Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G005800.1
Synonym FH4, ATFH4, Sb09g000720
Functional annotation formin-like protein 6 precursor, putative, expressed
UniProt C5YY29
Pfam -
Panther DB PTHR23213 PTHR23213:SF239
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G24150 : formin homologue 4
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g50570.1 : retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a021976
Brachypodium KQK02006
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G231800 tropinone reductase, putative, expressed K08081: tropinone reductase I
2 Sobic.001G457100 - -
3 Sobic.004G347866 - -
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7 Sobic.007G183000 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
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14 Sobic.008G002100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein -
15 Sobic.002G339250 - -
16 Sobic.002G285525 - -
17 Sobic.009G223700 - -
18 Sobic.006G171000 Highest expression level in primordial inflorescence(PubMedID : 27501690)@OsSPL7 - SBP-box gene family member, expressed -
19 Sobic.003G173032 - -
20 Sobic.010G002850 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G005800 Sobic009G005800 Sobic005G231800 Sobic005G231800 Sobic009G005800--Sobic005G231800 Sobic001G457100 Sobic001G457100 Sobic009G005800--Sobic001G457100 Sobic004G347866 Sobic004G347866 Sobic009G005800--Sobic004G347866 Sobic004G089700 Sobic004G089700 Sobic009G005800--Sobic004G089700 Sobic002G048250 Sobic002G048250 Sobic009G005800--Sobic002G048250 Sobic004G226300 Sobic004G226300 Sobic009G005800--Sobic004G226300 Sobic007G183000 Sobic007G183000 Sobic009G005800--Sobic007G183000 Sobic002G010500 Sobic002G010500 Sobic009G005800--Sobic002G010500 Sobic008G119200 Sobic008G119200 Sobic009G005800--Sobic008G119200 Sobic008G023000 Sobic008G023000 Sobic005G231800--Sobic008G023000 Sobic001G527400 Sobic001G527400 Sobic005G231800--Sobic001G527400 Sobic008G002100 Sobic008G002100 Sobic005G231800--Sobic008G002100 Sobic005G231800--Sobic007G183000 Sobic005G231800--Sobic004G226300 Sobic005G209800 Sobic005G209800 Sobic005G231800--Sobic005G209800 Sobic005G231800--Sobic002G048250 Sobic003G173032 Sobic003G173032 Sobic005G231800--Sobic003G173032 Sobic006G171000 Sobic006G171000 Sobic005G231800--Sobic006G171000 Sobic009G223700 Sobic009G223700 Sobic001G457100--Sobic009G223700 Sobic001G457100--Sobic004G347866 Sobic001G457100--Sobic004G089700 Sobic001G457100--Sobic004G226300 Sobic001G457100--Sobic002G048250 Sobic001G457100--Sobic007G183000 Sobic007G157550 Sobic007G157550 Sobic001G457100--Sobic007G157550 Sobic001G457100--Sobic005G231800 Sobic003G290700 Sobic003G290700 Sobic001G457100--Sobic003G290700 Sobic004G347866--Sobic007G157550 Sobic004G347866--Sobic002G048250 Sobic004G347866--Sobic007G183000 Sobic004G347866--Sobic004G089700 Sobic004G347866--Sobic001G457100 Sobic004G347866--Sobic004G226300 Sobic004G347866--Sobic009G223700 Sobic004G347866--Sobic001G527400 Sobic002G339250 Sobic002G339250 Sobic004G347866--Sobic002G339250 Sobic004G089700--Sobic002G048250 Sobic004G089700--Sobic007G183000 Sobic004G089700--Sobic005G231800 Sobic004G089700--Sobic008G023000 Sobic004G089700--Sobic001G527400 Sobic004G089700--Sobic004G226300 Sobic004G089700--Sobic008G002100 Sobic004G089700--Sobic005G209800 Sobic004G089700--Sobic004G347866 Sobic002G048250--Sobic007G183000 Sobic002G048250--Sobic001G527400 Sobic002G048250--Sobic004G226300 Sobic002G048250--Sobic008G023000 Sobic002G048250--Sobic008G002100 Sobic002G048250--Sobic005G231800 Sobic002G048250--Sobic005G209800 Sobic002G048250--Sobic003G173032 Sobic004G224300 Sobic004G224300 Sobic002G048250--Sobic004G224300 Sobic004G226300--Sobic007G183000 Sobic004G226300--Sobic001G527400 Sobic004G226300--Sobic008G023000 Sobic004G226300--Sobic008G002100 Sobic004G226300--Sobic002G048250 Sobic004G226300--Sobic005G231800 Sobic004G226300--Sobic005G209800 Sobic004G226300--Sobic006G171000 Sobic004G226300--Sobic003G173032 Sobic007G183000--Sobic004G226300 Sobic007G183000--Sobic001G527400 Sobic007G183000--Sobic002G048250 Sobic007G183000--Sobic008G023000 Sobic007G183000--Sobic008G002100 Sobic007G183000--Sobic005G231800 Sobic007G183000--Sobic005G209800 Sobic007G183000--Sobic003G173032 Sobic007G183000--Sobic006G171000 Sobic002G010500--Sobic005G231800 Sobic002G010500--Sobic004G224300 Sobic002G010500--Sobic001G457100 Sobic002G010500--Sobic004G089700 Sobic002G010500--Sobic008G023000 Sobic002G010500--Sobic001G527400 Sobic003G337700 Sobic003G337700 Sobic002G010500--Sobic003G337700 Sobic002G010500--Sobic008G002100 Sobic002G010500--Sobic007G183000 Sobic008G119200--Sobic002G048250 Sobic008G119200--Sobic007G183000 Sobic008G119200--Sobic004G226300 Sobic008G119200--Sobic005G231800 Sobic008G119200--Sobic001G527400 Sobic002G285525 Sobic002G285525 Sobic008G119200--Sobic002G285525 Sobic008G119200--Sobic008G023000 Sobic008G119200--Sobic008G002100 Sobic008G119200--Sobic004G347866
Octagon: transcription factors


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