Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G067950.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VRU6
Pfam PF02475
Panther DB PTHR14741
NCBI CDD KOG2730; Methylase
KEGG Orthology K14292; trimethylguanosine synthase
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G30550 : S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g08800.1 : RNA cap guanine-N2 methyltransferase domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK19223 , KQK19222 , KQK19221 , KQK19226 , PNT76319
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G083650 - -
2 Sobic.007G157550 - -
3 Sobic.003G350000 pentatricopeptide, putative, expressed -
4 Sobic.004G355401 - -
5 Sobic.001G102901 - -
6 Sobic.007G206550 - -
7 Sobic.005G066800 - -
8 Sobic.004G347866 - -
9 Sobic.002G367850 - -
10 Sobic.001G391000 aspartic proteinase nepenthesin precursor, putative, expressed -
11 Sobic.001G457100 - -
12 Sobic.004G206900 expressed protein -
13 Sobic.002G339250 - -
14 Sobic.004G128800 FAD-binding and arabino-lactone oxidase domains containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.006G123100 "domain confirmed by Pfam database, expressed in leaf, stem and root, expression induced by IAA and ABA treatments"(PubMedID : 20528920)@ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed K05658: ABCB1, ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 1
16 Sobic.009G223700 - -
17 Sobic.001G463650 - -
18 Sobic.009G005800 formin-like protein 6 precursor, putative, expressed -
19 Sobic.008G119200 - -
20 Sobic.004G089700 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G067950 Sobic010G067950 Sobic008G083650 Sobic008G083650 Sobic010G067950--Sobic008G083650 Sobic007G157550 Sobic007G157550 Sobic010G067950--Sobic007G157550 Sobic003G350000 Sobic003G350000 Sobic010G067950--Sobic003G350000 Sobic004G355401 Sobic004G355401 Sobic010G067950--Sobic004G355401 Sobic001G102901 Sobic001G102901 Sobic010G067950--Sobic001G102901 Sobic007G206550 Sobic007G206550 Sobic010G067950--Sobic007G206550 Sobic005G066800 Sobic005G066800 Sobic010G067950--Sobic005G066800 Sobic004G347866 Sobic004G347866 Sobic010G067950--Sobic004G347866 Sobic002G367850 Sobic002G367850 Sobic010G067950--Sobic002G367850 Sobic006G123100 Sobic006G123100 Sobic008G083650--Sobic006G123100 Sobic001G463650 Sobic001G463650 Sobic008G083650--Sobic001G463650 Sobic008G083650--Sobic003G350000 Sobic008G083650--Sobic004G355401 Sobic008G083650--Sobic002G367850 Sobic008G083650--Sobic010G067950 Sobic010G263101 Sobic010G263101 Sobic008G083650--Sobic010G263101 Sobic008G083650--Sobic007G157550 Sobic008G083650--Sobic005G066800 Sobic007G157550--Sobic004G347866 Sobic002G048250 Sobic002G048250 Sobic007G157550--Sobic002G048250 Sobic001G457100 Sobic001G457100 Sobic007G157550--Sobic001G457100 Sobic004G089700 Sobic004G089700 Sobic007G157550--Sobic004G089700 Sobic007G183000 Sobic007G183000 Sobic007G157550--Sobic007G183000 Sobic009G223700 Sobic009G223700 Sobic007G157550--Sobic009G223700 Sobic001G179680 Sobic001G179680 Sobic007G157550--Sobic001G179680 Sobic002G339250 Sobic002G339250 Sobic007G157550--Sobic002G339250 Sobic004G226300 Sobic004G226300 Sobic007G157550--Sobic004G226300 Sobic003G350000--Sobic008G083650 Sobic003G350000--Sobic010G263101 Sobic003G350000--Sobic010G067950 Sobic003G350000--Sobic006G123100 Sobic010G275600 Sobic010G275600 Sobic003G350000--Sobic010G275600 Sobic001G037550 Sobic001G037550 Sobic003G350000--Sobic001G037550 Sobic003G350000--Sobic007G206550 Sobic003G350000--Sobic004G355401 Sobic003G350000--Sobic007G157550 Sobic004G355401--Sobic001G457100 Sobic004G355401--Sobic007G157550 Sobic004G355401--Sobic004G347866 Sobic004G206900 Sobic004G206900 Sobic004G355401--Sobic004G206900 Sobic004G355401--Sobic005G066800 Sobic004G355401--Sobic007G206550 Sobic004G355401--Sobic009G223700 Sobic006G169300 Sobic006G169300 Sobic004G355401--Sobic006G169300 Sobic004G355401--Sobic002G339250 Sobic001G102901--Sobic001G463650 Sobic001G102901--Sobic010G067950 Sobic001G102901--Sobic008G083650 Sobic006G249800 Sobic006G249800 Sobic001G102901--Sobic006G249800 Sobic001G102901--Sobic006G123100 Sobic001G102901--Sobic010G263101 Sobic009G024133 Sobic009G024133 Sobic001G102901--Sobic009G024133 Sobic001G102901--Sobic004G355401 Sobic001G102901--Sobic003G350000 Sobic007G206550--Sobic007G157550 Sobic007G206550--Sobic004G347866 Sobic007G206550--Sobic001G179680 Sobic007G206550--Sobic001G457100 Sobic007G206550--Sobic004G089700 Sobic007G206550--Sobic002G048250 Sobic007G206550--Sobic007G183000 Sobic007G206550--Sobic004G355401 Sobic004G224300 Sobic004G224300 Sobic007G206550--Sobic004G224300 Sobic005G066800--Sobic002G367850 Sobic001G391000 Sobic001G391000 Sobic005G066800--Sobic001G391000 Sobic005G066800--Sobic004G355401 Sobic003G265300 Sobic003G265300 Sobic005G066800--Sobic003G265300 Sobic002G202200 Sobic002G202200 Sobic005G066800--Sobic002G202200 Sobic005G066800--Sobic007G206550 Sobic004G295400 Sobic004G295400 Sobic005G066800--Sobic004G295400 Sobic005G066800--Sobic001G457100 Sobic005G066800--Sobic004G206900 Sobic004G347866--Sobic007G157550 Sobic004G347866--Sobic002G048250 Sobic004G347866--Sobic007G183000 Sobic004G347866--Sobic004G089700 Sobic004G347866--Sobic001G457100 Sobic004G347866--Sobic004G226300 Sobic004G347866--Sobic009G223700 Sobic001G527400 Sobic001G527400 Sobic004G347866--Sobic001G527400 Sobic004G347866--Sobic002G339250 Sobic002G367850--Sobic005G066800 Sobic002G367850--Sobic003G265300 Sobic002G367850--Sobic007G206550 Sobic002G367850--Sobic004G355401 Sobic002G367850--Sobic001G391000 Sobic002G367850--Sobic001G457100 Sobic002G367850--Sobic004G295400 Sobic002G367850--Sobic007G157550 Sobic002G367850--Sobic004G206900
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.