -
10 Sobic.003G350000 pentatricopeptide, putative, expressed -
11 Sobic.003G439200 RNA polymerase IV largest subunit, putative, expressed K16251: DNA-directed RNA polymerase V subunit 1
12 Sobic.001G360300 NAC domain-containing protein 67, putative, expressed -
13 Sobic.003G445750 - -
14 Sobic.002G316301 - -
15 Sobic.005G066800 - -
16 Sobic.001G463650 - -
17 Sobic.009G192450 - -
18 Sobic.002G331050 - -
19 Sobic.007G096833 - -
20 Sobic.001G174300 GRAS family transcription factor containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G037550 Sobic001G037550 Sobic010G275600 Sobic010G275600 Sobic001G037550--Sobic010G275600 Sobic008G108000 Sobic008G108000 Sobic001G037550--Sobic008G108000 Sobic010G263101 Sobic010G263101 Sobic001G037550--Sobic010G263101 Sobic001G040701 Sobic001G040701 Sobic001G037550--Sobic001G040701 Sobic008G083650 Sobic008G083650 Sobic001G037550--Sobic008G083650 Sobic001G075900 Sobic001G075900 Sobic001G037550--Sobic001G075900 Sobic007G124800 Sobic007G124800 Sobic001G037550--Sobic007G124800 Sobic008G086300 Sobic008G086300 Sobic001G037550--Sobic008G086300 Sobic002G367850 Sobic002G367850 Sobic001G037550--Sobic002G367850 Sobic010G275600--Sobic001G037550 Sobic010G275600--Sobic010G263101 Sobic003G350000 Sobic003G350000 Sobic010G275600--Sobic003G350000 Sobic008G042400 Sobic008G042400 Sobic010G275600--Sobic008G042400 Sobic003G079700 Sobic003G079700 Sobic010G275600--Sobic003G079700 Sobic010G275600--Sobic001G075900 Sobic010G275600--Sobic008G083650 Sobic003G368450 Sobic003G368450 Sobic010G275600--Sobic003G368450 Sobic010G236800 Sobic010G236800 Sobic010G275600--Sobic010G236800 Sobic008G108000--Sobic007G124800 Sobic008G108000--Sobic001G040701 Sobic001G316500 Sobic001G316500 Sobic008G108000--Sobic001G316500 Sobic001G174300 Sobic001G174300 Sobic008G108000--Sobic001G174300 Sobic005G066800 Sobic005G066800 Sobic008G108000--Sobic005G066800 Sobic008G108000--Sobic001G037550 Sobic003G253900 Sobic003G253900 Sobic008G108000--Sobic003G253900 Sobic002G316301 Sobic002G316301 Sobic008G108000--Sobic002G316301 Sobic003G304900 Sobic003G304900 Sobic008G108000--Sobic003G304900 Sobic006G249800 Sobic006G249800 Sobic010G263101--Sobic006G249800 Sobic010G263101--Sobic003G350000 Sobic010G263101--Sobic010G275600 Sobic010G263101--Sobic008G083650 Sobic010G263101--Sobic001G037550 Sobic001G463650 Sobic001G463650 Sobic010G263101--Sobic001G463650 Sobic006G123100 Sobic006G123100 Sobic010G263101--Sobic006G123100 Sobic001G102901 Sobic001G102901 Sobic010G263101--Sobic001G102901 Sobic010G067950 Sobic010G067950 Sobic010G263101--Sobic010G067950 Sobic001G040701--Sobic008G108000 Sobic001G040701--Sobic007G124800 Sobic001G040701--Sobic005G066800 Sobic001G040701--Sobic001G174300 Sobic001G040701--Sobic002G316301 Sobic001G040701--Sobic002G367850 Sobic002G202200 Sobic002G202200 Sobic001G040701--Sobic002G202200 Sobic001G040701--Sobic001G316500 Sobic001G040701--Sobic001G037550 Sobic008G083650--Sobic006G123100 Sobic008G083650--Sobic001G463650 Sobic008G083650--Sobic003G350000 Sobic004G355401 Sobic004G355401 Sobic008G083650--Sobic004G355401 Sobic008G083650--Sobic002G367850 Sobic008G083650--Sobic010G067950 Sobic008G083650--Sobic010G263101 Sobic007G157550 Sobic007G157550 Sobic008G083650--Sobic007G157550 Sobic008G083650--Sobic005G066800 Sobic003G073620 Sobic003G073620 Sobic001G075900--Sobic003G073620 Sobic001G213200 Sobic001G213200 Sobic001G075900--Sobic001G213200 Sobic010G078800 Sobic010G078800 Sobic001G075900--Sobic010G078800 Sobic001G354900 Sobic001G354900 Sobic001G075900--Sobic001G354900 Sobic001G075900--Sobic001G037550 Sobic001G391000 Sobic001G391000 Sobic001G075900--Sobic001G391000 Sobic001G075900--Sobic002G367850 Sobic003G265300 Sobic003G265300 Sobic001G075900--Sobic003G265300 Sobic001G523500 Sobic001G523500 Sobic001G075900--Sobic001G523500 Sobic007G124800--Sobic001G174300 Sobic007G124800--Sobic001G316500 Sobic007G124800--Sobic008G108000 Sobic010G217001 Sobic010G217001 Sobic007G124800--Sobic010G217001 Sobic004G045700 Sobic004G045700 Sobic007G124800--Sobic004G045700 Sobic007G124800--Sobic008G086300 Sobic001G027400 Sobic001G027400 Sobic007G124800--Sobic001G027400 Sobic008G007200 Sobic008G007200 Sobic007G124800--Sobic008G007200 Sobic007G124800--Sobic002G202200 Sobic006G000200 Sobic006G000200 Sobic008G086300--Sobic006G000200 Sobic006G045301 Sobic006G045301 Sobic008G086300--Sobic006G045301 Sobic007G225050 Sobic007G225050 Sobic008G086300--Sobic007G225050 Sobic008G086300--Sobic007G124800 Sobic008G086300--Sobic010G217001 Sobic007G096833 Sobic007G096833 Sobic008G086300--Sobic007G096833 Sobic007G081400 Sobic007G081400 Sobic008G086300--Sobic007G081400 Sobic003G445750 Sobic003G445750 Sobic008G086300--Sobic003G445750 Sobic002G208900 Sobic002G208900 Sobic008G086300--Sobic002G208900 Sobic002G367850--Sobic005G066800 Sobic002G367850--Sobic003G265300 Sobic007G206550 Sobic007G206550 Sobic002G367850--Sobic007G206550 Sobic002G367850--Sobic004G355401 Sobic002G367850--Sobic001G391000 Sobic001G457100 Sobic001G457100 Sobic002G367850--Sobic001G457100 Sobic004G295400 Sobic004G295400 Sobic002G367850--Sobic004G295400 Sobic002G367850--Sobic007G157550 Sobic004G206900 Sobic004G206900 Sobic002G367850--Sobic004G206900
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.