Gene annotation
Transcriptome id
Sobic.008G083650.1
Synonym
-
Functional annotation
-
UniProt
A0A1Z5R6B1
Pfam
-
Panther DB
-
NCBI CDD
-
KEGG Orthology
-
Gene Ontology
-
Orthologs (automatic annotation)
TAIR
-
RAP-DB (Rice)
-
MaizeGDB (Corn)
-
Brachypodium
-
Barley
-
Wheat
-
Populus
-
JBrowse
Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot
Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles
Rank
Gene
Function
KEGG orthology
1
Sobic.006G123100
"domain confirmed by Pfam database, expressed in leaf, stem and root, expression induced by IAA and ABA treatments"(PubMedID : 20528920)@ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed
K05658 : ABCB1, ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 1
2
Sobic.001G463650
-
-
3
Sobic.003G350000
pentatricopeptide, putative, expressed
-
4
Sobic.004G355401
-
-
5
Sobic.002G367850
-
-
6
Sobic.010G067950
-
K14292 : trimethylguanosine synthase
7
Sobic.010G263101
-
-
8
Sobic.007G157550
-
-
9
Sobic.005G066800
-
-
10
Sobic.004G206900
expressed protein
-
11
Sobic.004G347866
-
-
12
Sobic.006G249800
MBTB2 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed
K10523 : speckle-type POZ protein
13
Sobic.007G206550
-
-
14
Sobic.001G391000
aspartic proteinase nepenthesin precursor, putative, expressed
-
15
Sobic.001G457100
-
-
16
Sobic.002G339250
-
-
17
Sobic.001G102901
-
-
18
Sobic.001G037550
-
-
19
Sobic.009G005800
formin-like protein 6 precursor, putative, expressed
-
20
Sobic.004G128800
FAD-binding and arabino-lactone oxidase domains containing protein, putative, expressed
-
Gene co-expression network
sample
Sobic008G083650
Sobic008G083650
Sobic006G123100
Sobic006G123100
Sobic008G083650--Sobic006G123100
Sobic001G463650
Sobic001G463650
Sobic008G083650--Sobic001G463650
Sobic003G350000
Sobic003G350000
Sobic008G083650--Sobic003G350000
Sobic004G355401
Sobic004G355401
Sobic008G083650--Sobic004G355401
Sobic002G367850
Sobic002G367850
Sobic008G083650--Sobic002G367850
Sobic010G067950
Sobic010G067950
Sobic008G083650--Sobic010G067950
Sobic010G263101
Sobic010G263101
Sobic008G083650--Sobic010G263101
Sobic007G157550
Sobic007G157550
Sobic008G083650--Sobic007G157550
Sobic005G066800
Sobic005G066800
Sobic008G083650--Sobic005G066800
Sobic006G123100--Sobic008G083650
Sobic006G123100--Sobic001G463650
Sobic006G249800
Sobic006G249800
Sobic006G123100--Sobic006G249800
Sobic006G123100--Sobic003G350000
Sobic006G123100--Sobic010G067950
Sobic006G123100--Sobic004G355401
Sobic004G206900
Sobic004G206900
Sobic006G123100--Sobic004G206900
Sobic004G128800
Sobic004G128800
Sobic006G123100--Sobic004G128800
Sobic002G339250
Sobic002G339250
Sobic006G123100--Sobic002G339250
Sobic001G463650--Sobic008G083650
Sobic001G102901
Sobic001G102901
Sobic001G463650--Sobic001G102901
Sobic001G463650--Sobic006G249800
Sobic001G463650--Sobic006G123100
Sobic001G463650--Sobic010G263101
Sobic009G024133
Sobic009G024133
Sobic001G463650--Sobic009G024133
Sobic001G463650--Sobic010G067950
Sobic001G463650--Sobic003G350000
Sobic001G037550
Sobic001G037550
Sobic001G463650--Sobic001G037550
Sobic003G350000--Sobic008G083650
Sobic003G350000--Sobic010G263101
Sobic003G350000--Sobic010G067950
Sobic003G350000--Sobic006G123100
Sobic010G275600
Sobic010G275600
Sobic003G350000--Sobic010G275600
Sobic003G350000--Sobic001G037550
Sobic007G206550
Sobic007G206550
Sobic003G350000--Sobic007G206550
Sobic003G350000--Sobic004G355401
Sobic003G350000--Sobic007G157550
Sobic001G457100
Sobic001G457100
Sobic004G355401--Sobic001G457100
Sobic004G355401--Sobic007G157550
Sobic004G347866
Sobic004G347866
Sobic004G355401--Sobic004G347866
Sobic004G355401--Sobic004G206900
Sobic004G355401--Sobic005G066800
Sobic004G355401--Sobic007G206550
Sobic009G223700
Sobic009G223700
Sobic004G355401--Sobic009G223700
Sobic006G169300
Sobic006G169300
Sobic004G355401--Sobic006G169300
Sobic004G355401--Sobic002G339250
Sobic002G367850--Sobic005G066800
Sobic003G265300
Sobic003G265300
Sobic002G367850--Sobic003G265300
Sobic002G367850--Sobic007G206550
Sobic002G367850--Sobic004G355401
Sobic001G391000
Sobic001G391000
Sobic002G367850--Sobic001G391000
Sobic002G367850--Sobic001G457100
Sobic004G295400
Sobic004G295400
Sobic002G367850--Sobic004G295400
Sobic002G367850--Sobic007G157550
Sobic002G367850--Sobic004G206900
Sobic010G067950--Sobic008G083650
Sobic010G067950--Sobic007G157550
Sobic010G067950--Sobic003G350000
Sobic010G067950--Sobic004G355401
Sobic010G067950--Sobic001G102901
Sobic010G067950--Sobic007G206550
Sobic010G067950--Sobic005G066800
Sobic010G067950--Sobic004G347866
Sobic010G067950--Sobic002G367850
Sobic010G263101--Sobic006G249800
Sobic010G263101--Sobic003G350000
Sobic010G263101--Sobic010G275600
Sobic010G263101--Sobic008G083650
Sobic010G263101--Sobic001G037550
Sobic010G263101--Sobic001G463650
Sobic010G263101--Sobic006G123100
Sobic010G263101--Sobic001G102901
Sobic010G263101--Sobic010G067950
Sobic007G157550--Sobic004G347866
Sobic002G048250
Sobic002G048250
Sobic007G157550--Sobic002G048250
Sobic007G157550--Sobic001G457100
Sobic004G089700
Sobic004G089700
Sobic007G157550--Sobic004G089700
Sobic007G183000
Sobic007G183000
Sobic007G157550--Sobic007G183000
Sobic007G157550--Sobic009G223700
Sobic001G179680
Sobic001G179680
Sobic007G157550--Sobic001G179680
Sobic007G157550--Sobic002G339250
Sobic004G226300
Sobic004G226300
Sobic007G157550--Sobic004G226300
Sobic005G066800--Sobic002G367850
Sobic005G066800--Sobic001G391000
Sobic005G066800--Sobic004G355401
Sobic005G066800--Sobic003G265300
Sobic002G202200
Sobic002G202200
Sobic005G066800--Sobic002G202200
Sobic005G066800--Sobic007G206550
Sobic005G066800--Sobic004G295400
Sobic005G066800--Sobic001G457100
Sobic005G066800--Sobic004G206900
Octagon: transcription factors